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Candida glycerinogenes渗透压调控型整合表达体系的研究及其应用

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第11-17页
    1.1 酵母菌表达系统第11-13页
        1.1.1 以rRNA为介导的整合载体第11页
        1.1.2 酵母表达系统构建第11-13页
    1.2 酵母高效表达系统的研究进展第13页
        1.2.1 S. cerevisiae的稳定高效表达系统第13页
        1.2.2 P. pastoris的稳定高效表达系统第13页
        1.2.3 其它酵母的稳定高效表达系统第13页
        1.2.4 工业酵母菌的遗传修饰研究进展第13页
    1.3 酵母转化方法研究进展第13页
    1.4 产甘油假丝酵母简介第13-14页
        1.4.1 酵母细胞的渗透压调解第14页
        1.4.2 C. glycerinogenes分子生物学方面的研究现状第14页
    1.5 GAP启动子的研究第14页
    1.6 酵母基因组中外源基因的拷贝数第14页
    1.7 2A肽在生物医药和生物技术中的研究进展第14-15页
    1.8 生物质能源的利用-木糖的代谢途径第15-16页
        1.8.1 酵母细胞中的木糖代谢第15页
        1.8.2 木糖醇的用途概述第15-16页
    1.9 本论文的立题依据及主要研究内容第16-17页
        1.9.1 立题依据和研究意义第16页
        1.9.2 主要研究内容第16-17页
第二章 重组整合型表达载体启动子获得及功能分析第17-31页
    2.1 引言第17页
    2.2 材料与方法第17-21页
        2.2.1 菌株及其培养条件第17页
        2.2.2 试剂及工具酶第17-18页
        2.2.3 主要使用仪器第18页
        2.2.4 C. glycerinogenes基因组DNA的提取第18页
        2.2.5 简并引物设计及CgGAP基因保守序列的获得第18-19页
        2.2.6 大肠杆菌感受态细胞制备及转化第19页
        2.2.7 质粒DNA的提取及验证第19页
        2.2.8 酵母总RNA的提取方法第19页
        2.2.9 酵母总RNA的纯化及反转录第19-20页
        2.2.10 CgGAP基因及其启动子全序列的获得第20页
        2.2.11 CgGAP基因的序列测定与生物信息学分析第20页
        2.2.12 CgGAP启动子的功能分析第20-21页
    2.3 结果第21-30页
        2.3.1 CgGAP基因保守序列的获得第21页
        2.3.2 CgGAP基因受渗透压调控荧光定量PCR分析第21-22页
        2.3.3 渗透压调控型启动子序列的获得第22页
        2.3.4 CgGAP基因的生物信息学分析第22-27页
        2.3.5 CgGAP启动子结构对比分析第27-28页
        2.3.6 渗透压调控型CgGAP启动子异源表达功能分析第28-30页
    2.4 本章小结第30-31页
第三章 渗透压调控型重组整合型表达载体构建及特性的研究第31-45页
    3.1 引言第31页
    3.2 材料与方法第31-35页
        3.2.1 实验中使用的菌株、质粒及培养方法第31页
        3.2.2 试剂及工具酶第31页
        3.2.3 主要实验仪器第31-32页
        3.2.4 重组整合表达载体整合位点的获得第32页
        3.2.5 Zeocin筛选标记的验证分析第32页
        3.2.6 渗透压调控型重组整合表达载体的构建第32-33页
        3.2.7 转化质粒的中量制备及质粒的酶切验证第33-34页
        3.2.8 C. glycerinogenes感受态细胞的制备及电转化第34页
        3.2.9 重组整合表达载体转化子的验证第34页
        3.2.10 重组整合C. glycerinogenes转化子稳定性分析第34-35页
        3.2.11 重组C. glycerinogenes绿色荧光蛋白表达强度的检测第35页
    3.3 结果与讨论第35-44页
        3.3.1 重组整合表达载体整合位点 5.8S rRNA序列的获得第35-36页
        3.3.2 筛选标记zeocin的可行性分析第36-37页
        3.3.3 C. glycerinogenes重组整合表达载体的构建第37-38页
        3.3.4 绿色荧光蛋白基因gfp作为重组整合表达载体报告基因的分析第38-40页
        3.3.5 重组整合表达载体整合C. glycerinogenes基因组第40-41页
        3.3.6 重组整合表达载体pURGAP-gfp、pURGPD-gfp荧光强度的检测第41页
        3.3.7 重组整合C. glycerinogenes的稳定性分析第41-42页
        3.3.8 重组整合表达载体对重组C. glycerinogenes生长的影响第42页
        3.3.9 质粒浓度重组整合表达载体整合效率的影响第42-43页
        3.3.10 整合载体插入外源基因片段的大小对重组整合效率的影响第43页
