| 摘要 | 第8-9页 |
| Abstract | 第9页 |
| 缩略语表 | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第12-28页 |
| 1.1 生物固氮 | 第12-15页 |
| 1.1.1 自然界中的氮循环 | 第12-13页 |
| 1.1.2 氮肥施用情况 | 第13-14页 |
| 1.1.3 生物固氮的意义 | 第14页 |
| 1.1.4 生物固氮的种类 | 第14-15页 |
| 1.2 微生物与植物的共生作用 | 第15-18页 |
| 1.2.1 菌根共生 | 第15-16页 |
| 1.2.2 根瘤共生 | 第16页 |
| 1.2.3 根瘤菌入侵与根瘤形成 | 第16-18页 |
| 1.3 共生信号转导途径 | 第18-21页 |
| 1.3.1 共同共生途径CSP | 第19页 |
| 1.3.2 百脉根组氨酸激酶LHK1 | 第19-20页 |
| 1.3.3 结瘤信号通道蛋白NSP1/NSP2 | 第20-21页 |
| 1.3.4 结瘤起始蛋白NIN | 第21页 |
| 1.4 共生功能的转移 | 第21-23页 |
| 1.4.1 菌根共生与根瘤共生的联系 | 第21-22页 |
| 1.4.2 水稻中的共生相关基因 | 第22-23页 |
| 1.4.3 根瘤菌对部分作物的侵染方式 | 第23页 |
| 1.5 课题前期工作及结果 | 第23-26页 |
| 1.5.1 根瘤菌对水稻根尖的入侵 | 第24-25页 |
| 1.5.2 根瘤菌对水稻侧根发育的影响 | 第25-26页 |
| 1.6 研究目的与意义 | 第26-28页 |
| 2 材料与方法 | 第28-41页 |
| 2.1 主要实验材料 | 第28页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第28页 |
| 2.1.2 菌株与质粒 | 第28页 |
| 2.1.3 主要试剂和仪器 | 第28页 |
| 2.2 方法 | 第28-35页 |
| 2.2.1 载体构建及水稻愈伤转化 | 第28-29页 |
| 2.2.2 植物总基因组DNA抽提 | 第29页 |
| 2.2.3 PCR鉴定 | 第29页 |
| 2.2.4 凝胶回收 | 第29-30页 |
| 2.2.5 植物总RNA抽提 | 第30-31页 |
| 2.2.6 反转录反应 | 第31-32页 |
| 2.2.7 PCR鉴定 | 第32页 |
| 2.2.8 Southernblot前质粒抽提 | 第32页 |
| 2.2.9 Southernblot前水稻叶片高质量DNA抽提 | 第32-33页 |
| 2.2.10 地高辛标记Southernblot | 第33-35页 |
| 2.2.11 PCR鉴定纯合体 | 第35页 |
| 2.3 根瘤菌接种转化植株 | 第35页 |
| 2.3.1 根瘤菌入侵现象统计 | 第35页 |
| 2.3.2 根尖侧根统计 | 第35页 |
| 2.4 水稻cDNA芯片检测转录组变化 | 第35-37页 |
| 2.4.1 芯片材料的准备 | 第35-36页 |
| 2.4.2 芯片杂交实验设计 | 第36页 |
| 2.4.3 Real-timePCR检测芯片数据有效性 | 第36-37页 |
| 2.5 常用试剂及培养基 | 第37-41页 |
| 3 结果与分析 | 第41-55页 |
| 3.1 转基因水稻的鉴定及单拷贝纯合体的筛选 | 第41-44页 |
| 3.1.1 转基因水稻的鉴定 | 第41-42页 |
| 3.1.2 Southernblot检测转基因水稻拷贝数 | 第42-44页 |
| 3.1.3 PCR鉴定筛选转基因水稻纯合体 | 第44页 |
| 3.2 根瘤菌侵染的微室盆栽实验 | 第44-45页 |
| 3.3 cDNA芯片检测转入基因对水稻转录组的影响 | 第45-55页 |
| 3.3.1 芯片数据的有效性 | 第45-46页 |
| 3.3.2 差异表达基因总体特征 | 第46-47页 |
| 3.3.3 差异基因功能和代谢途径注释 | 第47-52页 |
| 3.3.4 植物激素信号转导途径中相关基因表达的改变 | 第52-53页 |
| 3.3.5 植物防御反应相关的基因表达重排 | 第53-55页 |
| 4 讨论 | 第55-57页 |
| 4.1 总结与讨论 | 第55-56页 |
| 4.2 展望 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-63页 |
| 附录：本研究所用引物 | 第63-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
