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Fostriecin生物合成基因簇的异源表达研究

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
1 绪论第12-33页
    1.1 聚酮类化合物的研究概述第12-16页
        1.1.1 聚酮类化合物及其聚酮合酶第12-13页
        1.1.2 聚酮类化合物的生物合成机制第13-15页
        1.1.3 聚酮类化合物的组合生物合成第15-16页
    1.2 Fostriecin研究概述第16-19页
        1.2.1 Fostriecin的结构及构效关系第16-18页
        1.2.2 Fostriecin抗肿瘤作用机制第18页
        1.2.3 Fostriecin的化学合成第18-19页
        1.2.4 Fostriecin生物合成机制第19页
    1.3 异源表达研究第19-24页
        1.3.1 异源表达宿主的选择第20-22页
        1.3.2 天然产物的异源表达第22-23页
        1.3.3 聚酮化合物的异源表达第23-24页
    1.4 Red/ET同源重组技术第24-31页
        1.4.1 Red/ET同源重组系统第25-26页
        1.4.2 Red/ET同源重组工程的应用第26-28页
        1.4.3 Red/ET技术用于大片段的拼接第28页
        1.4.4 Red/ET技术用于筛选标记构建第28-31页
    1.5 本论文选题依据和主要研究内容第31-33页
        1.5.1 选题依据与意义第31页
        1.5.2 研究目的与研究内容第31-33页
2 Fostriecin生物合成基因簇的序列分析第33-37页
    2.1 引言第33页
    2.2 实验材料与方法第33-34页
        2.2.1 实验材料第33页
        2.2.2 Fostriecin生物合成基因簇序列的分析第33-34页
        2.2.3 Fostriecin生物合成基因簇NCBI序列号申请第34页
    2.3 结果与讨论第34-36页
        2.3.1 Fostriecin生物合成基因簇分析第34-35页
        2.3.2 Fostriecin的生物合成途径分析第35-36页
    2.4 本章小结第36-37页
3 筛选标记及表达载体的构建第37-54页
    3.1 引言第37页
    3.2 实验材料与方法第37-45页
        3.2.1 实验材料第37-38页
        3.2.2 主要仪器与试剂第38-40页
        3.2.3 大肠杆菌的培养以及保藏第40-41页
        3.2.4 大肠杆菌中DNA的提取与纯化第41-42页
        3.2.5 目的片段的PCR扩增及纯化第42页
        3.2.6 限制性内切酶酶切反应及琼脂糖凝胶电泳第42-43页
        3.2.7 感受态细胞的制备及转化第43-44页
        3.2.8 目的片段的定向克隆第44-45页
    3.3 结果与讨论第45-52页
        3.3.1 正负筛选标记pRC的构建第45-47页
        3.3.2 表达载体pMT和pCT的构建第47-50页
        3.3.3 表达载体p184的构建第50-51页
        3.3.4 表达载体p184与pMT的共存第51-52页
    3.4. 本章小结第52-54页
4 Fostriecin聚酮合酶(PKSs)大肠杆菌异源表达第54-75页
    4.1 引言第54-55页
    4.2 实验材料与方法第55-59页
        4.2.1 实验材料第55页
        4.2.2 主要仪器与试剂第55-56页
        4.2.3 链霉菌中基因组DNA的提取方法第56-57页
        4.2.4 低熔点琼脂糖凝胶中大片段DNA的操作方法第57页
        4.2.5 质粒DNA的去磷酸化以及平末端片段的克隆第57-58页
        4.2.6 重组转化子中目的片段的鉴定第58页
        4.2.7 目的基因簇在大肠杆菌中的表达第58页
        4.2.8 目的化合物的检测第58-59页
    4.3 结果与讨论第59-73页
        4.3.1 重组载体pM-fosAB的构建第59-65页
        4.3.2 p15A复制子表达载体p8-fosAB的构建第65-68页
        4.3.3 ColEl复制子表达载体pM-fosCDEF的构建第68-70页
        4.3.4 Fostriecin聚酮合酶大肠杆菌表达系统的构建第70-71页
        4.3.5 Fostriecin聚酮合酶在大肠杆菌中的异源表达第71-73页
    4.4 本章小结第73-75页
5 Fostriecin聚酮合酶(PKSs)链霉菌异源表达第75-95页
    5.1 引言第75-77页
    5.2 实验材料与方法第77-81页
        5.2.1 实验材料第77页
        5.2.2 主要仪器与试剂第77-78页
        5.2.3 链霉菌的培养以及保藏第78-79页
        5.2.4 链霉菌原生质体的制备及转化第79页
        5.2.5 链霉菌转化子的鉴定第79-80页
        5.2.6 目的基因簇在链霉菌中的表达第80页
        5.2.7 链霉菌中RNA的提取纯化第80页
        5.2.8 RT-PCR第80-81页
    5.3 结果与讨论第81-93页
        5.3.1 整合型表达载体p6-fosAB的构建第81-85页
        5.3.2 游离型表达载体p4-fosCDEF的构建第85-89页
        5.3.3 Fostriecin聚酮合酶链霉菌表达系统的构建第89页
        5.3.4 Fostriecin聚酮合酶在链霉菌中的异源表达第89-93页
    5.4 本章小结第93-95页
6 后修饰基因fosH大肠杆菌异源表达第95-104页
    6.1 引言第95页
    6.2 实验材料与方法第95-99页
        6.2.1 实验材料第95页
        6.2.2 主要仪器与试剂第95-97页
        6.2.3 IPTG诱导目标蛋白表达第97页
        6.2.4 目标蛋白的分离、纯化及浓缩第97页
        6.2.5 SDS-PAGE电泳第97-98页
        6.2.6 Dephosphofostriecin制备纯化及结构鉴定第98-99页
        6.2.7 fosH编码蛋白的活性测定第99页
    6.3 结果与讨论第99-103页
        6.3.1 FosH在大肠杆菌中的异源表达第99-100页
        6.3.2 FosH转化底物的制备与鉴定第100-101页
        6.3.3 FosH活性鉴定及功能定位第101-103页
    6.4 本章小结第103-104页
7 结论与展望第104-106页
    7.1 结论第104-105页
    7.2 展望第105-106页
创新点摘要第106-107页
参考文献第107-115页
附录A 常用仪器一览表第115-116页
附录B 常用试剂一览表第116-118页
附录C 表达系统S.lividansTK24发酵物的HPLC谱图第118-119页
附录D Fostriecin的~1H NMR及~(13)C NMR谱图第119-120页
附录E Dephosphofostriecin的~1H NMR及~(13)C NMR谱图第120-121页
攻读博士学位期间科研项目及科研成果第121-122页
致谢第122-123页
作者简介第123-124页

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