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禽致病性大肠杆菌E058株在鸡感染模型中的转录组学分析及sodA基因功能和致病性评价

中文摘要第2-4页
Abstract第4-6页
符号说明第11-13页
第一章 文献综述第13-23页
    1 禽致病性大肠杆菌概述第13-14页
    2 禽致病性大肠杆菌的主要毒力因子第14-18页
        2.1 黏附素(Adhesins)第14-15页
        2.2 铁摄取系统(Iron acquisition systems)第15-16页
        2.3 溶血素第16页
        2.4 血清抗性蛋白(Increased serum survival,Iss)第16页
        2.5 大肠杆菌素(Colicins)第16-17页
        2.6 荚膜(Capsule)第17页
        2.7 毒素(Toxins)第17页
        2.8 脂多糖(LPS)第17页
        2.9 外膜蛋白(Outer membrane proteins, OMPs)第17-18页
    3 sodA基因的研究进展第18-19页
    4 大肠杆菌基因编辑研究进展第19-21页
    5 大肠杆菌生物被膜研究进展第21-23页
第二章 DNA芯片分析禽致病性大肠杆菌O2血清型菌株E058在感染鸡体内的转录组学第23-39页
    1 材料第23-25页
        1.1 菌株和质粒第23-24页
        1.2 主要试剂第24页
        1.3 主要仪器第24页
        1.4 分子生物学及数据分析软件第24-25页
        1.5 试验动物第25页
    2 方法第25-29页
        2.1 菌体的准备第25页
        2.2 细菌总RNA的提取第25-26页
        2.3 基因组DNA的去除反应第26页
        2.4 反转录反应第26页
        2.5 cDNA标记和杂交第26页
        2.6 cDNA的荧光定量PCR第26-28页
        2.7 突变株构建及1日龄雏鸡半数致死量试验第28-29页
    3 结果第29-37页
        3.1 APEC E058株在感染鸡体内的基因转录表达谱第29-34页
        3.2 参与代谢过程的基因表达第34页
        3.3 细胞外基质成分的表达第34-35页
            3.3.1 荚膜和脂多糖第34页
            3.3.2 外膜蛋白(OMPs)第34页
            3.3.3 菌毛第34-35页
        3.4 铁摄取系统的表达第35页
        3.5 参与应激反应基因的表达第35-36页
        3.6 参与转录的基因调控第36页
        3.7 半数致死量(LD_(50))结果第36-37页
    4 讨论第37-39页
第三章 APEC sodA基因突变株的构建及其致病性的评价第39-57页
    1 材料第39-41页
        1.1 菌株和质粒第39-40页
        1.2 主要试剂第40页
        1.3 溶液配制第40页
        1.4 主要仪器第40-41页
        1.5 分子生物学及数据分析软件第41页
        1.6 试验动物第41页
    2 方法第41-48页
        2.1 sodA-Cat片段的扩增第41-42页
        2.2 将sodA-Cat片段电转化入感受态细胞中构建突变株第42-43页
            2.2.1 电转化感受态细胞的制备第42页
            2.2.2 质粒pKD46的转化第42页
            2.2.3 Red重组功能的诱导和感受态细胞的制备第42页
            2.2.4 电转化构建突变株第42-43页
            2.2.5 质粒pKD46的消除第43页
        2.3 突变株的回复拯救试验第43-45页
            2.3.1 sodA完整基因片段及其启动子序列的扩增第43页
            2.3.2 重组质粒pACYC184-sodA的构建第43-44页
            2.3.3 回复拯救株的获得第44-45页
        2.4 突变株生物学特性的研究第45-46页
            2.4.1 细菌在普通LB培养基中生长曲线的测定第45页
            2.4.2 体外竞争试验第45页
            2.4.3 SPF鸡血清杀菌试验第45页
            2.4.4 菌株生物被膜检测第45-46页
            2.4.5 环境应激实验第46页
            2.4.6 体外抗氧化应激实验第46页
        2.5 突变株致病性的研究第46-48页
            2.5.1 半数致死量(LD_(50))试验第46-47页
            2.5.2 体内动态分布试验第47页
            2.5.3 HD-11细胞的吞噬试验第47页
            2.5.4 胞内细菌增殖试验第47-48页
    3 结果第48-55页
        3.1 sodA-Cat片段的扩增结果第48页
        3.2 突变株E058ΔsodA的鉴定第48页
        3.3 突变株的回复拯救结果第48-50页
        3.4 突变株生物学特性的研究结果第50-53页
            3.4.1 E058及突变株在LB液体培养基中的生长曲线第50页
            3.4.2 体外竞争结果第50-51页
            3.4.3 SPF鸡血清杀菌试验结果第51页
            3.4.4 菌株生物被膜检测第51-52页
            3.4.5 环境应激实验结果第52页
            3.4.6 体外抗氧化应激实验结果第52-53页
        3.5 突变株致病性的研究第53-55页
            3.5.1 半数致死量(LD50)试验第53页
            3.5.2 体内动态分布试验第53-54页
            3.5.3 HD-11细胞的吞噬试验第54-55页
            3.5.4 胞内细菌增殖试验第55页
    4 讨论第55-57页
全文结论第57-58页
参考文献第58-73页
致谢第73-74页
攻读学位期间发表的学术论文目录第74-75页

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