| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 引言：群落构建机制 | 第14-33页 |
| 1.1 环境过滤 | 第15-21页 |
| 1.1.1 环境过滤的基础：生态位差异 | 第16页 |
| 1.1.2 环境过滤的种群水平效应：生境关联 | 第16-18页 |
| 1.1.3 环境过滤的群落水平效应：特征趋同及谱系聚集 | 第18-20页 |
| 1.1.4 环境过滤与物种多样性：Hutchinson悖论 | 第20-21页 |
| 1.2 负密度制约 | 第21-30页 |
| 1.2.1 何为负密度制约? | 第21-23页 |
| 1.2.2 负密度制约是否普遍存在? | 第23-26页 |
| 1.2.3 负密度制约能否促进物种多样性? | 第26-30页 |
| 1.3 本文拟解决的科学问题 | 第30-31页 |
| 1.4 本文的研究内容及意义 | 第31-33页 |
| 第二章 种群水平：空间遗传结构揭示环境过滤在植物发育后期阶段的主导作用 | 第33-84页 |
| 2.1 前言 | 第33-35页 |
| 2.2 概念框架 | 第35-38页 |
| 2.2.1 基于有效种子扩散的概念框架 | 第35-37页 |
| 2.2.2 结合种群空间遗传结构改进后的概念框架 | 第37-38页 |
| 2.3 研究地点和材料 | 第38-40页 |
| 2.4 研究方法 | 第40-54页 |
| 2.4.1 微卫星引物开发及基因分型 | 第40-41页 |
| 2.4.2 亲本分析 | 第41-43页 |
| 2.4.2.1 检验并校正哑等位基因 | 第41-42页 |
| 2.4.2.2 双亲分析 | 第42-43页 |
| 2.4.3 空间遗传结构分析 | 第43-47页 |
| 2.4.3.1 空间自相关 | 第44-46页 |
| 2.4.3.2 基因扩散距离 | 第46-47页 |
| 2.4.4 基于个体的空间明晰模拟 | 第47-54页 |
| 2.4.4.1 成体→幼苗 | 第47-50页 |
| 2.4.4.2 幼苗→成体 | 第50-54页 |
| 2.5 研究结果 | 第54-68页 |
| 2.5.1 亲本分析 | 第54-56页 |
| 2.5.2 空间自相关 | 第56-57页 |
| 2.5.3 空间遗传结构模拟 | 第57-68页 |
| 2.5.3.1 成体→幼苗 | 第57-61页 |
| 2.5.3.2 幼苗→成体 | 第61-68页 |
| 2.6 讨论 | 第68-83页 |
| 2.6.1 基因流 | 第69-77页 |
| 2.6.1.1 亲本分析和当代基因流 | 第69-72页 |
| 2.6.1.2 空间自相关和历史基因流 | 第72-75页 |
| 2.6.1.3 当代和历史基因流的比较 | 第75-77页 |
| 2.6.2 幼苗至成体空间遗传结构转变的机制 | 第77-81页 |
| 2.6.2.1 历史因素 | 第78-79页 |
| 2.6.2.2 世代重叠 | 第79页 |
| 2.6.2.3 负密度制约和环境过滤 | 第79-81页 |
| 2.6.3 发育后期阶段的负密度制约和环境过滤 | 第81-83页 |
| 2.7 小结 | 第83-84页 |
| 第三章 群落水平：最近邻体格局揭示负密度制约和环境过滤分别主导植物发育早期和后期阶段 | 第84-103页 |
| 3.1 前言 | 第84-87页 |
| 3.2 概念框架 | 第87-91页 |
| 3.2.1 最近邻体对 | 第87-88页 |
| 3.2.2 零模型与科学假说 | 第88-91页 |
| 3.3 数据集和研究方法 | 第91-93页 |
| 3.4 研究结果 | 第93-96页 |
| 3.5 讨论 | 第96-102页 |
| 3.5.1 研究方法的优点与不足 | 第96-99页 |
| 3.5.2 负密度制约是否形成群落代偿趋势? | 第99-101页 |
| 3.5.3 负密度制约和环境过滤随植物发育的角色转换 | 第101-102页 |
| 3.6 小结 | 第102-103页 |
| 第四章 负密度制约和环境过滤在谱系上的延伸 | 第103-125页 |
| 4.1 前言 | 第103-105页 |
| 4.2 材料和方法 | 第105-110页 |
| 4.2.1 研究地点和采样 | 第105页 |
| 4.2.2 DNA提取、扩增及测序 | 第105-106页 |
| 4.2.3 序列处理及系统进化树构建 | 第106-109页 |
| 4.2.4 最近邻体对的谱系结构分析 | 第109-110页 |
| 4.3 研究结果 | 第110-114页 |
| 4.3.1 遗传距离和系统发育树 | 第110页 |
| 4.3.2 最近邻体对的谱系结构 | 第110-114页 |
| 4.4 讨论 | 第114-124页 |
| 4.4.1 植物DNA条形码 | 第115-117页 |
| 4.4.2 两种零模型的比较 | 第117-119页 |
| 4.4.3 最近邻体对的谱系结构揭示谱系排斥和谱系吸引 | 第119-123页 |
| 4.4.4 生态位进化保守性 | 第123-124页 |
| 4.5 小结 | 第124-125页 |
| 第五章 结论与展望 | 第125-127页 |
| 参考文献 | 第127-169页 |
| 附录 | 第169-183页 |
| 致谢 | 第183-184页 |
| 作者简介 | 第184页 |
