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基于COI与Cytb基因序列的班腿蝗科部分种类的分子系统学研究

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
第1章 前言第10-20页
   ·斑腿蝗科概述第10页
   ·中国斑腿蝗科研究概况第10-13页
     ·传统分类第10-11页
     ·支序分类第11页
     ·内部构造和超微结构第11页
     ·细胞分类学研究第11-12页
     ·分子系统学方面第12-13页
     ·其他方面第13页
   ·线粒体基因组及基因在分子系统学中的应用第13-16页
     ·动物线粒体基因组组成特点第13页
     ·动物线粒体基因组结构特点第13-14页
     ·线粒体基因在系统发育中的应用第14页
     ·Cytb在系统学中的应用情况第14-15页
     ·COI条形码在系统学中的应用第15-16页
   ·昆虫分子系统学和进化第16-18页
     ·分子系统学和分子进化第16页
     ·分子系统学和进化研究中的一些基本论点第16-17页
     ·昆虫分子系统学研究方法第17-18页
   ·研究的目的和意义第18-20页
第2章 材料与方法第20-26页
   ·实验材料第20-21页
   ·仪器和试剂第21-22页
     ·实验仪器第21页
     ·实验试剂第21-22页
   ·实验方法第22-26页
     ·总DNA提取第22-24页
     ·PCR扩增第24-26页
第3章 结果分析第26-54页
   ·基因组总DNA的提取、PCR扩增及序列的测定第26页
     ·总DNA提取第26页
     ·PCR扩增第26页
     ·PCR产物测序第26页
   ·序列编辑和序列比对结果第26-29页
     ·序列编辑第26-27页
     ·序列比对与组成分析第27-29页
   ·密码子使用频率与氨基酸组成分析第29-30页
   ·分类单元间碱基频率的检验第30页
   ·各数据组未校正的P距离第30-32页
   ·数据组系统发育信号检验第32-38页
     ·碱基替换饱和性分析第32-33页
     ·随机树长分布分析(g 1 test)第33-37页
     ·PTP(permutation tail probability test)检验第37-38页
   ·建树第38-54页
     ·简约法建树第38-41页
     ·各数据降权MP建树第41-44页
     ·距离法建树第44-46页
     ·最大似然法建树第46-49页
     ·贝叶斯法建树第49-52页
     ·四种方法所建树的KH检验(Kisino-Hasegawa test)第52-54页
第4章 讨论第54-58页
   ·数据的获得及评估第54页
   ·四种方法所建树的比较第54-55页
     ·COI基因四种方法构建树的比较第54页
     ·Cytb基因四种方法构建树的比较第54-55页
     ·联合数据集四种方法建树的比较第55页
   ·争议种属的系统发生关系分析第55-58页
     ·相似种属的区分第55-56页
     ·华秃蝗属与小蹦蝗属的系统发生关系第56页
     ·卵翅蝗亚科的系统发生关第56-58页
第5章 总结第58-60页
参考文献第60-66页
附录1第66-67页
附录2第67-68页
附录3第68-69页
附录4第69-70页
附录5第70-71页
附录6第71-72页
附录7第72-73页
附录8第73-74页
附录9第74-75页
附录10第75-76页
致谢第76-77页
攻读硕士期间发表的论文第77页

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