| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-30页 |
| 1 国内外研究现状 | 第14-27页 |
| 1.1 病原学 | 第14-19页 |
| 1.2 流行病学 | 第19-20页 |
| 1.3 免疫学 | 第20-21页 |
| 1.4 病理变化 | 第21页 |
| 1.5 致病机理 | 第21-23页 |
| 1.6 诊断 | 第23-26页 |
| 1.7 防制 | 第26-27页 |
| 1.8 猪鼻支原体研究进展 | 第27页 |
| 2 本研究的使用价值和理论价值 | 第27-28页 |
| 3 本研究要解决的主要问题 | 第28页 |
| 4 研究方法 | 第28页 |
| 5 技术路线 | 第28-29页 |
| 6.DGE分析流程 | 第29-30页 |
| 第二章 长沙市及周边地区猪喘气病病原流行病学调查及猪鼻支原体分离鉴定 | 第30-42页 |
| 1 前言 | 第30-31页 |
| 2 材料与方法 | 第31-35页 |
| 2.1 菌株 | 第31页 |
| 2.2 样品 | 第31页 |
| 2.3 主要试剂和培养基 | 第31-33页 |
| 2.4 引物 | 第33页 |
| 2.5 主要仪器设备 | 第33页 |
| 2.6 样品采集和处理 | 第33-34页 |
| 2.7 PCR | 第34页 |
| 2.8 猪鼻支原体分离和初步鉴定 | 第34-35页 |
| 3 结果与分析 | 第35-40页 |
| 4 讨论 | 第40-42页 |
| 第三章 猪肺炎支原体诱导猪肺泡巨噬细胞基因差异表达谱研究 | 第42-83页 |
| 1 前言 | 第44页 |
| 2 材料与方法 | 第44-52页 |
| 2.1 菌株 | 第44页 |
| 2.2 仔猪肺 | 第44页 |
| 2.3 支气管肺泡灌洗用溶液 | 第44-45页 |
| 2.4 主要仪器设备 | 第45页 |
| 2.5 PAM分离培养 | 第45页 |
| 2.6 Mhp与PAM最佳孵育比例确定 | 第45-46页 |
| 2.7 Mhp刺激PAM的数字基因表达谱研究 | 第46-52页 |
| 2.7.1 Mhp与PAM共同孵育 | 第46-47页 |
| 2.7.2 PAM的数字基因表达谱测序 | 第47页 |
| 2.7.3 建库测序流程 | 第47-48页 |
| 2.7.4 生物信息分析流程 | 第48-50页 |
| 2.7.5 差异基因数据统计分析 | 第50页 |
| 2.7.6 差异基因GO分析 | 第50页 |
| 2.7.7 差异基因KEGG分析 | 第50-51页 |
| 2.7.8 差异基因网络互作IPA分析 | 第51页 |
| 2.7.9 差异基因编码蛋白网络互作STRING分析 | 第51-52页 |
| 2.8 荧光定量PCR验证基因差异表达 | 第52页 |
| 3 结果与分析 | 第52-74页 |
| 3.1 PAM分离培养 | 第52页 |
| 3.2 Mhp与PAM最佳孵育比例确定 | 第52-53页 |
| 3.3 Mhp刺激PAM基因差异表达谱分析 | 第53-73页 |
| 3.3.1 样品RNA检测结果 | 第53-54页 |
| 3.3.2 测序序列数据质量评估 | 第54页 |
| 3.3.3 参考序列对比分析 | 第54页 |
| 3.3.4 RNA-seq整体质量评估 | 第54-55页 |
| 3.3.5 基因差异表达数据统计分析 | 第55-59页 |
| 3.3.6 差异基因GO分析 | 第59-60页 |
| 3.3.7 差异基因KEGG分析 | 第60-71页 |
| 3.3.8 差异基因网络互作IPA分析 | 第71-72页 |
| 3.3.9 差异基因编码蛋白网络互作STRING分析 | 第72-73页 |
| 3.4 新发现与Mhp感染相关的差异表达基因 | 第73页 |
| 3.5 QPCR检测差异表达基因结果 | 第73-74页 |
| 4 讨论 | 第74-83页 |
| 4.1 Mhp诱导PAM活化及相关信号通路 | 第74-75页 |
| 4.2 PAM诱导细胞因子产生及相关病理变化解析 | 第75-80页 |
| 4.3 PAM诱导Mhp活化启动内吞作用 | 第80-82页 |
| 4.4 PAM诱导Mhp活化启抗原递呈和加工程序 | 第82-83页 |
| 第四章 全文总结与创新点 | 第83-84页 |
| 1 全文总结 | 第83页 |
| 2 全文创新点 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-102页 |
| 附录 | 第102-128页 |
| 缩略语表 | 第128-129页 |
| 致谢 | 第129-130页 |
| 作者简历 | 第130-131页 |
| 在读期间科研学术成果目录 | 第131页 |
