| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 第一章 引言 | 第13-28页 |
| 1.1 我国甘蓝类蔬菜作物抗根肿病材料筛选 | 第13页 |
| 1.2 野生甘蓝的研究 | 第13-17页 |
| 1.2.1 野生甘蓝分类及起源 | 第14页 |
| 1.2.2 野生甘蓝与栽培甘蓝的关系 | 第14-16页 |
| 1.2.3 野生甘蓝的应用 | 第16-17页 |
| 1.3 高通量测序技术与数量性状定位 | 第17-23页 |
| 1.3.1 Extreme QTL mapping (X-QTL) | 第17-19页 |
| 1.3.2 Mutmap | 第19-21页 |
| 1.3.3 QTL-seq | 第21-23页 |
| 1.4 根肿病抗性基因研究 | 第23-25页 |
| 1.4.1 白菜CR基因研究 | 第23-24页 |
| 1.4.2 甘蓝CR基因研究 | 第24页 |
| 1.4.3 甘蓝型油菜CR基因研究 | 第24-25页 |
| 1.5 抗根肿病机理研究 | 第25-27页 |
| 1.6 本研究的目的与意义 | 第27-28页 |
| 第二章 甘蓝类蔬菜作物根肿病抗源筛选及抗性评价 | 第28-35页 |
| 2.1 材料及方法 | 第28页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第28页 |
| 2.1.2 试验方法 | 第28页 |
| 2.2 结果 | 第28-31页 |
| 2.2.1 先甘 336/托尼×甘蓝/青花菜根肿病抗性鉴定 | 第28-31页 |
| 2.2.2 甘蓝类材料根肿病抗性评价 | 第31页 |
| 2.3 讨论 | 第31-35页 |
| 第三章 青花菜及甘蓝近缘野生种材料重测序分析与INDEL标记开发 | 第35-48页 |
| 3.1 材料及方法 | 第35-38页 |
| 3.1.1 测序材料 | 第35页 |
| 3.1.2 试验方法 | 第35-38页 |
| 3.2 结果 | 第38-45页 |
| 3.2.1 全基因组重测序 | 第38页 |
| 3.2.2 测序数据与参考基因组比对 | 第38-39页 |
| 3.2.3 变异检测与注释 | 第39-41页 |
| 3.2.4 系统进化树构建 | 第41-44页 |
| 3.2.5 双亲间多态性In Del标记开发 | 第44-45页 |
| 3.3 讨论 | 第45-48页 |
| 3.3.1 甘蓝参考基因组 | 第45-46页 |
| 3.3.2 甘蓝全基因组重测序 | 第46页 |
| 3.3.3 基于重测序数据的In Del标记开发利用 | 第46-48页 |
| 第四章 抗根肿病基因定位及候选基因分析 | 第48-61页 |
| 4.1 材料及方法 | 第48-50页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第48页 |
| 4.1.2 试验方法 | 第48-50页 |
| 4.2 结果 | 第50-59页 |
| 4.2.1 抗性遗传分析 | 第50页 |
| 4.2.2 QTL-seq预测控制抗根肿病性状的候选区域 | 第50-52页 |
| 4.2.3 遗传连锁分析缩小定位区间 | 第52-54页 |
| 4.2.4 候选基因预测 | 第54-55页 |
| 4.2.5 候选基因序列分析 | 第55-59页 |
| 4.3 讨论 | 第59-61页 |
| 第五章 青花菜及甘蓝近缘野生种在不同侵染时期对根肿菌响应的比较转录组分析 | 第61-74页 |
| 5.1 材料及方法 | 第61-63页 |
| 5.1.1 试验材料 | 第61页 |
| 5.1.2 试验方法 | 第61-63页 |
| 5.2 结果 | 第63-70页 |
| 5.2.1 发病情况及侵染过程 | 第63-64页 |
| 5.2.2 RNA测序及De novo组装 | 第64页 |
| 5.2.3 qRT-PCR验证 | 第64-65页 |
| 5.2.4 差异基因表达分析、聚类及功能富集 | 第65-67页 |
| 5.2.5 T7时期DEGs功能注释 | 第67页 |
| 5.2.6 T14时期DEGs功能注释 | 第67-68页 |
| 5.2.7 B2013和90196之间与抗性相关的DEGs | 第68-70页 |
| 5.3 讨论 | 第70-74页 |
| 5.3.1 不同类型抗性根肿菌侵染过程不同 | 第70页 |
| 5.3.2 细胞骨架成分与DNA修复在寄主被根肿菌侵染早期起作用 | 第70页 |
| 5.3.3 宿主对根肿菌的防御反应在早期被诱导且相关途径在T14时期受到抑制 | 第70-71页 |
| 5.3.4 根肿菌响应相关的DEGs导致不同基因型发病症状差异 | 第71-74页 |
| 第六章 全文结论 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-86页 |
| 附录 | 第86-111页 |
| 致谢 | 第111-112页 |
| 作者简历 | 第112页 |
