| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 前言 | 第10-27页 |
| 1.1 植物耐盐性的研究 | 第10-18页 |
| 1.1.1 盐胁迫对植物的危害 | 第10-11页 |
| 1.1.2 调节植物耐盐机制的基因 | 第11-18页 |
| 1.2 甜菜M14品系简介 | 第18-19页 |
| 1.2.1 甜菜M14品系获得与研究进展 | 第18页 |
| 1.2.2 甜菜M14品系耐盐机制的探索 | 第18-19页 |
| 1.3 转录组学及其在植物耐盐研究中的应用 | 第19-20页 |
| 1.4 测序技术的研究进展 | 第20-25页 |
| 1.4.1 测序技术的比较 | 第20-22页 |
| 1.4.2 利用新一代测序技术对甜菜全基因组测序 | 第22-23页 |
| 1.4.3 无参考基因组的植物转录组测序 | 第23-25页 |
| 1.5 本研究的目的与意义 | 第25-26页 |
| 1.6 本研究的技术路线 | 第26-27页 |
| 第2章 材料与方法 | 第27-37页 |
| 2.1 试验材料 | 第27-31页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第27页 |
| 2.1.2 主要试验试剂 | 第27页 |
| 2.1.3 主要实验仪器 | 第27-28页 |
| 2.1.4 数据材料 | 第28页 |
| 2.1.5 试验所需引物 | 第28-31页 |
| 2.2 试验方法 | 第31-37页 |
| 2.2.1 植物材料的种植和NaC1处理 | 第31-32页 |
| 2.2.2 甜菜M14品系总RNA样品的提取与制备 | 第32-33页 |
| 2.2.3 测序文库的构建 | 第33-34页 |
| 2.2.4 IllUminaHiseq2000上机测序 | 第34页 |
| 2.2.5 序列组装与功能注释 | 第34-35页 |
| 2.2.6 基因表达丰度的计算 | 第35页 |
| 2.2.7 Real-timePCR对转录组数据表达量的验证 | 第35-37页 |
| 第3章 结果与分析 | 第37-76页 |
| 3.1 甜菜M14品系RNA样品制备的质量检测 | 第37-40页 |
| 3.1.1 盐胁迫下甜菜M14品系的生长状况正文 | 第37-38页 |
| 3.1.2 甜菜M14品系叶片与根部总RNA的提取 | 第38-39页 |
| 3.1.3 甜菜M14品系测序前RNA检测 | 第39-40页 |
| 3.2 甜菜M14品系“参考转录组”文库和“表达谱”文库的制备 | 第40页 |
| 3.3 甜菜M14品系“参考转录组”的序列组装 | 第40-42页 |
| 3.4 甜菜M14品系“参考转录组”数据库的生物信息学分析 | 第42-48页 |
| 3.4.1 甜菜M14品系“参考转录组”Unigenes的Nr和Swissport功能注释 | 第43页 |
| 3.4.2 甜菜M14品系“参考转录组”Unigenes的GO功能注释 | 第43-46页 |
| 3.4.3 甜菜M14品系“参考转录组”Unigenes的COG功能注释 | 第46-48页 |
| 3.4.4 甜菜M14品系“参考转录组”Unigenes的KEGGPathway注释 | 第48页 |
| 3.5 盐胁迫下甜菜M14品系“表达谱”数据库的获得 | 第48-49页 |
| 3.6 盐胁迫下甜菜M14品系“表达谱”Unigenes的功能注释 | 第49页 |
| 3.7 盐胁迫下甜菜M14品系“表达谱”数据库差异表达基因的筛选 | 第49-50页 |
| 3.8 盐胁迫下甜菜M14品系“表达谱”数据库的生物信息学分析 | 第50-60页 |
| 3.8.1 盐胁迫下甜菜M14品系差异表达基因的GO功能注释 | 第50-55页 |
| 3.8.2 盐胁迫下甜菜M14品系差异表达基因的KEGGE代谢通路注释 | 第55-57页 |
| 3.8.3 盐胁迫下甜菜M14品系“表达谱”数据与蛋白质组数据的比较分析 | 第57-60页 |
| 3.9 Real-timePCR对“表达谱”数据表达量的验证 | 第60-68页 |
| 3.10 盐胁迫下甜菜M14品系叶中与根中差异表达基因参与的代谢网络 | 第68-71页 |
| 3.11 盐胁迫下甜菜M14品系代谢网络ROS途径中差异表达基因表达量的验证 | 第71-76页 |
| 第4章 讨论 | 第76-92页 |
| 4.1 盐胁迫下甜菜M14品系中细胞壁合成相关的差异表达基因 | 第76-78页 |
| 4.2 盐胁迫下甜菜M14品系中渗透物质调节相关的差异表达基因 | 第78-79页 |
| 4.3 盐胁迫下甜菜M14品系中金属离子结合相关的差异表达基因 | 第79-81页 |
| 4.4 盐胁迫下甜菜M14品系中脂类转移相关的差异表达基因 | 第81-82页 |
| 4.5 盐胁迫下甜菜M14品系中活性氧清除相关的差异表达基因 | 第82-84页 |
| 4.6 盐胁迫下甜菜M14品系中光合作用相关的差异表达基因 | 第84-85页 |
| 4.7 盐胁迫下甜菜M14品系中蛋白质合成与降解相关的差异表达基因 | 第85-87页 |
| 4.8 盐胁迫下甜菜M14品系中转录因子相关的差异表达基因 | 第87-89页 |
| 4.9 盐胁迫下甜菜M14品系中脱水应答相关的差异表达基因 | 第89-90页 |
| 4.10 盐胁迫下甜菜M14品系中水通道相关的差异表达基因 | 第90-92页 |
| 结论 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-108页 |
| 附录一 荧光定量 PCR 溶解曲线 | 第108-112页 |
| 附录二 | 第112-117页 |
| 附录三 | 第117-120页 |
| 附录四 | 第120-125页 |
| 附录五 | 第125-127页 |
| 附录六 | 第127-132页 |
| 附录七 | 第132-134页 |
| 附录八 | 第134-145页 |
| 附录九 | 第145-149页 |
| 附录十 | 第149-152页 |
| 附录十一 | 第152-154页 |
| 致谢 | 第154-155页 |
