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基于12S、16S rDNA和Cyt b基因部分序列云南23种鲤科鱼类的分子系统发育研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第1章 文献综述第10-21页
    1.1 动物分类学与分子系统发育第10-13页
        1.1.1 分子标记的选择第10-13页
    1.2 鲤科鱼类各亚科间的系统发育研究现状第13-20页
        1.2.1 基于形态解剖学现状对我国鲤科鱼类的研究第13-15页
        1.2.2 云南鲤科鱼类基于形态解剖学现状的研究第15-16页
        1.2.3 我国鲤科鱼类基于分子系统学的研究概况第16-19页
        1.2.4 云南鲤科鱼类的分子系统发育研究第19-20页
    1.3 研究目的和意义第20-21页
第2章 材料与方法第21-26页
    2.1 标本的采集、保存和鉴定第21-23页
        2.1.1 标本的采集与保存第21页
        2.1.2 标本数量与来源第21页
        2.1.3 实验用品第21-23页
    2.2 总DNA的提取第23-24页
    2.3 PCR扩增第24页
        2.3.1 12S rDNA引物的设计和PCR扩增第24页
        2.3.2 16S rDNA引物的设计和PCR扩增第24页
        2.3.3 Cyt b引物的设计和PCR扩增第24页
    2.4 PCR产物检测第24-25页
    2.5 序列的分析第25-26页
        2.5.1 序列拼接和提交GenBank第25页
        2.5.2 序列组成和分析第25页
        2.5.3 构建系统发育树第25-26页
第3章 研究结果第26-48页
    3.1 PCR产物的检测第26-27页
    3.2 12S rDNA基因序列分析第27-32页
        3.2.1 12S r DNA基因序列长度第27-28页
        3.2.2 序列的碱基组成和变异分析第28-29页
        3.2.3 云南23种鲤科鱼类的遗传距离第29-32页
    3.3 16S rDNA基因序列分析第32-36页
        3.3.1 16S rDNA基因序列长度第32页
        3.3.2 序列的碱基组成和变异分析第32页
        3.3.3 云南23种鲤科鱼类的遗传距离分析第32-36页
    3.4 Cyt b基因序列分析第36-40页
        3.4.1 Cyt b基因序列长度第36页
        3.4.2 序列的碱基组成和变异分析第36页
        3.4.3 云南23种鲤科鱼类的遗传距离分析第36-40页
    3.5 系统树的构建第40-48页
        3.5.1 基于 12S rDNA+16S rDNA基因序列的系统发育关系第40-44页
        3.5.2 基于Cyt b基因序列构建的邻接树(Neighbor-joining Tree , NJ)第44-45页
        3.5.3 基于 12S+16S r DNA+Cyt b基因序列构建的NJ树第45-48页
第4章 讨论第48-57页
    4.1 鲤科大支系的划分第48页
    4.2 雅罗鱼系各亚科间的系统发育关系第48-51页
        4.2.1(鱼丹)亚科的系统发育第48-49页
        4.2.2 鲌亚科的系统发育第49-50页
        4.2.3 鯝亚科的系统发育第50页
        4.2.4 鮈亚科的系统发育第50-51页
    4.3 鲃系各亚科间的系统发育关系第51-55页
        4.3.1 鲃系的系统发育第51-52页
        4.3.2 鲃亚科的系统发育第52-53页
        4.3.3 裂腹鱼亚科的系统发育第53-54页
        4.3.4 鲤亚科的系统发育第54-55页
    4.4 结论第55-57页
参考文献第57-63页
附录第63-103页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第103-104页
致谢第104页

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