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大肠杆菌系统改造及琥珀酸和5-氨基乙酰丙酸合成途径的构建

摘要第1-16页
ABSTRACT第16-19页
缩略词表第19-21页
第一章 大肠杆菌环境压力诱导表达系统的构建及应用第21-34页
   ·引言第21-23页
   ·实验方案(技术路线与实验内容)第23-24页
     ·实验技术路线第23页
     ·实验内容第23-24页
       ·环境压力诱导表达系统的构建第23-24页
       ·环境压力诱导表达系统的性质分析第24页
       ·环境压力诱导表达系统在PHB发酵中的应用第24页
   ·实验材料及方法第24-29页
     ·实验材料第24-25页
       ·实验相关菌株及质粒第24页
       ·培养基配方第24-25页
       ·分子操作酶及试剂盒第25页
     ·实验方法第25-29页
       ·gfp及phbCAB基因表达载体的构建第25-26页
       ·CaCl_2溶液的配制第26页
       ·感受态细胞的制备方法第26页
       ·质粒的化学转化第26页
       ·质粒的快速检测第26-27页
       ·质粒的碱裂解法提取第27页
       ·琼脂糖电泳第27-28页
       ·重组菌株发酵条件第28页
       ·绿色荧光蛋白的表达分析第28页
       ·PHB颗粒相差显微观测和荧光显微观测第28页
       ·电子显微镜样品制备第28页
       ·PHB检测分析第28-29页
   ·实验结果第29-33页
     ·环境压力诱导表达系统的构建第29-30页
     ·环境压力诱导表达系统的分析第30-31页
     ·环境压力诱导表达系统在PHB生产中的应用第31-32页
     ·PHB颗粒的观察及分析第32-33页
   ·本章结论第33-34页
第二章 大肠杆菌乙酸代谢分析以及好氧发酵平台的构建第34-49页
   ·引言第34-35页
   ·实验方案(技术路线与实验内容)第35-36页
     ·实验技术路线第35页
     ·实验内容第35-36页
       ·乙酸代谢相关酶基因的敲除第35页
       ·相关基因的缺失对乙酸及生物量积累的影响第35-36页
       ·相关基因的缺失对PHB积累的影响第36页
       ·相关基因的缺失对乙酸利用的影响第36页
   ·实验材料及方法第36-40页
     ·实验材料第36-38页
       ·实验相关菌株及质粒第36-37页
       ·培养基配方第37-38页
     ·实验方法第38-40页
       ·基因敲除方法第38-39页
       ·质粒pSCP及pHBS01的构建第39页
       ·工程菌株的培养条件第39-40页
       ·乙酸利用培养条件第40页
       ·葡萄糖、乙酸及PHB的检测第40页
   ·实验结果第40-47页
     ·基因poxB、pta及iclR的敲除第40-41页
     ·低拷贝表达载体pSCP的构建第41-42页
     ·各菌株生长曲线的比较第42页
     ·pH非调控下相关基因的缺失对乙酸和生物量积累的影响第42-43页
     ·pH调控下相关基因的缺失对乙酸和生物量积累的影响第43-44页
     ·无机盐培养基中乙酸和生物量积累的比较第44-45页
     ·相关基因的缺失对PHB积累的影响第45页
     ·pta敲除对大肠杆菌乙酸利用的影响第45-47页
     ·pH对大肠杆菌乙酸利用的影响第47页
   ·本章结论第47-49页
第三章 小RNA(sRNA)在大肠杆菌代谢工程中的应用第49-58页
   ·引言第49-50页
   ·实验方案(技术路线与实验内容)第50-51页
     ·实验技术路线第50-51页
     ·实验内容第51页
       ·工程菌株QZ1110的培养及代谢产物分析第51页
       ·RyhB的过量表达对葡萄糖代谢的影响第51页
   ·实验材料及方法第51-53页
     ·实验相关菌株及质粒第51-52页
     ·实验方法第52-53页
       ·sRNA表达质粒的构建第52-53页
       ·摇瓶培养条件第53页
       ·相关代谢产物的检测分析第53页
   ·实验结果第53-57页
     ·RyhB表达载体的构建第53-54页
     ·乙醛酸途径的激活对葡萄糖代谢的影响第54-55页
     ·过量表达RyhB对葡萄糖代谢的影响第55-57页
   ·本章结论第57-58页
第四章 琥珀酸发酵以及琥珀酸和聚羟基丁酸酯(PHB)的联产第58-69页
   ·引言第58-59页
   ·实验方案(技术路线与实验内容)第59-61页
     ·好氧发酵琥珀酸及PHB实验技术路线第59-60页
     ·实验内容第60-61页
       ·琥珀酸脱氢酶基因sdhA的敲除第60页
       ·工程菌株QZ1111发酵葡萄糖和木糖生产琥珀酸第60页
       ·ppc基因的过量表达对琥珀酸产量的影响第60-61页
       ·琥珀酸和PHB的联产第61页
