| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 1 前言 | 第13-36页 |
| ·课题的提出 | 第13-14页 |
| ·文献综述 | 第14-35页 |
| ·随机DNA标记 | 第15-21页 |
| ·RFLP | 第15页 |
| ·RAPD | 第15-16页 |
| ·AFLP | 第16页 |
| ·ISSR | 第16-17页 |
| ·SSR | 第17-21页 |
| ·基因靶向标记 | 第21-33页 |
| ·cDNA-RFLP | 第21-22页 |
| ·cDNA-AFLP | 第22页 |
| ·EST-SSR | 第22-31页 |
| ·EST-SNP | 第31-32页 |
| ·ESTP | 第32页 |
| ·Indel | 第32页 |
| ·COS | 第32-33页 |
| ·ACGM | 第33页 |
| ·GST | 第33页 |
| ·功能标记 | 第33-35页 |
| ·研究的目的和内容 | 第35-36页 |
| 2. 材料与方法 | 第36-41页 |
| ·Cucumis属EST和基因序列的获得 | 第36页 |
| ·EST和基因序列的组装 | 第36页 |
| ·EST-SSR位点的搜寻 | 第36页 |
| ·Unigene上ORF的确定 | 第36页 |
| ·EST-SSR引物设计 | 第36-37页 |
| ·EST-SSR功能注释 | 第37页 |
| ·EST-SSR多态性评价 | 第37-39页 |
| ·植物材料 | 第37页 |
| ·DNA的提取 | 第37-38页 |
| ·PCR扩增 | 第38-39页 |
| ·电泳检测 | 第39页 |
| ·数据处理 | 第39-41页 |
| ·EST-SSR的特征参数 | 第39页 |
| ·EST-SSR用于系统发生关系的分析 | 第39-41页 |
| ·多态性信息含量 | 第39页 |
| ·聚类分析 | 第39页 |
| ·聚类分析的非参数检验 | 第39-40页 |
| ·主坐标分析 | 第40-41页 |
| 3 结果与分析 | 第41-86页 |
| ·Cucumis属EST-SSR的鉴定 | 第41-56页 |
| ·EST序列的获得和组装 | 第41-42页 |
| ·EST-SSR的发生频率 | 第42-43页 |
| ·EST-SSR重复基序长度分布 | 第43-46页 |
| ·EST-SSR不同重复基序类型的分布 | 第46-48页 |
| ·EST-SSR位点序列长度的分布 | 第48页 |
| ·EST-SSR基序重复次数的分布 | 第48-51页 |
| ·SSR在Unigene上的分布 | 第51-52页 |
| ·不同长度的重复基序在Unigene上的分布 | 第52-56页 |
| ·EST-SSR标记的开发 | 第56-76页 |
| ·EST-SSR引物设计 | 第56-57页 |
| ·EST-SSR多态性评价 | 第57-75页 |
| ·无扩增产物的引物对 | 第57-59页 |
| ·非特异性扩增的引物对 | 第59页 |
| ·有特异性扩增产物但无多态性的引物对 | 第59-60页 |
| ·具有多态性的EST-SSR引物对 | 第60-75页 |
| ·EST-SSR标记的功能注释 | 第75-76页 |
| ·EST-SSR标记在种质系统发生关系研究中的应用 | 第76-86页 |
| ·EST-SSR标记的多态性信息含量(PIC) | 第76-77页 |
| ·EST-SSR标记对黄瓜系统发生关系的评价 | 第77-82页 |
| ·黄瓜种质的聚类分析 | 第77-79页 |
| ·黄瓜种质的主坐标分析 | 第79-82页 |
| ·EST-SSR标记对甜瓜种质系统发生关系的评价 | 第82-86页 |
| ·甜瓜种质的聚类分析 | 第82-83页 |
| ·甜瓜种质的主坐标分析 | 第83-86页 |
| 4 讨论 | 第86-94页 |
| ·SSR在基因组上的分布特征及进化机制 | 第86-90页 |
| ·SSR的分布特征 | 第86-87页 |
| ·移码突变的选择压力 | 第87-88页 |
| ·SSR位点的长度与突变方向 | 第88-89页 |
| ·SSR的功能 | 第89-90页 |
| ·EST序列数据库的利用 | 第90-91页 |
| ·Cucumis属EST-SSR标记和基因组SSR标记的比较 | 第91-93页 |
| ·SSR的类型和发生频率 | 第91-92页 |
| ·SSR的多态性比率 | 第92页 |
| ·SSR的多态性 | 第92页 |
| ·SSR的可转移性 | 第92-93页 |
| ·Cucumis属EST-SSR标记同其它分子标记的比较 | 第93-94页 |
| 5 主要结论 | 第94-95页 |
| 参考文献 | 第95-110页 |
| 附录 | 第110-114页 |
| 附录1 CTAB法提取基因组DNA | 第110页 |
| 附录2 变性胶的制备及电泳 | 第110-111页 |
| 附录3 变性胶银染染色 | 第111-112页 |
| 附录4 8%非变性PAGE胶制备及染色 | 第112-113页 |
| 附录5 论文发表 | 第113-114页 |
| 致谢 | 第114页 |
