骨质疏松风险因素数据库的构建及其发病的分子机理研究
| 中文摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 第一章 引言 | 第9-20页 |
| 1.1 研究背景 | 第9-13页 |
| 1.1.1 骨质疏松症的概念 | 第9-11页 |
| 1.1.2 风险因素 | 第11页 |
| 1.1.3 基因芯片技术 | 第11页 |
| 1.1.4 生物通路、GO和调控网络 | 第11-12页 |
| 1.1.5 共表达网络 | 第12-13页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第13-16页 |
| 1.2.1 骨质疏松风险因素研究现状 | 第14-15页 |
| 1.2.2 骨质疏松发病机理研究现状 | 第15-16页 |
| 1.3 研究内容 | 第16-18页 |
| 1.3.1 研究内容和方案 | 第16-17页 |
| 1.3.2 论文框架与组织结构 | 第17-18页 |
| 1.4 研究目的和意义 | 第18-20页 |
| 1.4.1 研究目的与意义 | 第18-19页 |
| 1.4.2 创新性分析 | 第19-20页 |
| 第二章 骨质疏松风险因素整合数据库 | 第20-39页 |
| 2.1 数据库的设计与实施概述 | 第20页 |
| 2.2 开发环境与工具选择 | 第20-21页 |
| 2.3 数据的收集与处理 | 第21-23页 |
| 2.3.1 数据来源与检索关键词 | 第21-22页 |
| 2.3.2 数据处理和注释 | 第22-23页 |
| 2.3.3 风险因素数据分类统计 | 第23页 |
| 2.4 数据库设计 | 第23-28页 |
| 2.4.1 数据库设计原则和设计步骤 | 第23-24页 |
| 2.4.2 数据库需求调研和需求分析 | 第24-27页 |
| 2.4.3 数据库概念结构设计和逻辑结构设计 | 第27-28页 |
| 2.5 数据库实施 | 第28-38页 |
| 2.5.1 数据的载入和应用的编写 | 第28-29页 |
| 2.5.2 功能模块划分 | 第29-30页 |
| 2.5.3 数据库的实现 | 第30-38页 |
| 2.6 数据分析 | 第38-39页 |
| 第三章 骨质疏松发病的分子机理研究 | 第39-66页 |
| 3.1 概述 | 第39-40页 |
| 3.2 传统的基因层面的分子机理研究 | 第40-42页 |
| 3.2.1 基因差异表达分析的数据来源 | 第40-41页 |
| 3.2.2 数据预处理及分析 | 第41-42页 |
| 3.2.3 差异表达分析结果 | 第42页 |
| 3.2.4 传统差异表达分析的局限性 | 第42页 |
| 3.3 通路富集分析 | 第42-50页 |
| 3.3.1 KEGG通路富集分析 | 第43-45页 |
| 3.3.2 IPA通路富集分析 | 第45-47页 |
| 3.3.3 差异数据的重叠度分析 | 第47-48页 |
| 3.3.4 基于重叠度分析的若干发现 | 第48-50页 |
| 3.4 共表达网络与基因差异表达相结合 | 第50-65页 |
| 3.4.1 概述 | 第50-51页 |
| 3.4.2 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 第51-56页 |
| 3.4.3 骨质疏松风险关联度分析 | 第56-59页 |
| 3.4.4 差异表达基因的映射与处理 | 第59-62页 |
| 3.4.5 新模块的TF靶基因预测分析 | 第62-63页 |
| 3.4.6 Gene Ontology富集分析 | 第63-64页 |
| 3.4.7 骨质疏松风险模块网络可视化 | 第64-65页 |
| 3.5 本章总结 | 第65-66页 |
| 第四章 结论和展望 | 第66-68页 |
| 4.1 讨论与总结 | 第66页 |
| 4.2 展望 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-74页 |
| 附录 | 第74-103页 |
| 致谢 | 第103-104页 |