   ·实验材料及方法第61-62页
     ·实验相关菌株及质粒第61-62页
     ·实验方法第62页
       ·sdhA基因的敲除第62页
       ·ppc基因的克隆第62页
       ·NADH及NADPH浓度测定第62页
       ·相关代谢产物的检测第62页
   ·实验结果第62-68页
     ·sdhA基因的敲除第63页
     ·ppc基因表达载体的构建第63-64页
     ·工程菌株QZ1111的生长曲线第64页
     ·过量表达ppc基因对琥珀酸的影响第64-65页
     ·工程菌株QZ1111补料发酵琥珀酸第65-66页
     ·工程菌株发酵木糖生产琥珀酸第66-67页
     ·分批发酵琥珀酸和PHB第67-68页
   ·本章结论第68-69页
第五章 生物炼制发酵生产琥珀酸和PHA第69-79页
   ·引言第69-70页
   ·实验方案(技术路线与实验内容)第70-71页
     ·实验技术路线第70页
     ·实验内容第70-71页
       ·sdhA基因的敲除对琥珀酸产量的影响第70-71页
       ·pta的敲除对琥珀酸产量的影响第71页
       ·琥珀酸和PHA的联产第71页
   ·实验材料及方法第71-74页
     ·实验相关菌株、质粒以及引物第71-72页
     ·实验方法第72-74页
       ·P1噬菌体转导第72-73页
       ·pta基因的敲除第73页
       ·phaC1基因表达载体的构建第73-74页
       ·琥珀酸和PHA发酵条件第74页
       ·琥珀酸及PHA检测第74页
   ·实验结果第74-78页
     ·琥珀酸生产菌株的构建第74-75页
     ·发酵甘油积累琥珀酸第75-76页
     ·phaC1表达载体的构建第76页
     ·联产琥珀酸和PHA工程菌株的构建第76-77页
     ·补料发酵联产琥珀酸和PHA第77-78页
   ·本章结论第78-79页
第六章 产5-氨基乙酰丙酸的大肠杆菌工程菌株的构建及优化第79-109页
   ·引言第79-82页
   ·实验方案(技术路线与实验内容)第82-85页
     ·实验技术路线第82-83页
     ·实验内容第83-85页
       ·大肠杆菌ALA C5相关基因的过量表达对ALA产量的影响第83页
       ·gltX的表达对C5途径相关基因的调控第83页
       ·hemA(C5)基因的突变及过量表达对ALA产量的影响第83页
       ·hemA及hemA~M的表达量的比较分析第83页
       ·相关多基因的共表达对ALA产量的影响第83-84页
       ·Fe~(2+)对ALA产量的影响第84页
       ·rhtA基因的过量表达对ALA产量的影响第84页
       ·sucA基因的敲除对ALA产量的影响第84页
       ·udhA基因的过量表达对ALA产量的影响第84页
       ·hemB的启动子分析第84页
       ·可控降解HemB及sspB基因的缺失对ALA的影响第84-85页
   ·实验材料及方法第85-94页
     ·实验相关菌株及质粒第85-87页
     ·培养基第87-88页
     ·实验方法第88-94页
       ·ALA C5相关基因表达载体构建第88页
       ·sucA基因的敲除第88页
       ·实时定量PCR第88-91页
       ·蛋白表达的检测第91-93页
       ·ssrA标签的添加及sspB基因的敲除第93页
       ·ALA发酵条件第93-94页
       ·ALA的分析方法第94页
   ·实验结果第94-107页
     ·ALA标准曲线的测定第94-95页
     ·本研究构建质粒图谱第95-96页
     ·基因gltX、hemA和hemL的表达对ALA产量的影响第96-97页
     ·过量表达外源修饰基因hemA对ALA产量的影响第97-99页
     ·共表达hemA~M和hemL对ALA产量的协同作用第99-100页
     ·GluRS上调hemB基因的表达第100-101页
     ·过量表达udhA对ALA产量的影响第101-102页
     ·sucA基因的敲除对ALA产量的影响第102页
     ·膜蛋白RhtA过量表达加速ALA的胞外运输第102-103页
     ·Fe~(2+)的添加有害于ALA的积累第103-104页
     ·ALA的分批发酵第104-105页
     ·hemB基因启动子的分析第105-106页
     ·HemB蛋白的可控降解有害于ALA的积累第106页
     ·sspB基因的缺失恢复ALA的产量第106-107页
   ·本章结论第107-109页
全文总结第109-111页
参考文献第111-122页
致谢第122-123页
攻读博士学位期间发表的学术论文第123-125页
攻读博士学位期间获得奖励与荣誉第125-127页
学位论文评阅及答辩情况表第127-128页
附录第128-140页

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