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柑橘试管苗种质保存及其microRNA鉴定

摘要第1-9页
Abstract第9-12页
第一章 引言第12-21页
 1 柑橘种质资源保存研究进展第12-14页
 2 植物GPX 研究进展第14-16页
 3 miRNA 研究进展第16-19页
   ·miRNA 的生物合成及其作用机制第16-17页
   ·利用高通量测序技术发现植物小分子RNA 研究进展第17-18页
   ·Solexa 测序技术第18-19页
 4 本研究的主要内容及意义第19-21页
   ·研究内容第19-20页
   ·研究意义第20-21页
第二章 福建柑橘种质资源库的扩大收集与离体保存第21-29页
 第一节 柑橘种质资源的进一步收集及部分试管苗再生体系建立第21-24页
  1 柑橘种质资源的进一步收集第21-22页
  2 新收集的柑橘资源试管苗再生体系的建立第22-23页
   ·柑橘资源试管苗再生体系建立过程第22-23页
   ·再生体系建立过程中的注意事项第23页
  3 18 份柑橘种质生长情况的观察第23-24页
 第二节 不同处理对芦柑试管苗保存影响的研究第24-29页
  1 材料与方法第24-25页
   ·材料第24页
   ·方法第24-25页
  2 结果与分析第25-27页
  3 讨论第27-29页
第三章 芦柑试管苗GPX 基因的克隆第29-42页
 1 材料与方法第29-34页
   ·材料第29-30页
     ·供试材料第29页
     ·供试菌种第29页
     ·仪器和试剂第29-30页
   ·方法第30-34页
     ·柑橘试管苗叶片总RNA 的提取方法和浓度检测第30页
     ·柑橘试管苗叶片GPX 基因cDNA 保守区的克隆第30-32页
     ·柑橘试管苗叶片GPX 基因cDNA 的3′RACE 扩增第32-33页
     ·序列拼接第33页
     ·序列分析第33-34页
 2 结果与分析第34-40页
   ·芦柑试管苗叶片总RNA 提取纯度和浓度检测第34页
   ·柑橘试管苗 GPX 基因保守区的克隆第34-36页
   ·柑橘试管苗GPX 基因3’RACE 的克隆第36-38页
   ·柑橘试管苗GPX 基因保守区和3’端的拼接及分析第38-40页
 3 讨论第40-42页
第四章 利用Solexa 测序技术鉴定柑橘试管苗叶片中的小分子 RNA第42-59页
 第一节 柑橘试管苗叶片小RNA 文库的构建与Solexa 测序第42-47页
  1 材料与方法第42-44页
   ·供试材料第42-43页
   ·方法第43-44页
  2 结果与分析第44-46页
   ·柑橘试管苗叶片中sRNA 的种类分布及数量第44-45页
   ·柑橘试管苗叶片sRNA 中unique 序列的长度分布与表达丰度第45-46页
  3 讨论第46-47页
 第二节 柑橘试管苗叶片miRNA 的分析第47-59页
  1 方法第47-48页
   ·保守miRNA 的鉴定第47页
   ·新miRNA 的预测第47页
   ·柑橘试管苗叶片miRNA 靶基因的预测第47-48页
  2 结果与分析第48-54页
   ·柑橘试管苗叶片发育过程中保守miRNAs 的鉴定第48-49页
   ·柑橘试管苗叶片新miRNAs 的预测第49-53页
   ·柑橘试管苗叶片novel miRNAs 靶基因的预测第53-54页
  3 讨论第54-59页
   ·柑橘试管苗叶片发育过程中表达的miRNAs 数量多第54页
   ·柑橘试管苗叶片发育过程中大部分miRNA 为低丰度表达第54-55页
   ·miRNA 及其靶基因在柑橘试管苗叶片发育过程中可能参与的过程第55-58页
   ·undef 家族在柑橘试管苗保存过程中可能起重要的调控作用第58-59页
第五章 小结第59-63页
 1. 芦柑试管苗保存体系的优化第59-60页
 2. 67 份柑桔种质资源的试管苗离体保存第60页
 3. 芦柑试管苗GPX 基因的克隆第60-61页
 4. 利用Solexa 测序技术鉴定柑橘试管苗叶片中的small RNA第61-63页
参考文献第63-69页
图版Ι 柑橘试管苗及其部分种子和果实第69-73页
附表1 柑橘sRNA 文库中的保守miRNA第73-88页
附表2 柑橘sRNA 文库中的miRNA*链第88-108页
附表3 miRNA 靶基因预测第108-116页
附录 在学期间发表论文情况与参加学术会议情况第116-117页
致谢第117页

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