基于HMM的蛋白质侧链建模及其应用的研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一章 引言 | 第10-16页 |
| ·课题背景 | 第10-12页 |
| ·研究现状 | 第12-13页 |
| ·课题内容 | 第13-14页 |
| ·研究意义 | 第14-15页 |
| ·本文的组织结构 | 第15-16页 |
| 第二章 蛋白质侧链建模概述 | 第16-28页 |
| ·蛋白质结构介绍 | 第16-24页 |
| ·氨基酸和肽链的表示 | 第16-19页 |
| ·蛋白质侧链结构及其表示 | 第19-22页 |
| ·蛋白质骨架及其侧链 | 第22-24页 |
| ·侧链建模简介 | 第24-26页 |
| ·HMM简介 | 第26-27页 |
| ·本章小结 | 第27-28页 |
| 第三章 基于HMM 的蛋白质侧链建模 | 第28-42页 |
| ·模型选择 | 第28-29页 |
| ·训练集的选择与处理 | 第29-30页 |
| ·测试集的选择与处理 | 第30-31页 |
| ·模型训练和采样 | 第31-36页 |
| ·模型概述 | 第31-34页 |
| ·BIC打分函数 | 第34页 |
| ·采样过程 | 第34-36页 |
| ·模型评价 | 第36-39页 |
| ·与天然结构侧链的聚集度比较 | 第36-37页 |
| ·旋转异构体库比较 | 第37-38页 |
| ·实验小结 | 第38-39页 |
| ·本章小结 | 第39-42页 |
| 第四章 基于蛋白质侧链建模的侧链预测 | 第42-52页 |
| ·侧链预测平台 | 第42-43页 |
| ·旋转异构体库生成 | 第43-44页 |
| ·侧链预测结果 | 第44-50页 |
| ·蛋白质侧链构象预测结果 | 第44-46页 |
| ·氨基酸侧链预测结果 | 第46-48页 |
| ·综合比较 | 第48页 |
| ·实验小结 | 第48-50页 |
| ·本章小结 | 第50-52页 |
| 第五章 总结与展望 | 第52-54页 |
| ·工作总结 | 第52-53页 |
| ·研究展望 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-59页 |
| 发表文章目录及科研项目 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
