| 摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 英文缩略词表 | 第13-14页 |
| 前言 | 第14-16页 |
| 第一章 基于RNA-Seq的茅苍术种质资源研究 | 第16-41页 |
| 1.实验材料和仪器 | 第16-17页 |
| 1.1 实验材料 | 第16-17页 |
| 1.2 实验试剂 | 第17页 |
| 1.3 实验仪器 | 第17页 |
| 2.实验方法 | 第17-22页 |
| 2.1 RNA提取 | 第17-18页 |
| 2.2 转录组高通量测序 | 第18-19页 |
| 2.3 HiSeq测序数据预处理 | 第19页 |
| 2.4 转录本拼接及从头(denovo)组装 | 第19-20页 |
| 2.5 Unigene功能注释 | 第20-21页 |
| 2.6 转录本表达丰度估计 | 第21页 |
| 2.7 差异表达分析 | 第21-22页 |
| 2.8 SSR分析 | 第22页 |
| 3.实验结果 | 第22-38页 |
| 3.1 RNA质量检测 | 第22页 |
| 3.2 转录组数据从头组装 | 第22-25页 |
| 3.3 unigene功能注释 | 第25-27页 |
| 3.4 表达丰度分析 | 第27-28页 |
| 3.5 不同产地茅苍术基因差异表达分析 | 第28-32页 |
| 3.6 不同产地差异表达基因的GO和KEGGPathway富集分析 | 第32-38页 |
| 3.7 简单重复序鉴定(SSR) | 第38页 |
| 4.讨论 | 第38-41页 |
| 第二章 茅苍术AlTPS1基因的克隆和表达分析 | 第41-60页 |
| 1.实验材料和仪器 | 第41-42页 |
| 1.1 实验材料 | 第41页 |
| 1.2 实验试剂 | 第41-42页 |
| 1.3 实验仪器 | 第42页 |
| 2.实验方法 | 第42-52页 |
| 2.1 茅苍术总RNA的提取 | 第42页 |
| 2.2 AlTPS1的3'RACE | 第42-44页 |
| 2.3 AlTPS1的5’RACE | 第44-47页 |
| 2.4 生物信息学分析 | 第47页 |
| 2.5 实时荧光相对定量PCR(qPCR) | 第47-48页 |
| 2.6 茅苍术倍半萜合酶基因的全长克隆和原核表达载体的构建 | 第48-50页 |
| 2.7 茅苍术重组表达载体Pet28a-AlTPS1的诱导表达 | 第50-52页 |
| 3.实验结果与分析 | 第52-58页 |
| 3.1 茅苍术叶片总RNA提取 | 第52页 |
| 3.2 3'RACE扩增结果 | 第52-53页 |
| 3.3 5'RACE扩增结果 | 第53页 |
| 3.4 AlTPS1序列及生物信息学分析 | 第53-55页 |
| 3.5 茅苍术倍半萜合酶基因qPCR结果 | 第55页 |
| 3.6 茅苍术倍半萜合酶AlTPS1基因的全长克隆和原核表达载体构建结果 | 第55-57页 |
| 3.7 茅苍术重组表达载体Pet28a-AlTPS1的原核表达分析 | 第57-58页 |
| 4.讨论 | 第58-60页 |
| 第三章 茅苍术DXS基因的克隆与分析 | 第60-70页 |
| 1.实验材料和仪器 | 第60页 |
| 1.1 实验材料 | 第60页 |
| 1.2 实验试剂 | 第60页 |
| 1.3 实验仪器 | 第60页 |
| 2.实验方法 | 第60-62页 |
| 2.1 cDNA模板合成和PCR扩增 | 第60-61页 |
| 2.2 阳性克隆的筛选、鉴定及测序 | 第61页 |
| 2.3 生物信息学分析 | 第61页 |
| 2.4 DXS基因的组织特异性表达 | 第61-62页 |
| 3.结果与分析 | 第62-68页 |
| 3.1 DXS基因全长克隆 | 第62页 |
| 3.2 阳性克隆的筛选、鉴定及测序 | 第62-63页 |
| 3.3 序列分析 | 第63-68页 |
| 3.4 DXS在茅苍术组织中的特异表达 | 第68页 |
| 4.讨论 | 第68-70页 |
| 结语与创新 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-77页 |
| 文献综述 茅苍术转录组学及种质资源评价研究概况 | 第77-88页 |
| 参考文献 | 第83-88页 |
| 附录 | 第88-89页 |
| 致谢 | 第89页 |
