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粳稻云引稻瘟病抗性基因Pi-y43(t)的精细定位和图位克隆

中文摘要第1-10页
ABSTRACT第10-13页
第一章 引言第13-31页
   ·水稻稻瘟病抗性基因研究概况第13-22页
     ·水稻-稻瘟病菌作用机理第13-14页
     ·水稻稻瘟病抗性基因遗传学分析与定位第14-20页
     ·水稻稻瘟病抗性基因克隆及功能研究第20-22页
   ·抗病基因结构及抗病的分子基础第22-25页
     ·抗病基因结构第22-24页
     ·抗病基因作用的分子基础第24-25页
   ·分子生物学技术在抗病育种中的应用第25-28页
     ·分子标记辅助选择进行抗病育种第25-27页
     ·转基因技术进行抗病育种第27-28页
   ·生物信息学的发展应用第28-30页
   ·本项目研究的目的和意义第30-31页
第二章 Pi-y43(t)基因的精细定位第31-40页
   ·材料与方法第32-34页
     ·作图群体第32页
     ·主要的仪器设备和试剂第32页
       ·主要仪器设备第32页
       ·主要的试剂第32页
     ·水稻基因组DNA 提取第32-33页
     ·Pi-y43(t)基因区域物理重叠群的构建第33页
     ·新SSR 标记开发及分析第33-34页
       ·新SSR 标记开发第33-34页
       ·SSR 分析第34页
     ·Pi-y43(t)基因区域精细遗传连锁图及物理图谱的构建第34页
   ·结果第34-38页
     ·Pi-y43(t)基因精细定位第34-35页
     ·Pi-y43(t)基因区域物理重叠群的构建第35-36页
     ·新SSR 标记的开发及多态性分析第36-37页
     ·Pi-y43(t)基因区域精细遗传连锁图及物理图谱的构建第37-38页
   ·讨论第38-40页
     ·与水稻第2 染色体已定位的稻瘟病抗性基因的关系第38页
     ·目标基因区域新标记的开发第38-39页
     ·抗稻瘟病基因区域的连锁不平衡第39-40页
第三章 Pi-y43(t)目标区域的生物信息学分析及候选基因的确定第40-52页
   ·材料与方法第40-46页
     ·实验材料第40-41页
     ·主要仪器设备及试剂药品第41页
       ·主要仪器设备第41页
       ·试剂及药品第41页
     ·目标基因区域的基因预测及序列分析第41页
     ·候选基因的RT-PCR 分析第41-44页
       ·采用Trizol 试剂抽提法提取总RNA第41-42页
       ·RT-PCR 引物第42页
       ·反转录第一条链的合成第42页
       ·RT-PCR 反应第42-44页
     ·PCR 产物回收、连接及转化鉴定第44-46页
       ·PCR 产物回收第44页
       ·PCR 回收产物的连接第44页
       ·连接产物采用化学法转化E.coli DH5α感受态细胞第44-45页
       ·重组质粒的提取与鉴定第45-46页
   ·结果第46-50页
     ·Pi-y43(t)基因区域的预测第46-47页
     ·Pi-y43(t)抗病相关候选基因的确定第47-48页
     ·候选基因的RT-PCR 分析第48-49页
     ·测序及序列分析第49-50页
   ·讨论第50-52页
第四章 稻瘟病抗性基因Pi-y43(t)的图位克隆及序列分析第52-67页
   ·材料与方法第53-56页
     ·植物材料第53页
     ·稻瘟病菌培养及接种方法第53页
       ·稻瘟病菌培养第53页
       ·接种方法第53页
     ·主要试剂及仪器设备第53-54页
       ·主要试剂第53页
       ·仪器设备第53-54页
     ·序列分析软件第54页
     ·基因的克隆测序第54-56页
       ·高质量基因组DNA 提取第54页
       ·引物设计第54-55页
       ·PCR 扩增第55-56页
       ·PCR 产物的回收、连接及转化鉴定第56页
   ·结果与分析第56-65页
     ·候选基因Piy43-3cDNA 的扩增、克隆及测序第56-57页
     ·候选基因Piy43-3 的扩增、克隆及测序第57-60页
     ·云引、Pib 单基因系的人工注射接种第60-61页
     ·Pib 同源基因Pib2 的扩增、克隆及测序第61-63页
     ·云引中Pib 同源基因Pib2 的生物信息学分析第63-65页
   ·讨论第65-67页
     ·关于云引稻瘟病抗性基因Pi-y43(t)第65-66页
     ·进一步的研究设想第66-67页
第五章 结论第67-69页
附录1 常用试剂、溶液配方第69-70页
附录2 缩略表第70-72页
参考文献第72-79页
致谢第79页

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