| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 1 绪论 | 第14-29页 |
| 1.1 细菌生物被膜概述 | 第14-19页 |
| 1.1.1 细菌生物被膜的结构特征 | 第14-17页 |
| 1.1.2 细菌生物被膜的生长周期 | 第17-19页 |
| 1.2 气液生物被膜中的金属离子 | 第19-20页 |
| 1.3 S. oneidensis的末端氧化酶及其调控系统 | 第20-26页 |
| 1.3.1 细胞色素氧化酶概述 | 第21页 |
| 1.3.2 细菌中的末端氧化酶 | 第21-25页 |
| 1.3.3 S. oneidensis的末端氧化酶 | 第25-26页 |
| 1.4 本研究的背景、主要内容及意义 | 第26-29页 |
| 2 二价金属阳离子对S. oneidensis气液生物被膜的影响 | 第29-56页 |
| 2.1 材料与方法 | 第29-35页 |
| 2.1.1 化学药品和试剂 | 第29-31页 |
| 2.1.2 供试菌株、质粒以及培养条件 | 第31-32页 |
| 2.1.3 框内缺失突变株的构建与回补 | 第32-33页 |
| 2.1.4 气液生物被膜的培养及生物量的测定 | 第33页 |
| 2.1.5 β-半乳糖苷酶活性检测 | 第33-34页 |
| 2.1.6 通过Ferrozine试验测定铁的氧化物中Fe~(2+)和Fe~(3+)的比例 | 第34-35页 |
| 2.2 结果与分析 | 第35-51页 |
| 2.2.1 S. oneidensis气液生物被膜的形成需要二价金属阳离子 | 第35-39页 |
| 2.2.2 Mg~(2+)和Fe~(2+)对于气液生物被膜的形成是必要的 | 第39-43页 |
| 2.2.3 Fe~(2+)的氧化对气液生物被膜形成的影响 | 第43-46页 |
| 2.2.4 不可溶电子受体能够破坏S. oneidensis的气液生物被膜 | 第46-50页 |
| 2.2.5 铁离子对△cymA和△crp的气液生物被膜没有影响 | 第50-51页 |
| 2.3 讨论 | 第51-56页 |
| 2.3.1 Fe~(2+)对S. oneidensis气液生物被膜的影响 | 第52-53页 |
| 2.3.2 铁氧化合物的形成能够破坏S. oneidensis气液生物被膜 | 第53-54页 |
| 2.3.3 S. oneidensis倾向于在不可溶电子受体表面形成固体生物被膜 | 第54-56页 |
| 3 c型细胞色素在有氧呼吸中起到关键作用 | 第56-72页 |
| 3.1 材料与方法 | 第56-61页 |
| 3.1.1 供试菌株、质粒以及培养条件 | 第56-57页 |
| 3.1.2 框内缺失突变株的构建与回补 | 第57-58页 |
| 3.1.3 S. oneidensis有氧培养及生长速率测定 | 第58页 |
| 3.1.4 Nadi试验 | 第58-59页 |
| 3.1.5 生理特性研究 | 第59页 |
| 3.1.6 存活率试验 | 第59页 |
| 3.1.7 启动子活性检测 | 第59-60页 |
| 3.1.8 qRT-PCR | 第60-61页 |
| 3.2 结果与分析 | 第61-69页 |
| 3.2.1 细胞色素c蛋白在有氧生长中的重要作用 | 第61-63页 |
| 3.2.2 细胞色素cbb_3氧化酶在S. oneidensis的有氧呼吸中至关重要 | 第63-65页 |
| 3.2.3 细胞色素cbb_3氧化酶和细胞色素bd氧化酶在微氧呼吸中起到关键作用 | 第65-66页 |
| 3.2.4 S. oneidensis末端氧化酶在呼吸中的功能与表达水平有关 | 第66-68页 |
| 3.2.5 cyd操纵子的补偿表达 | 第68-69页 |
| 3.3 讨论 | 第69-72页 |
| 3.3.1 S. oneidensis在有氧条件下主要利用cbb_3型氧化酶进行呼吸 | 第69-70页 |
| 3.3.2 S. oneidensis中细胞色素caa_3氧化酶功能丧失 | 第70-72页 |
| 4 S. oneidensis呼吸系统的调控 | 第72-81页 |
| 4.1 材料与方法 | 第72-74页 |
| 4.1.1 供试菌株、质粒以及培养条件 | 第72-73页 |
| 4.1.2 启动子活性检测 | 第73页 |
| 4.1.3 Crp-His融合蛋白的表达纯化 | 第73-74页 |
| 4.1.4 EMSA试验 | 第74页 |
| 4.2 结果与分析 | 第74-78页 |
| 4.2.1 全局调控因子ArcA,Crp和Fnr对cco,cox以及cyd操纵子表达的影响 | 第74-76页 |
| 4.2.2 Crp蛋白的DNA结合特征 | 第76-78页 |
| 4.3 讨论 | 第78-81页 |
| 5 论文总结 | 第81-85页 |
| 5.1 主要研究结论 | 第81-83页 |
| 5.2 创新之处 | 第83页 |
| 5.3 不足及展望 | 第83-85页 |
| 参考文献 | 第85-98页 |
| 附录 | 第98-101页 |
| 致谢 | 第101-103页 |
| 作者简介 | 第103-104页 |
