基于分子网络的疾病基因预测算法
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 符号对照表 | 第11-12页 |
| 缩略语对照表 | 第12-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-21页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第15-16页 |
| 1.2 研究现状 | 第16-19页 |
| 1.2.1 相关生物网络 | 第16-17页 |
| 1.2.2 基因预测研究现状 | 第17-19页 |
| 1.3 论文组织结构 | 第19-21页 |
| 第二章 网络理论及基因预测方法概述 | 第21-29页 |
| 2.1 图的相关概念 | 第21-22页 |
| 2.2 复杂网络 | 第22-23页 |
| 2.3 现有疾病基因预测方法 | 第23-26页 |
| 2.3.1 基于疾病模块的预测方法 | 第23-25页 |
| 2.3.2 基于直接网络邻居的预测方法 | 第25页 |
| 2.3.3 基于网络传播的预测方法 | 第25-26页 |
| 2.3.4 基于分类的预测方法 | 第26页 |
| 2.4 本章小结 | 第26-29页 |
| 第三章 基于分子网络的疾病基因预测算法 | 第29-39页 |
| 3.1 方法概述 | 第29-31页 |
| 3.2 疾病基因网络构建方法 | 第31-35页 |
| 3.2.1 初始基因的来源 | 第31页 |
| 3.2.2 基因网络构建方法 | 第31-35页 |
| 3.3 疾病基因的预测方法 | 第35-38页 |
| 3.3.1 MCL聚类算法 | 第35-37页 |
| 3.3.2 模块得分公式 | 第37页 |
| 3.3.3 基因得分公式 | 第37-38页 |
| 3.4 本章小结 | 第38-39页 |
| 第四章 实验结果及分析 | 第39-51页 |
| 4.1 实现数据 | 第39-41页 |
| 4.1.1 实验数据获取 | 第39-40页 |
| 4.1.2 基因数据预处理 | 第40-41页 |
| 4.2 疾病基因网络拓扑特性分析 | 第41-42页 |
| 4.3 聚类模块结构分析 | 第42-44页 |
| 4.4 预测疾病基因的验证和分析 | 第44-49页 |
| 4.4.1 留一交叉验证 | 第44-48页 |
| 4.4.2 聚类分析 | 第48页 |
| 4.4.3 GO富集分析 | 第48-49页 |
| 4.5 本章小结 | 第49-51页 |
| 第五章 总结与展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 致谢 | 第57-59页 |
| 作者简介 | 第59-60页 |
