摘要 | 第5-6页 |
abstract | 第6-7页 |
英文缩略表 | 第11-12页 |
第一章 引言 | 第12-18页 |
1.1 植物耐盐性和耐旱性研究进展 | 第12-15页 |
1.1.1 盐和干旱对植物的伤害 | 第12页 |
1.1.2 盐和干旱对棉花的危害 | 第12-13页 |
1.1.3 植物响应盐和干旱胁迫的生理机制 | 第13页 |
1.1.4 植物响应盐和干旱胁迫的分子机制 | 第13-15页 |
1.2 陆地棉野生种系 | 第15页 |
1.3 植物转录组研究进展 | 第15-16页 |
1.4 植物OSCA的研究进展 | 第16-17页 |
1.5 本研究的目的与意义 | 第17-18页 |
第二章 陆地棉盐碱胁迫转录组分析 | 第18-34页 |
2.1 试验材料与方法 | 第18-21页 |
2.1.1 试验材料 | 第18页 |
2.1.2 材料种植和盐碱胁迫处理 | 第18页 |
2.1.3 测定MDA、PRO含量及SOD活性 | 第18页 |
2.1.4 RNA提取、c DNA文库构建和Illumina测序 | 第18页 |
2.1.5 测序reads的去噪、拼接 | 第18-19页 |
2.1.6 与棉花基因组比对、表达量计算及差异表达基因筛选 | 第19页 |
2.1.7 GO和KEGG富集分析 | 第19页 |
2.1.8 基因共表达网络分析 | 第19页 |
2.1.9 组织或阶段特异性及模块确定 | 第19页 |
2.1.10 候选基因的确定 | 第19-20页 |
2.1.11 qRT-PCR分析 | 第20页 |
2.1.12 统计分析及图表绘制 | 第20-21页 |
2.2 结果与分析 | 第21-31页 |
2.2.1 三个不同陆地棉材料的转录组分析 | 第21-22页 |
2.2.2 转录组的整体比较揭示了不同处理阶段之间的关系 | 第22-23页 |
2.2.3 差异表达基因分析 | 第23-24页 |
2.2.4 不同组织差异表达基因的功能注释 | 第24-26页 |
2.2.5 共表达网络与模块构建 | 第26-27页 |
2.2.6 陆地棉组织和处理阶段特异性模块的识别与可视化分析 | 第27-29页 |
2.2.7 候选基因的确定 | 第29-31页 |
2.2.8 qRT-PCR检测hub基因表达水平 | 第31页 |
2.3 结论与讨论 | 第31-34页 |
第三章 棉花OSCA基因家族的全基因组分析 | 第34-51页 |
3.1 材料与方法 | 第34-35页 |
3.1.1 棉花OSCA基因家族成员鉴定 | 第34页 |
3.1.2 OSCA基因家族系统进化和基因结构分析 | 第34页 |
3.1.3 蛋白结构域和保守基序分析 | 第34页 |
3.1.4 顺式作用元件分析 | 第34-35页 |
3.1.5 染色体定位分析 | 第35页 |
3.1.6 棉花OSCA家族基因表达模式分析 | 第35页 |
3.1.7 RNA提取与实时荧光定量PCR | 第35页 |
3.2 结果与分析 | 第35-49页 |
3.2.1 棉花OSCA家族基因的鉴定与命名 | 第35-41页 |
3.2.2 棉花OSCA基因家族系统进化和基因结构分析 | 第41-43页 |
3.2.3 棉花OSCA家族基因蛋白结构域和保守基序分析 | 第43-44页 |
3.2.4 棉花OSCA家族染色体定位及基因组复制分析 | 第44-46页 |
3.2.5 顺式作用元件 | 第46-48页 |
3.2.6 棉花OSCA家族基因的表达模式分析 | 第48-49页 |
3.3 讨论与结论 | 第49-51页 |
第四章 GhOSCA1.1在棉花中的功能验证 | 第51-57页 |
4.1 试验材料与方法 | 第51-53页 |
4.1.1 植物材料 | 第51页 |
4.1.2 酶、生化试剂及仪器耗材 | 第51页 |
4.1.3 RNA的提取与反转录 | 第51页 |
4.1.4 目的基因的克隆 | 第51页 |
4.1.5 植物VIGS载体的构建 | 第51-52页 |
4.1.6 VIGS注射方法 | 第52页 |
4.1.7 VIGS注射后棉花离体叶片失水率测定 | 第52-53页 |
4.1.8 干旱和盐胁迫处理 | 第53页 |
4.2 结果与分析 | 第53-56页 |
4.2.1 VIGS载体构建和沉默效率检测 | 第53-54页 |
4.2.2 VIGS干涉后棉花离体叶片失水率测定 | 第54页 |
4.2.3 VIGS干涉后棉花盐和干旱胁迫条件下耐性鉴定 | 第54-55页 |
4.2.4 VIGS干涉后生理指标测定 | 第55-56页 |
4.3 讨论与结论 | 第56-57页 |
第五章 全文结论 | 第57-58页 |
参考文献 | 第58-65页 |
附录 | 第65-79页 |
致谢 | 第79-80页 |
作者简介 | 第80页 |