摘要 | 第5-6页 |
ABSTRACT | 第6页 |
符号对照表 | 第9-10页 |
缩略语对照表 | 第10-13页 |
第一章 绪论 | 第13-23页 |
1.1 课题背景与意义 | 第13-14页 |
1.2 国内外研究现状 | 第14-19页 |
1.2.2 药物-靶标关系分析策略 | 第15-16页 |
1.2.3 药物-药物关系策略 | 第16-17页 |
1.2.4 药物-疾病关系分析策略 | 第17-18页 |
1.2.5 网络模型的提出 | 第18-19页 |
1.3 本研究的提出与意义 | 第19-20页 |
1.4 本文的研究内容与结构组织 | 第20-21页 |
1.4.1 研究内容 | 第20-21页 |
1.4.2 组织结构 | 第21页 |
1.5 本章小结 | 第21-23页 |
第二章 基于复杂网络模块距离的药物重定位 | 第23-37页 |
2.1 实验数据的介绍 | 第23-25页 |
2.2 复杂网络模块距离的度量策略 | 第25-28页 |
2.2.1 模块距离算法 | 第25-27页 |
2.2.2 基于模块距离构建药物-疾病网络 | 第27-28页 |
2.3 实验结果与分析 | 第28-34页 |
2.3.2 CTD验证分析 | 第29-32页 |
2.3.3 KEGG pathway富集性分析与文献挖掘分析 | 第32-34页 |
2.4 本章小结 | 第34-37页 |
第三章 基于多源随机游走算法的药物重定位研究 | 第37-51页 |
3.1 介绍 | 第37页 |
3.2 数据 | 第37-38页 |
3.3 算法框架 | 第38-43页 |
3.3.1 构建有权PPI网络(GWIN) | 第38-40页 |
3.3.2 构建药物相似性网络 | 第40-43页 |
3.4 实验结果分析 | 第43-50页 |
3.4.1 阈值的选择与药物相似性网络的构建 | 第43-44页 |
3.4.2 通过药物靶标分析进一步筛选潜在药物 | 第44-46页 |
3.4.3 对候选9个药物进行CTD标准以及文献验证分析 | 第46-48页 |
3.4.4 候选药物KEGG pathway富集性分析 | 第48-50页 |
3.5 本章小结 | 第50-51页 |
第四章 总结与展望 | 第51-53页 |
4.1 总结 | 第51页 |
4.2 展望 | 第51-53页 |
参考文献 | 第53-61页 |
致谢 | 第61-63页 |
作者简介 | 第63-64页 |