| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 0 前言 | 第13-14页 |
| 1 综述 | 第14-26页 |
| 1.1 微生物生态学概况 | 第14-15页 |
| 1.1.1 微生物生态学的定义及研究内容 | 第14页 |
| 1.1.2 微生物生态学的发展历程 | 第14-15页 |
| 1.1.2.1 国外微生物生态学的发展进程 | 第14页 |
| 1.1.2.2 国内微生物生态学的发展进程 | 第14-15页 |
| 1.2 海洋微生物的分布、功能特征及多样性研究 | 第15-16页 |
| 1.3 微生物多样性的研究方法 | 第16-20页 |
| 1.3.1 微生物多样性研究中的传统方法 | 第16-17页 |
| 1.3.1.1 直接测定 | 第16页 |
| 1.3.1.2 培养法 | 第16页 |
| 1.3.1.3 代谢活力的测定法 | 第16-17页 |
| 1.3.1.4 数学方法 | 第17页 |
| 1.3.2 微生物多样性研究中的分子生物学方法 | 第17-20页 |
| 1.3.2.1 核酸探针杂交技术 | 第17页 |
| 1.3.2.2 PCR 特异性扩增技术 | 第17-18页 |
| 1.3.2.3 rRNA 基因同源性分析方法 | 第18-19页 |
| 1.3.2.4 环境基因组学和高通量测序技术 | 第19-20页 |
| 1.4 生物修复 | 第20-23页 |
| 1.4.1 污染来源及种类 | 第20-22页 |
| 1.4.1.1 海水养殖带来的污染 | 第20-21页 |
| 1.4.1.2 油类污染 | 第21页 |
| 1.4.1.3 陆源污染 | 第21-22页 |
| 1.4.2 生物修复的方式 | 第22-23页 |
| 1.4.2.1 微生物修复 | 第22页 |
| 1.4.2.2 海藻修复 | 第22-23页 |
| 1.4.2.3 生境修复 | 第23页 |
| 1.5 生物修复效果评价 | 第23-25页 |
| 1.5.1 菌群结构的分析 | 第23页 |
| 1.5.2 理化指标 | 第23-25页 |
| 1.5.2.1 温度 | 第23-24页 |
| 1.5.2.2 pH | 第24页 |
| 1.5.2.3 化学需氧量（COD） | 第24页 |
| 1.5.2.4 活性磷酸盐 | 第24页 |
| 1.5.2.5 活性硅酸盐 | 第24页 |
| 1.5.2.6 DIN、NH4-N、NO3-N、NO2-N | 第24页 |
| 1.5.2.7 N/P | 第24-25页 |
| 1.6 本论文研究目的、意义及内容 | 第25-26页 |
| 1.6.1 研究目的和意义 | 第25页 |
| 1.6.2 研究内容 | 第25-26页 |
| 2 南沙港海域沉积环境的细菌群落与环境影响因子 | 第26-42页 |
| 2.1 材料和方法 | 第26-28页 |
| 2.1.1 样品的采集 | 第26-27页 |
| 2.1.2 沉积物基因组总 DNA 的提取和 PCR 扩增 | 第27页 |
| 2.1.3 变性梯度凝胶电泳（DGGE）分析 | 第27页 |
| 2.1.4 DGGE 条带序列分析 | 第27页 |
| 2.1.5 理化指标的测定 | 第27页 |
| 2.1.6 数据分析 | 第27-28页 |
| 2.1.6.1 DGGE 电泳图谱分析 | 第27-28页 |
| 2.1.6.2 沉积物样品中细菌多样性与水环境因子的相关性分析 | 第28页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第28-38页 |
| 2.2.1 底泥总 DNA 直接提取 | 第28-29页 |
| 2.2.2 16S rDNA 的 PCR 扩增 | 第29页 |
| 2.2.3 DGGE 指纹图谱分析 | 第29-30页 |
| 2.2.4 部分细菌优势条带的序列比对分析结果 | 第30-34页 |
| 2.2.5 南沙港水体样品理化指标结果分析 | 第34-36页 |
| 2.2.6 沉积物细菌多样性与水环境因子的相关性分析 | 第36-38页 |
| 2.3 讨论 | 第38-42页 |
| 2.3.1 南沙港沉积物细菌群落结构的变化特征 | 第38-40页 |
| 2.3.2 沉积物细菌多样性与水环境因子之间的相关性 | 第40-42页 |
| 3 西沪港海域沉积环境的细菌群落与环境影响因子 | 第42-54页 |
| 3.1 材料和方法 | 第42页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第42-51页 |
| 3.2.1 底泥总 DNA 直接提取 | 第42页 |
| 3.2.2 16S rDNA 的 PCR 扩增 | 第42页 |
| 3.2.3 沉积物 DGGE 指纹图谱分析 | 第42-44页 |
| 3.2.4 部分细菌优势条带的序列比对分析结果 | 第44-47页 |
| 3.2.5 水体样品理化指标结果分析 | 第47-49页 |
| 3.2.6 沉积物细菌多样性与水环境因子的相关性分析 | 第49-51页 |
| 3.3 讨论 | 第51-54页 |
| 3.3.1 西沪港沉积物细菌群落结构的变化特征 | 第51-53页 |
| 3.3.2 沉积物细菌多样性与水环境因子之间的相关性 | 第53-54页 |
| 4 石岩海域沉积环境的细菌群落与环境影响因子 | 第54-63页 |
| 4.1 材料和方法 | 第54页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第54-61页 |
| 4.2.1 底泥总 DNA 直接提取 | 第54页 |
| 4.2.2 16S rDNA 的 PCR 扩增 | 第54页 |
| 4.2.3 沉积物 DGGE 指纹图谱分析 | 第54-55页 |
| 4.2.4 部分细菌优势条带的序列比对分析结果 | 第55-58页 |
| 4.2.5 水体样品理化指标结果分析 | 第58-60页 |
| 4.2.6 沉积物多样性与水环境因子的相关性分析 | 第60-61页 |
| 4.3 讨论 | 第61-63页 |
| 4.3.1 沉积物细菌群落结构的变化特征 | 第61-62页 |
| 4.3.2 沉积物细菌多样性与水环境因子之间的相关性 | 第62-63页 |
| 5 不同养殖区细菌群落结构的比较 | 第63-64页 |
| 6 结论 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 个人简历 | 第76页 |
| 发表的学术论文 | 第76-77页 |
