| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 1 综述 | 第9-20页 |
| 1.1 玉米的研究意义 | 第9-10页 |
| 1.2 玉米叶片解剖结构及生理 | 第10-11页 |
| 1.3 玉米叶片光合特性 | 第11-14页 |
| 1.3.1 玉米是NADP-ME类型的C_4植物 | 第11页 |
| 1.3.2 玉米的光合途径 | 第11-12页 |
| 1.3.3 C_4光合途径中的关键酶 | 第12-14页 |
| 1.4 玉米光合突变体 | 第14-17页 |
| 1.4.1 Mutator转座因子 | 第14页 |
| 1.4.2 玉米bsd2突变体研究背景 | 第14-17页 |
| 1.5 新一代的转录组测序 | 第17-18页 |
| 1.6 酵母双杂交技术 | 第18-19页 |
| 1.7 研究目的与意义 | 第19页 |
| 1.8 创新之处 | 第19-20页 |
| 2 实验材料 | 第20-22页 |
| 2.1 玉米材料 | 第20页 |
| 2.2 菌株和质粒载体 | 第20页 |
| 2.3 酶与生化试剂 | 第20-21页 |
| 2.4 PCR引物和扩增片段测序 | 第21页 |
| 2.5 数据处理用软件 | 第21-22页 |
| 3 实验方法 | 第22-40页 |
| 3.1 玉米植株的种植 | 第22页 |
| 3.2 表型观察 | 第22页 |
| 3.3 PCR鉴定植株的基因型 | 第22-23页 |
| 3.3.1 植株基因组的提取 | 第22-23页 |
| 3.3.2 PCR鉴定植株基因型 | 第23页 |
| 3.4 叶绿素荧光参数的测量 | 第23-24页 |
| 3.5 样品的取样 | 第24页 |
| 3.6 RNA提取 | 第24-25页 |
| 3.7 RNA-Seq文库的构建 | 第25-30页 |
| 3.7.1 Sera-mag SpeedBeads的原理及稀释 | 第25-26页 |
| 3.7.2 RNA-Seq文库构建 | 第26-29页 |
| 3.7.3 文库质量检测 | 第29-30页 |
| 3.8 测序结果信息分析 | 第30-31页 |
| 3.8.1 过滤原始数据 | 第30页 |
| 3.8.2 数据组装与比对 | 第30-31页 |
| 3.8.3 基因功能注释 | 第31页 |
| 3.8.4 差异表达基因分析 | 第31页 |
| 3.8.5 pathway分析 | 第31页 |
| 3.9 荧光定量PCR | 第31-33页 |
| 3.10 酵母双杂筛选互作蛋白 | 第33-40页 |
| 3.10.1 BSD2基因的克隆和pGBKT7-BSD2 Bait诱饵载体的构建 | 第33-35页 |
| 3.10.2 诱饵载体pGBKT7-BSD2的自激活及毒性检测 | 第35-36页 |
| 3.10.3 采用酵母Mating的方法筛选与BSD2互作的蛋白 | 第36-37页 |
| 3.10.4 对测序结果进行基因比对 | 第37页 |
| 3.10.5 对互作候选基因进行克隆,连接到载体pGADT7中 | 第37-38页 |
| 3.10.6 候选基因酵母质粒的自激活及毒性检测 | 第38页 |
| 3.10.7 Prey质粒转化Bait质粒Y2H GOLD菌株 | 第38-39页 |
| 3.10.8 在四缺培养基上鉴定 | 第39-40页 |
| 4 结果与分析 | 第40-58页 |
| 4.1 植株基因型的鉴定及表型观察 | 第40-41页 |
| 4.2 样品RNA的提取 | 第41页 |
| 4.3 叶绿素荧光参数的变化 | 第41-42页 |
| 4.4 RNA-Seq文库构建 | 第42-43页 |
| 4.4.1 Sera-Mag SpeedBeads的检测 | 第42页 |
| 4.4.2 文库构建 | 第42-43页 |
| 4.5 RNA-Seq结果分析 | 第43-53页 |
| 4.5.1 测序质量及组装 | 第43页 |
| 4.5.2 基因表达值的定量 | 第43-44页 |
| 4.5.3 基因功能注释 | 第44页 |
| 4.5.4 筛选差异表达基因 | 第44-46页 |
| 4.5.5 差异基因 | 第46-47页 |
| 4.5.6 pathway富集 | 第47-52页 |
| 4.5.7 转录因子的差异 | 第52-53页 |
| 4.6 qRT-PCR结果与RNA-Seq结果比对 | 第53-54页 |
| 4.7 酵母双杂结果 | 第54-58页 |
| 4.7.1 Bait诱饵载体的构建 | 第54页 |
| 4.7.2 诱饵载体pGBKT7-BSD2毒性及自激活检测 | 第54-55页 |
| 4.7.3 筛库结果 | 第55-56页 |
| 4.7.4 阳性克隆的PCR鉴定 | 第56页 |
| 4.7.5 阳性克隆的测序结果 | 第56页 |
| 4.7.6 一一验证 | 第56-58页 |
| 5 讨论 | 第58-60页 |
| 6 结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-66页 |
| 缩略语表 | 第66-67页 |
| 附录 | 第67-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
