1. 引言 | 第1-29页 |
·X 射线晶体学方法测定生物大分子的三维结构 | 第9-10页 |
·氨基酰-tRNA 合成酶概况 | 第10-17页 |
·氨基酰-tRNA 合成酶Ia 亚家族概况 | 第17页 |
·氨基酰-tRNA 合成酶Ia 亚家族的晶体结构 | 第17-21页 |
·氨基酰-tRNA 合成酶的高度保真性要求 | 第21-22页 |
·底物的选择性“双筛选”模型 | 第22-24页 |
·转移前编校通路和转移后编校通路 | 第24-29页 |
2. 材料和方法 | 第29-37页 |
·材料和试剂 | 第29-30页 |
·常用试剂和材料 | 第29页 |
·菌株 | 第29页 |
·仪器 | 第29-30页 |
·方法 | 第30-37页 |
·克隆、表达载体和菌株构建 | 第30页 |
·ecLeuRS-ED基因的蛋白质表达、纯化和检测 | 第30-31页 |
·溶液中蛋白质质分子尺寸和聚集状态分析 | 第31页 |
·晶体生长-悬滴气相扩散法 | 第31-32页 |
·X-射线晶体衍射和数据处理 | 第32页 |
·结构解析 | 第32-36页 |
·ecLeuRS-ED-tRNA 复合物模型的构建 | 第36-37页 |
3. 结果 | 第37-55页 |
·一系列LeuRS 截短体和突变体的构建、表达、纯化和结晶 | 第37-41页 |
·ecLeuRS-ED 底物复合物共晶实验结果 | 第41页 |
·ecLeuRS-ED 的整体三维晶体结构 | 第41-45页 |
·包含Ala293 的肽段区域观察到较大构像变化 | 第45-47页 |
·包含 Ty1330 的肽段区域观察到较大构像变化 | 第47-49页 |
·ecLeuRS-ED 与底物Met 的复合物晶体结构 | 第49-52页 |
·ecLeuRS-ED 与底物Ile 的复合物晶体结构 | 第52-55页 |
4. 讨论 | 第55-72页 |
·包含 Ala293 和 Ty1330 的肽段区域可能在编校反应中参与tRNA结合 | 第55-60页 |
·氨基酸识别的锁钥机制 | 第60-61页 |
·底物主链构像锁定的机制 | 第61页 |
·底物支链特异性区分的机制 | 第61-62页 |
·催化进攻的可能机理 | 第62-66页 |
·ecLeuRS 底物编校机理总结 | 第66-68页 |
·氨基酰-tRNA 合成酶Ia 亚家族的编校结构域共有一个保守的结构 | 第68-72页 |
5. 结论 | 第72-73页 |
参考文献 | 第73-81页 |
附表 | 第81-84页 |
发表文章目录 | 第84-85页 |
致谢 | 第85页 |