| 中文摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-50页 |
| 1 褐飞虱研究概况 | 第14-22页 |
| ·形态特征及生长环境 | 第15页 |
| ·褐飞虱的迁飞 | 第15-16页 |
| ·褐飞虱的生物型 | 第16-17页 |
| ·褐飞虱的危害 | 第17-18页 |
| ·褐飞虱的防治与育种 | 第18-22页 |
| 2 水稻抗褐飞虱的研究 | 第22-49页 |
| ·抗性类型 | 第22-23页 |
| ·作物抗虫性的机制 | 第23-35页 |
| ·排趋性、抗生性和耐害性 | 第23-24页 |
| ·直接防御和间接防御 | 第24-26页 |
| ·植物抗病的遗传基础--基因对基因(gene-for-gene)假说 | 第26-28页 |
| ·植物抗病的分子基础--已经克隆的植物抗病基因的结构特点 | 第28-31页 |
| ·植物抗虫反应的信号传导途径--诱导的直接防御机制 | 第31-33页 |
| ·植物与昆虫互作中的间接防御 | 第33-35页 |
| ·抗褐飞虱表现型鉴定方法 | 第35-37页 |
| ·植物未知产物基因克隆的方法 | 第37-43页 |
| ·图位克隆法(map-based cloning) | 第37-41页 |
| ·蛋白激酶基因Pto的研究进展 | 第38-40页 |
| ·应用图位法克隆QTLs基因的进展 | 第40-41页 |
| ·转座子标签法(transposon tagging) | 第41-42页 |
| ·同源序列法 | 第42页 |
| ·功能基因组学中的新方法 | 第42-43页 |
| ·大片段基因组文库的发展 | 第43-46页 |
| ·水稻抗褐飞虱基因的研究进展 | 第46-49页 |
| 3 本研究的目的意义 | 第49-50页 |
| 第二章 抗褐飞虱水稻品种B5基因组文库的构建和覆盖第三染色体褐飞虱抗性位点QBP1的物理图谱的构建 | 第50-77页 |
| 1 材料和方法 | 第50-60页 |
| ·材料 | 第50-52页 |
| ·方法 | 第52-60页 |
| ·载体的抽提、纯化和制备 | 第52-53页 |
| ·植物基因组大插入片段的制备 | 第53-57页 |
| ·水稻叶片细胞核的抽提和包埋 | 第53-55页 |
| ·细胞核的小量酶切确定最适宜的部分酶切条件 | 第55页 |
| ·水稻基因组大插入片段的制备 | 第55-57页 |
| ·连接和电转化 | 第57-58页 |
| ·连接反应 | 第57页 |
| ·电转化 | 第57-58页 |
| ·转化子的鉴定和文库的生成 | 第58页 |
| ·克隆稳定性的检测 | 第58页 |
| ·基因组文库高密度点阵膜的制备 | 第58-60页 |
| ·阳性克隆的筛选(文库膜的杂交) | 第60页 |
| 2 结果 | 第60-72页 |
| ·基因组细胞核的包埋 | 第60-61页 |
| ·确定合适的部分酶切条件 | 第61-62页 |
| ·脉冲电泳回收基因组片段 | 第62-64页 |
| ·连接和电转化 | 第64-65页 |
| ·文库质量的检测 | 第65-68页 |
| ·文库平均插入片段的检测 | 第65页 |
| ·文库对基因组的覆盖率 | 第65-67页 |
| ·载体pCLD04541中克隆子的稳定性 | 第67-68页 |
| ·以B5文库构建覆盖第三染色体抗褐飞虱位点Qbp1的物理图谱 | 第68-72页 |
| ·B5中第三染色体抗性位点Qbp1的定位研究情况 | 第68页 |
| ·以B5文库构建覆盖第三染色体抗褐飞虱位点Qbp1的物理图谱 | 第68-72页 |
| 3 讨论 | 第72-77页 |
| ·构建B5文库的出发点 | 第72-74页 |
| ·后基因组时代的基因组文库构建 | 第74-75页 |
| ·野生资源中有利基因的利用 | 第75-77页 |
| 第三章 QBP1的精细定位 | 第77-100页 |
| 1 材料和方法 | 第77-81页 |
| ·材料 | 第77页 |
| ·方法 | 第77-81页 |
| ·两个选系回交群体的构建 | 第77-78页 |
