摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第1章 前言 | 第11-23页 |
1 蛩螽亚科研究概况 | 第11-14页 |
1.1 蛩螽亚科简介 | 第11页 |
1.2 蛩螽亚科分类研究概况 | 第11-14页 |
1.2.1 世界蛩螽亚科分类研究概况 | 第11-13页 |
1.2.2 中国蛩螽亚科分类研究概况 | 第13-14页 |
2 分子系统学研究概况 | 第14-20页 |
2.1 分子系统学 | 第14页 |
2.2 DNA测序技术发展 | 第14-15页 |
2.3 基于DNA序列数据的系统发育研究方法 | 第15-20页 |
2.3.1 mtDNA在分子系统学研究中的应用 | 第15-17页 |
2.3.2 系统发育关系重建 | 第17-20页 |
3 螽斯科分子系统学研究进展 | 第20-22页 |
4 本项研究的目的和意义 | 第22-23页 |
第2章 材料和方法 | 第23-29页 |
1 材料 | 第23-25页 |
1.1 标本 | 第23-24页 |
1.2 仪器 | 第24页 |
1.3 试剂 | 第24-25页 |
1.4 生物信息学软件 | 第25页 |
2 实验方法 | 第25-26页 |
2.1 基因组总DNA提取 | 第25页 |
2.1.1 提取方法 | 第25页 |
2.1.2 基因组总DNA的检测(琼脂糖凝胶电泳法检测) | 第25页 |
2.2 PCR扩增目的基因片段 | 第25-26页 |
2.2.1 引物设计 | 第25-26页 |
2.2.2 PCR扩增体系 | 第26页 |
2.2.3 PCR扩增反应程序 | 第26页 |
2.2.4 PCR扩增产物纯化与检测 | 第26页 |
3 实验数据处理和分析 | 第26-29页 |
3.1 序列拼接与校对 | 第26-27页 |
3.2 Blast检索 | 第27页 |
3.3 序列比对 | 第27页 |
3.4 目的基因序列的序列组成分析 | 第27页 |
3.5 基因序列系统发育信号检测 | 第27页 |
3.6 系统发育树的建立 | 第27-29页 |
第3章 结果与讨论 | 第29-47页 |
1 总DNA提取与目的基因的PCR扩增及测序 | 第29-31页 |
1.1 总DNA提取结果 | 第29页 |
1.2 PCR扩增产物检侧结果 | 第29-31页 |
2 COI基因序列分析 | 第31-37页 |
2.1 COI基因序列组成及变异 | 第31页 |
2.2 COI基因遗传距离分析 | 第31-32页 |
2.3 COI序列碱基替换饱和性分析 | 第32页 |
2.4 系统发育分析 | 第32-37页 |
2.4.1 最大简约法(MP) | 第33-34页 |
2.4.2 邻接法(NJ) | 第34-35页 |
2.4.3 最大似然法(ML) | 第35-36页 |
2.4.4 讨论 | 第36-37页 |
3 蛩螽亚科部分种类12S rRNA基因序列分析 | 第37-42页 |
3.1 12S rRNA基因序列组成及变异 | 第37-38页 |
3.2 12S rRNA基因遗传距离分析 | 第38-39页 |
3.3 序列碱基替换饱和性分析 | 第39页 |
3.4 系统发育分析 | 第39-42页 |
3.4.1 最大简约法(MP) | 第40页 |
3.4.2 邻接法(NJ) | 第40-41页 |
3.4.3 最大似然法(ML) | 第41页 |
3.4.4 分析和讨论 | 第41-42页 |
4 COI&12S rRNA基因序列联合分析 | 第42-47页 |
4.1 COI&12S rRNA基因序列联合组成及变异 | 第42页 |
4.2 COI&12S rRNA基因联合序列遗传距离分析 | 第42-43页 |
4.3 序列碱基替换饱和性分析 | 第43页 |
4.4 系统发育分析 | 第43-47页 |
4.4.1 最大简约法(MP) | 第43-44页 |
4.4.2 邻接法(NJ) | 第44-45页 |
4.4.3 最大似然法(ML) | 第45页 |
4.4.4 讨论 | 第45-47页 |
第四章 结论 | 第47-49页 |
参考文献 | 第49-56页 |
致谢 | 第56-57页 |
在读期间发表的学术论文 | 第57-58页 |
附录 | 第58-60页 |