        3.3.11 重组整合表达载体同源臂长度的影响第43-44页
    3.4 本章小结第44-45页
第四章 重组整合表达载体转化体系的研究及优化第45-56页
    4.1 引言第45页
    4.2 材料与方法第45-47页
        4.2.1 试剂及工具酶第45页
        4.2.2 主要实验仪器第45页
        4.2.3 主要溶液的配制第45-46页
        4.2.4 C. glycerinogenes原生质体的制备第46页
        4.2.5 C. glycerinogenes原生质体的再生第46-47页
        4.2.6 C. glycerinogenes原生质体转化方法的建立第47页
    4.3 结果和分析第47-55页
        4.3.1 C. glycerinogenes原生质体的制备第47-52页
        4.3.2 C. glycerinogenes原生质体的再生第52-53页
        4.3.3 原生质体转化方法的建立及优化第53-54页
        4.3.4 绿色荧光蛋白的鉴定第54-55页
    4.4 本章小结第55-56页
第五章 重组整合表达体系渗透压调控性能评估第56-72页
    5.1 引言第56页
    5.2 材料与方法第56-58页
        5.2.1 菌株及载体第56页
        5.2.2 渗透压培养基第56页
        5.2.3 不同来源GAP基因启动子的获得第56-57页
        5.2.4 大肠杆菌感受态细胞的制备及转化第57页
        5.2.5 C. glycerinogenes原生质体的制备及转化第57页
        5.2.6 重组菌绿色荧光蛋白gfp基因拷贝数的确定第57-58页
        5.2.7 重组C. glycerinogenes SDS-PAGE全细胞电泳分析第58页
        5.2.8 C. glycerinogenes阳性转化子发光特性和荧光强度的检测第58页
    5.3 结果与讨论第58-71页
        5.3.1 不同酵母来源GAP启动子重组整合表达载体的构建第58-59页
        5.3.2 整合载体绿色荧光蛋白gfp基因拷贝数的确定第59-60页
        5.3.3 重组菌SDS-PAGE全细胞电泳分析第60-61页
        5.3.4 不同浓度的NaCl对重组整合载体启动子的诱导作用第61-62页
        5.3.5 底物葡萄糖对重组整合载体启动子的渗透压诱导第62-64页
        5.3.6 不同浓度的KCl作为渗透压诱导剂对整合表达载体启动子的调解作用第64-66页
        5.3.7 山梨醇对重组整合表达载体的渗透压诱导作用第66-67页
        5.3.8 发酵产物小分子相溶物质甘油对重组整合表达载体启动子的影响第67-69页
        5.3.9 重组整合表达载体在不同温度下的应激反应第69-70页
        5.3.10 pH值对重组整合表达载体表达的影响第70-71页
    5.4 本章小结第71-72页
第六章 渗透压调控型整合表达体系木糖代谢工程菌中的应用第72-92页
    6.1 引言第72页
    6.2 材料与方法第72-75页
        6.2.1 菌株和质粒第72页
        6.2.2 工具酶与试剂第72-73页
        6.2.3 培养基及培养条件第73页
        6.2.4 代谢木糖重组整合载体的构建第73页
        6.2.5 PCR扩增反应体系及反应条件第73页
        6.2.6 大肠杆菌感受态细胞的制备及转化第73页
        6.2.7 质粒DNA的提取第73-74页
        6.2.8 C. glycerinogenes感受态的制备及转化第74页
        6.2.9 C. glycerinogenes的基因组提取第74页
        6.2.10 重组C. glycerinogenes的验证第74页
        6.2.11 重组整合载体XYL1、XYL2基因拷贝数的确定第74页
        6.2.12 酶活的测定方法第74-75页
    6.3 结果与讨论第75-90页
        6.3.1 C. glycerinogenes代谢木糖重组表达载体的构建第75-76页
        6.3.2 重组C. glycerinogenes的验证第76-77页
        6.3.3 重组菌中XYL1、XYL2基因拷贝数的确定第77页
        6.3.4 重组C. glycerinogenes全细胞蛋白SDS-PAGE电泳分析第77-78页
        6.3.5 NADH标准曲线的制作第78页
        6.3.6 蛋白浓度标准曲线的制作第78页
        6.3.7 C. glycerinogenes中表达木糖醇脱氢酶XYL2基因生产甘油第78-84页
        6.3.8 表达木糖醇脱氢酶XYL2基因重组菌酶活的测定第84-85页
        6.3.9 C. glycerinogenes中过量表达木糖还原酶XYL1基因发酵木糖第85-90页
    6.4 本章小结第90-92页
主要结论与展望第92-94页
    主要结论第92-93页
    展望第93-94页
论文主要创新点第94-95页
致谢第95-96页
参考文献第96-105页
附录: 作者在攻读博士学位期间发表的论文第105页

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