| ·褐飞虱抗性鉴定 | 第78-79页 |
| ·SSR标记的设计 | 第79-80页 |
| ·RFLP标记7S的克隆及杂交分析 | 第80页 |
| ·SSR实验方法 | 第80-81页 |
| 2 结果 | 第81-96页 |
| ·SSR标记的设计 | 第81-83页 |
| ·RFLP标记7S的克隆及应用 | 第83-85页 |
| ·生物信息学对Qbp1所在R1925-G1318区段的分子标记进行物理定位 | 第85页 |
| ·用MH63／B5的重组自交系对Qbp1区段增加的SSR标记和RFLP进行遗传定位 | 第85-86页 |
| ·对MH63／B5重组自交系中的极端单株进行重组事件分析的结果 | 第86-88页 |
| ·以较远端标记筛选选系回交群体的结果 | 第88-89页 |
| ·用于构建选系回交群体的两个MH63／B5重组自交系家系的特点 | 第88页 |
| ·筛选结果 | 第88-89页 |
| ·选系回交群体中重组单株在Qbp1区段的分子标记分析 | 第89-90页 |
| ·选系回交群体中重组单株的褐飞虱抗性鉴定 | 第90-94页 |
| ·应用重组单株对Qbp1进行精细定位的结果 | 第94-96页 |
| 3 讨论 | 第96-100页 |
| ·对褐飞虱抗性鉴定方法的讨论 | 第96-97页 |
| ·关于用远端标记进行重组单株筛选的讨论 | 第97-98页 |
| ·关于数量性状基因中单个位点的精细定位的讨论 | 第98-100页 |
| 第四章 SG1-SG9区段内几个基因的表达分析 | 第100-121页 |
| 1 材料和方法 | 第100-102页 |
| ·材料 | 第100页 |
| ·方法 | 第100-102页 |
| ·RNA的抽提 | 第100页 |
| ·mRNA的抽提 | 第100页 |
| ·逆转录获得cDNA | 第100页 |
| ·RT-PCR | 第100-101页 |
| ·Northern转膜及杂交 | 第101页 |
| ·基因组序列的测定 | 第101-102页 |
| ·载体的构建 | 第102页 |
| 2 结果 | 第102-118页 |
| ·SG1-SG9区段的基因预测分析 | 第102-103页 |
| ·SG1-SG9区段5个预测基因的表达分析 | 第103-105页 |
| ·基因G109--一个编码蛋白激酶的基因的可能性分析 | 第105-111页 |
| ·基因G109的生物信息学分析 | 第106页 |
| ·基因G109同Ptil基因及Pto基因同源性的分析 | 第106-108页 |
| ·基因G109在不同品种中的序列比较分析 | 第108-111页 |
| ·基因G109的基因组片段载体的构建 | 第111-112页 |
| ·基因G109 RNAi载体的构建 | 第112-114页 |
| ·日本晴克隆OSJNB0032G11的基因预测分析 | 第114-118页 |
| 3 讨论 | 第118-121页 |
| ·关于植物中抗虫候选基因的确定 | 第118-119页 |
| ·关于水稻中相应的Ptil基因的研究 | 第119-121页 |
| 参考文献 | 第121-131页 |
| 附录Ⅰ | 第131-135页 |
| 附录Ⅱ 实验室常用PROTOCOL | 第135-141页 |
| Protocol 1: 探针标记 | 第135页 |
| Protocol 2: Southern杂交 | 第135-136页 |
| Protocol 3: 洗膜，压片及膜的再生 | 第136-137页 |
| Protocol 4: PAGE胶操作流程及试剂 | 第137-138页 |
| Protocol 5: CTAB法抽提植物大样DNA(以水稻为例) | 第138-139页 |
| Protocol 6: CTAB法抽取植物小样DNA(以水稻为例) | 第139页 |
| Protocol 7: RNA抽提和纯化 | 第139-140页 |
| Protocol 8: 逆转录合成cDNA | 第140-141页 |
| 附录Ⅲ | 第141-142页 |
| 在读期间发表文章 | 第142-143页 |
| 致谢 | 第143页 |
