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牛病毒性腹泻病毒JZ05-1株基因分型、全基因序列测定及分析

摘要第1-7页
Abstract第7-14页
第一章 绪论第14-29页
   ·病原学第14-16页
     ·研究历史第14页
     ·分类地位及分型第14-16页
     ·一般生物学特性第16页
   ·分子生物学研究第16-21页
     ·病毒粒子结构组成及功能第16-17页
     ·病毒复制周期及蛋白裂解过程第17-18页
     ·致细胞病变及免疫逃逸机制第18-20页
     ·亚基因组第20页
     ·展望第20-21页
   ·流行病学第21-22页
     ·宿主及流行状况第21页
     ·传播第21-22页
     ·临床表现第22页
   ·抗原分布及发病机制第22-25页
     ·抗原分布第22-23页
     ·急性感染的发病机理第23页
     ·子宫内感染的发病机理第23-24页
     ·粘膜病及慢性粘膜病的发病机理第24-25页
   ·BVDV 检测第25-26页
     ·检测方法第25页
     ·急性感染第25页
     ·持续性感染第25-26页
     ·畜群筛查第26页
   ·预治及疫苗第26-28页
     ·预防治疗第26-27页
     ·疫苗第27-28页
   ·本研究的目的和意义第28-29页
第二章 病毒培养、荧光抗体及 RT-PCR 分型鉴定第29-34页
   ·材料与方法第29-30页
     ·病毒、细胞及试剂仪器第29页
     ·病毒培养第29页
     ·荧光抗体鉴定第29-30页
     ·RNA 提取及 RT-PCR第30页
   ·试验结果第30-33页
     ·病毒培养特性第30页
     ·荧光抗体鉴定第30页
     ·基因型鉴定第30-33页
   ·讨论第33-34页
第三章 反转录及3’-末端克隆测序方法研究第34-39页
   ·材料和方法第34-37页
     ·毒株与材料第34页
     ·病毒培养及RNA 提取第34-35页
     ·引物设计第35页
     ·RT-PCR、产物克隆及测序第35-37页
   ·试验结果第37-38页
     ·C 片段扩增及cDNA 模板比较第37-38页
     ·P7 片段扩增及测序第38页
   ·讨论第38-39页
第四章 BVDV JZ05-1 分离株全基因测序第39-45页
   ·材料和方法第39-41页
     ·毒株与材料第39页
     ·病毒培养第39-40页
     ·引物设计第40页
     ·病毒RNA 提取以及RT-PCR 扩增第40-41页
     ·扩增片段克隆测序及全基因序列拼接第41页
   ·试验结果第41-43页
     ·基因组片断RT-PCR 扩增第41页
     ·PCR 产物克隆、测序及拼接第41-43页
   ·讨论第43-45页
第五章 BVDV JZ05-1 分离株基因组序列分析第45-53页
   ·材料与方法第45-46页
     ·BVDV 基因组序列及生物信息学软件第45页
     ·基因型以及系统发育树分析第45-46页
     ·非编码区RNA 二级结构预测第46页
     ·结构蛋白编码区突变分析第46页
     ·同源建模及蛋白突变分析第46页
   ·结果第46-49页
     ·基因型以及系统发育树分析第46-47页
     ·非编码区RNA 二级结构第47-49页
     ·结构蛋白编码区序列突变第49页
     ·RdRp 同源建模第49页
   ·讨论第49-53页
第六章 全文结论第53-54页
参考文献第54-62页
致谢第62-63页
附录第63-65页
作者简历第65页

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