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大肠杆菌亮氨酰-tRNA合成酶编校结构域和其与蛋氨酸和异亮氨酸复合物晶体结构的研究

1. 引言第1-29页
   ·X 射线晶体学方法测定生物大分子的三维结构第9-10页
   ·氨基酰-tRNA 合成酶概况第10-17页
   ·氨基酰-tRNA 合成酶Ia 亚家族概况第17页
   ·氨基酰-tRNA 合成酶Ia 亚家族的晶体结构第17-21页
   ·氨基酰-tRNA 合成酶的高度保真性要求第21-22页
   ·底物的选择性“双筛选”模型第22-24页
   ·转移前编校通路和转移后编校通路第24-29页
2. 材料和方法第29-37页
   ·材料和试剂第29-30页
     ·常用试剂和材料第29页
     ·菌株第29页
     ·仪器第29-30页
   ·方法第30-37页
     ·克隆、表达载体和菌株构建第30页
     ·ecLeuRS-ED基因的蛋白质表达、纯化和检测第30-31页
     ·溶液中蛋白质质分子尺寸和聚集状态分析第31页
     ·晶体生长-悬滴气相扩散法第31-32页
     ·X-射线晶体衍射和数据处理第32页
     ·结构解析第32-36页
     ·ecLeuRS-ED-tRNA 复合物模型的构建第36-37页
3. 结果第37-55页
   ·一系列LeuRS 截短体和突变体的构建、表达、纯化和结晶第37-41页
   ·ecLeuRS-ED 底物复合物共晶实验结果第41页
   ·ecLeuRS-ED 的整体三维晶体结构第41-45页
   ·包含Ala293 的肽段区域观察到较大构像变化第45-47页
   ·包含 Ty1330 的肽段区域观察到较大构像变化第47-49页
   ·ecLeuRS-ED 与底物Met 的复合物晶体结构第49-52页
   ·ecLeuRS-ED 与底物Ile 的复合物晶体结构第52-55页
4. 讨论第55-72页
   ·包含 Ala293 和 Ty1330 的肽段区域可能在编校反应中参与tRNA结合第55-60页
   ·氨基酸识别的锁钥机制第60-61页
   ·底物主链构像锁定的机制第61页
   ·底物支链特异性区分的机制第61-62页
   ·催化进攻的可能机理第62-66页
   ·ecLeuRS 底物编校机理总结第66-68页
   ·氨基酰-tRNA 合成酶Ia 亚家族的编校结构域共有一个保守的结构第68-72页
5. 结论第72-73页
参考文献第73-81页
附表第81-84页
发表文章目录第84-85页
致谢第85页

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