| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第一章 前言 | 第13-21页 |
| 1.1 枪乌贼科研究概况 | 第13-16页 |
| 1.1.1 枪乌贼科分类地位 | 第13页 |
| 1.1.2 火枪乌贼(Loliolus Beka) | 第13-14页 |
| 1.1.3 中国枪乌贼(Uroteuthis chinensis) | 第14页 |
| 1.1.4 杜氏枪乌贼(Uroteuthis duvaucelii) | 第14页 |
| 1.1.5 日本枪乌贼(Loligo japonica) | 第14页 |
| 1.1.6 尤氏小枪乌贼(Loliolus uyii) | 第14-15页 |
| 1.1.7 乳光枪乌贼(Doryteuthis opalescens) | 第15-16页 |
| 1.2 枪乌贼科的系统学研究进展 | 第16-18页 |
| 1.2.1 国内外研究现状和发展动态 | 第17-18页 |
| 1.3 线粒体(mitochondrion)基因组概述 | 第18-19页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第19-21页 |
| 第二章 六种枪乌贼线粒体全基因组的测定和结构分析 | 第21-59页 |
| 2.1 材料与试剂 | 第21-23页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第21页 |
| 2.1.2 仪器与试剂 | 第21-23页 |
| 2.2 实验方法 | 第23-27页 |
| 2.2.1 基因组DNA提取 | 第23-25页 |
| 2.2.2 引物设计与合成 | 第25-26页 |
| 2.2.3 PCR扩增 | 第26-27页 |
| 2.2.4 目的片段测序 | 第27页 |
| 2.3 线粒体全基因组的序列拼接、注释与分析 | 第27-28页 |
| 2.3.1 线粒体全序列的拼接 | 第27页 |
| 2.3.2 线粒体全基因组基因定位与注释分析 | 第27-28页 |
| 2.4 火枪乌贼线粒体基因组全序列 | 第28-33页 |
| 2.4.1 线粒体基因组结构与特征 | 第28-32页 |
| 2.4.2 非编码区 | 第32-33页 |
| 2.5 中国枪乌贼线粒体基因组全序列 | 第33-38页 |
| 2.5.1 线粒体基因组结构与特征 | 第33-37页 |
| 2.5.2 非编码区 | 第37-38页 |
| 2.6 杜氏枪乌贼的线粒体基因组全序列 | 第38-43页 |
| 2.6.1 线粒体基因组结构与特征 | 第38-43页 |
| 2.6.2 非编码区 | 第43页 |
| 2.7 日本枪乌贼的线粒体基因组全序列 | 第43-48页 |
| 2.7.1 线粒体基因组结构与特征 | 第43-48页 |
| 2.7.2 非编码区 | 第48页 |
| 2.8 尤氏小枪乌贼的线粒体基因组全序列 | 第48-53页 |
| 2.8.1 线粒体基因组结构与特征 | 第48-53页 |
| 2.8.2 非编码区 | 第53页 |
| 2.9 乳光枪乌贼的线粒体基因组全序列 | 第53-59页 |
| 2.9.1 线粒体基因组结构与特征 | 第53-57页 |
| 2.9.2 非编码区 | 第57-59页 |
| 第三章 枪乌贼科线粒体基因组比较组学研究 | 第59-70页 |
| 3.1 线粒体基因组结构 | 第59-60页 |
| 3.2 线粒体蛋白基因 | 第60-63页 |
| 3.3 rRna基因和tRNA基因 | 第63页 |
| 3.4 碱基组成氨基酸使用偏好性 | 第63-64页 |
| 3.5 非编码区 | 第64-67页 |
| 3.6 枪乌贼的编码蛋白基因进化速率 | 第67页 |
| 3.7 讨论 | 第67-70页 |
| 第四章 枪乌贼科的系统发育分析 | 第70-74页 |
| 4.1 材料与方法 | 第70-71页 |
| 4.1.1 外群的选择 | 第70页 |
| 4.1.2 数据的准备 | 第70-71页 |
| 4.1.3 系统发育树的构建 | 第71页 |
| 4.2 实验结果基于16S、CR、全基因序列组序列建树 | 第71-73页 |
| 4.3 讨论 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-81页 |
| 致谢 | 第81-83页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第83页 |
