| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一部分 文献综述 | 第11-48页 |
| 1.1 前言 | 第11-12页 |
| 1.2 唐氏综合症表型特点 | 第12-14页 |
| 1.3 唐氏综合症流行病学 | 第14-15页 |
| 1.3.1 唐氏综合症的发病率 | 第14页 |
| 1.3.2 影响唐氏发病的风险因子 | 第14-15页 |
| 1.3.3 唐氏患者的平均寿命 | 第15页 |
| 1.4 唐氏胎儿诊断 | 第15-16页 |
| 1.5 唐氏综合症和21号染色体 | 第16-18页 |
| 1.5.1 唐氏综合症与21号染色体的关系的发现 | 第16页 |
| 1.5.2 Hsa21特点 | 第16-18页 |
| 1.5.3 Hsa21与其它生物基因组的同源性比较 | 第18页 |
| 1.6 唐氏小鼠模型 | 第18-22页 |
| 1.6.1 Ts16鼠 | 第20页 |
| 1.6.2 Ts65Dn鼠 | 第20-21页 |
| 1.6.3 Ts1Cje鼠 | 第21页 |
| 1.6.4 其它部分三体小鼠模型 | 第21页 |
| 1.6.5 转基因小鼠 | 第21-22页 |
| 1.7 唐氏综合症研究相关观点和假说 | 第22-24页 |
| 1.7.1 基因剂量效应假说 | 第23页 |
| 1.7.2 唐氏综合症关键区 | 第23-24页 |
| 1.7.3 发育不平衡假说 | 第24页 |
| 1.8 研究基因表达的技术 | 第24-31页 |
| 1.8.1 实时定量PCR(real-time quantitative polymerase chain reaction,qPCR) | 第24-26页 |
| 1.8.2 生物芯片技术 | 第26-27页 |
| 1.8.3 芯片技术和qPCR在研究唐氏综合症中的应用 | 第27-30页 |
| 1.8.4 唐氏表型相关基因 | 第30-31页 |
| 1.9 唐氏综合症的治疗 | 第31-33页 |
| 1.10 实验背景和意义 | 第33-34页 |
| 参考文献 | 第34-48页 |
| 第二部分 研究内容 | 第48-146页 |
| 第一章 唐氏综合症外周血细胞基因表达谱分析 | 第48-103页 |
| 摘要 | 第48-49页 |
| Abstract | 第49-50页 |
| 2.1 前言 | 第50-51页 |
| 2.2 材料和方法 | 第51-66页 |
| 2.2.1 样本和分组 | 第51页 |
| 2.2.2 Total RNA分离和鉴定 | 第51-54页 |
| 2.2.3 外显子芯片杂交 | 第54-58页 |
| 2.2.4 鉴定两个年龄组中唐氏和对照之间差异表达基因 | 第58-59页 |
| 2.2.5 外显子芯片分析结果的qPCR验证 | 第59-64页 |
| 2.2.6 唐氏患者外周血异常表达基因在染色体上分布特点 | 第64-65页 |
| 2.2.7 异常表达基因的聚类分析 | 第65页 |
| 2.2.8 GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析 | 第65-66页 |
| 2.3 结果 | 第66-87页 |
| 2.3.1 Total RNA质量检测结果 | 第66页 |
| 2.3.2 芯片杂交结果 | 第66-69页 |
| 2.3.3 差异表达基因鉴定 | 第69-71页 |
| 2.3.4 唐氏和对照差异表达基因 | 第71-77页 |
| 2.3.5 qPCR验证试验 | 第77-80页 |
| 2.3.6 异常表达基因在染色体分布特征 | 第80-83页 |
| 2.3.7 差异表达基因的聚类分析 | 第83页 |
| 2.3.8 异常表达基因的功能分析 | 第83-87页 |
| 2.4 讨论 | 第87-93页 |
| 2.4.1 外显子芯片分析方法的可靠性 | 第88-89页 |
| 2.4.2 两个年龄组间异常表达基因的比较 | 第89-90页 |
| 2.4.3 差异表达基因的功能分析 | 第90-93页 |
| 2.5 结论 | 第93页 |
| 参考文献 | 第93-103页 |
| 第二章 唐氏综合症外周血细胞全基因组外显子选择性剪接分析 | 第103-121页 |
| 摘要 | 第103页 |
| Abstract | 第103-104页 |
| 3.1 前言 | 第104-105页 |
| 3.2 材料和方法 | 第105-108页 |
| 3.2.1 样本制备和芯片杂交 | 第105页 |
| 3.2.2 外显子选择性剪接分析 | 第105-107页 |
| 3.2.3 21三体对各条染色体基因选择性剪接的影响 | 第107-108页 |
| 3.2.4 异常剪接基因功能分析 | 第108页 |
| 3.3 结果 | 第108-114页 |
| 3.3.1 选择性剪接分析结果 | 第108-112页 |
| 3.3.2 异常剪接基因在染色体上的分布 | 第112-113页 |
| 3.3.3 选择性剪接异常基因功能分析 | 第113-114页 |
| 3.4 讨论 | 第114-117页 |
| 3.4.1 选择性剪接分析方法可靠性 | 第114-115页 |
| 3.4.2 异常剪接基因在两个年龄组间的比较 | 第115-117页 |
| 3.4.4 异常剪接基因的功能分析 | 第117页 |
| 3.5 结论 | 第117-118页 |
| 参考文献 | 第118-121页 |
| 第三章 唐氏综合症外周血淋巴细胞21号染色体DNA甲基化谱分析 | 第121-146页 |
| 摘要 | 第121页 |
| Abstract | 第121-122页 |
| 4.1 前言 | 第122-123页 |
| 4.2 材料和方法 | 第123-135页 |
| 4.2.1 甲基化芯片设计 | 第123页 |
| 4.2.2 样品信息和DNA抽提 | 第123-125页 |
| 4.2.3 甲基化DNA富集 | 第125-128页 |
| 4.2.4 甲基化芯片杂交 | 第128-129页 |
| 4.2.5 甲基化芯片分析 | 第129-130页 |
| 4.2.6 亚硫酸盐测序 | 第130-133页 |
| 4.2.7 Hsa21基因表达分析 | 第133-135页 |
| 4.3 结果 | 第135-145页 |
| 4.3.1 MeDIP结果验证 | 第135页 |
| 4.3.2 甲基化芯片分析结果 | 第135-142页 |
| 4.3.3 表达谱分析 | 第142-143页 |
| 4.3.4 甲基化芯片的验证 | 第143-145页 |
| 4.4 讨论 | 第145-146页 |
| 4.4.1 亚硫酸盐修饰结合454测序 | 第145页 |
| 4.4.2 唐氏淋巴细胞Hsa21的甲基化谱与对照无差别 | 第145页 |
| 4.4.3 Hsa21染色体promoter区CpG岛是低甲基化的 | 第145-146页 |
| 4.5 结论 | 第146页 |
| 参考文献 | 第146-149页 |
| 致谢 | 第149-150页 |
