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雀形目15种鸟类CoI和Cyt b基因序列比较及伯劳属的系统发育

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第一部分 雀形目鸟类及其系统发育研究现状第11-19页
 1 雀形目概述第11-12页
   ·雀形目鸟类的形态及生态特征第11-12页
   ·雀形目鸟类的高阶元分类学现状第12页
 2 分子系统学方法第12-16页
   ·分子系统学概述第12-13页
   ·分子系统学研究方法第13-16页
     ·蛋白质电泳第13页
     ·限制性片段长度多多态性第13-14页
     ·扩增片断长度多态性第14页
     ·随机扩增多态性 DNA第14-15页
     ·核酸序列分析技术第15-16页
       ·鸟类线粒体 DNA的特点第15-16页
       ·鸟类分子系统学中常用的mtDNA分子标记第16页
 3 雀形目鸟类的系统发育研究现状第16-18页
 4 本文要解决的主要问题第18-19页
第二部分 实验方法第19-27页
 1 实验仪器、试剂第19-20页
   ·实验仪器第19页
   ·实验试剂第19-20页
 2 实验方法第20-22页
   ·总 DNA的提取第20页
   ·总 DNA的检测第20-21页
   ·目的基因片段的扩增和检测第21-22页
     ·扩增引物第21页
     ·PCR反应体系组成及扩增程序第21页
     ·扩增产物的检测第21页
     ·PCR产物的纯化及序列的测定第21-22页
 3 数据处理与分析第22-27页
   ·序列编辑、校对及序比对第22-23页
   ·序列组成分析第23页
   ·数据组系统发育信号第23-24页
     ·碱基替换饱和分析第23-24页
     ·PTP检验第24页
   ·数据集之间的可联合性分析第24页
   ·统发生树的构建第24-27页
     ·距离法建树第25页
     ·极大似然法建树第25页
     ·最大简约法建树第25页
     ·贝叶斯系统发育推论法建树第25-27页
第三部分 雀形目15种鸟类 CoI与 Cyt b基因序列的比较第27-38页
 1 材料和方法第27-29页
   ·材料第27页
   ·方法第27-29页
     ·总DNA的提取第27页
     ·PCR扩增第27-29页
     ·PCR扩增产物的纯化和测序第29页
   ·数据处理第29页
 2 结果和分析第29-36页
   ·DNA序列分析第30页
   ·种内、种间遗传距离分析第30-32页
   ·分子系统树的构建和分析第32-36页
 3 讨论第36-38页
第四部分 从 Cyt b和 CoI基因序列看伯劳属部分鸟类的分类地位与系统发生关系第38-49页
 1 材料与方法第38-41页
   ·材料第38-40页
   ·方法第40页
     ·总 DNA的提取第40页
     ·PCR扩增及序列第40页
     ·PCR扩增产物的纯化和测序第40页
   ·实验数据的处理第40-41页
 2 结果第41-47页
   ·所测 DNA序列第41页
   ·序列分析第41-43页
   ·分子系统树的重建第43-47页
 3 讨论第47-49页
   ·红背伯劳、红尾伯劳与荒漠伯劳的分类地位第47-48页
   ·棕背伯劳和灰背伯劳是一个物种还是两个独立的物种第48页
   ·棕背伯劳黑色型的分类地位第48-49页
总结第49-51页
参考文献第51-58页
附录 部分测序荧光峰图举例第58-62页
致谢第62-63页
攻读学位期间的研究成果第63页

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