| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-18页 |
| 1.1 双孢蘑菇概况 | 第10-11页 |
| 1.1.1 双孢蘑菇的栽培历史和现状 | 第10-11页 |
| 1.1.2 双孢蘑菇的生活史 | 第11页 |
| 1.2 双孢蘑菇子实体发育相关的研究进展 | 第11-14页 |
| 1.2.1 外界环境 | 第11-13页 |
| 1.2.2 子实体发育形态变化 | 第13页 |
| 1.2.3 生理生化特征 | 第13-14页 |
| 1.3 转录组学 | 第14-17页 |
| 1.3.1 转录组学研究方法概况 | 第14-15页 |
| 1.3.2 真菌子实体发育转录组学研究进展 | 第15-17页 |
| 1.4 本研究的目的及意义 | 第17-18页 |
| 第二章 双孢蘑菇子实体Illumin高通量测序的转录组分析 | 第18-27页 |
| 2.1 实验材料 | 第18-19页 |
| 2.2 实验方法 | 第19-21页 |
| 2.2.1 RNA的提取与质量检测 | 第19-20页 |
| 2.2.2 cDNA文库的构建 | 第20-21页 |
| 2.2.3 库检 | 第21页 |
| 2.2.4 上机测序 | 第21页 |
| 2.3 数据分析 | 第21-23页 |
| 2.3.1 原始数据的质量检测 | 第21-22页 |
| 2.3.2 测序数据质量评估 | 第22页 |
| 2.3.3 与参考基因组序列比对分析 | 第22-23页 |
| 2.4 结果与分析 | 第23-26页 |
| 2.4.1 RNA质量检测 | 第23-24页 |
| 2.4.2 测序产量及质量评估 | 第24-25页 |
| 2.4.3 与参考基因组比对结果 | 第25-26页 |
| 2.5 小结与讨论 | 第26-27页 |
| 第三章 差异基因的基本生物信息学分析 | 第27-31页 |
| 3.1 差异表达基因基本分析 | 第27-28页 |
| 3.1.1 基因表达水平计算 | 第27页 |
| 3.1.2 差异表达基因的筛选 | 第27页 |
| 3.1.3 差异表达基因聚类分析 | 第27-28页 |
| 3.2 结果与分析 | 第28-30页 |
| 3.2.1 基因表达水平结果 | 第28页 |
| 3.2.2 差异基因的筛选结果 | 第28-29页 |
| 3.2.3 差异基因聚类分析结果 | 第29-30页 |
| 3.3 小结与讨论 | 第30-31页 |
| 第四章 差异表达基因的功能分析 | 第31-43页 |
| 4.1 数据分析方法 | 第31-32页 |
| 4.1.1 差异表达基因GO富集分析 | 第31页 |
| 4.1.2 差异表达基因中转录因子分析 | 第31页 |
| 4.1.3 差异表达基因pathway富集分析 | 第31-32页 |
| 4.1.4 实时荧光定量PCR分析 | 第32页 |
| 4.2 结果与分析 | 第32-39页 |
| 4.2.1 GO功能富集分析 | 第32-33页 |
| 4.2.2 差异基因中转录因子结果分析 | 第33-36页 |
| 4.2.3 Pathway代谢通路结果分析 | 第36-39页 |
| 4.3 通过RT-qPCR验证转录组测序表达模式 | 第39-40页 |
| 4.4 讨论 | 第40-43页 |
| 4.4.1 MAPK信号通路过程对双孢蘑菇子实体有性发育的作用 | 第40页 |
| 4.4.2 氨基酸代谢过程对子实体形成的影响 | 第40-41页 |
| 4.4.3 转录因子基因的表达对子实体发育的影响 | 第41页 |
| 4.4.4 差异表达基因的时空表达模式分析 | 第41-43页 |
| 第五章 双孢蘑菇子实体不同时期发育相关基因的比较分析 | 第43-49页 |
| 5.1 材料与方法 | 第43-44页 |
| 5.1.1 材料 | 第43页 |
| 5.1.2 方法 | 第43-44页 |
| 5.2 结果与分析 | 第44-47页 |
| 5.3 讨论 | 第47-49页 |
| 第六章 总结与展望 | 第49-51页 |
| 6.1 论文总结 | 第49-50页 |
| 6.2 展望 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-60页 |
| 作者简介 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
