| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-17页 |
| 1.1 研究背景 | 第10-16页 |
| 1.1.1 DNA序列的k-mer频数研究现状 | 第10-13页 |
| 1.1.2 核小体定位研究现状 | 第13-16页 |
| 1.2 论文结构 | 第16-17页 |
| 第二章 酵母核小体核心序列与连接序列的差异分析 | 第17-29页 |
| 2.1 数据集 | 第17-18页 |
| 2.2 研究方法 | 第18-19页 |
| 2.2.1 k-mer相对使用频率 | 第18-19页 |
| 2.2.2 相对使用频率比值的对数 | 第19页 |
| 2.3 结果与分析 | 第19-29页 |
| 2.3.1 k-mer相对使用频率差异 | 第19-20页 |
| 2.3.2 相对频率比值的对数(LRF)分布 | 第20-22页 |
| 2.3.3 LRF与RF-C的关系 | 第22-23页 |
| 2.3.4 k-mer模体按RF-C排列后LRF的分布 | 第23-24页 |
| 2.3.5 LRF分布的局部特征 | 第24-26页 |
| 2.3.6 抽样点附近8-mer的序列特征 | 第26-29页 |
| 第三章 核小体结合模体集合的预测和验证 | 第29-43页 |
| 3.1 数据集 | 第29-30页 |
| 3.1.1 人类基因转录起始序列 | 第29页 |
| 3.1.2 人类DNA序列核小体占据率分布 | 第29-30页 |
| 3.2 研究方法 | 第30-31页 |
| 3.2.1 m核苷的相对频数 | 第30页 |
| 3.2.2 核小体特征量 | 第30-31页 |
| 3.3 核小体结合模体的预测理论 | 第31-34页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第34-43页 |
| 3.4.1 TSS序列上核小体特征量分布 | 第34-38页 |
| 3.4.2 核小体特征量的可靠性分析 | 第38-40页 |
| 3.4.3 TSS区域核小体占据情况的统计 | 第40-43页 |
| 第四章 总结与展望 | 第43-45页 |
| 4.1 工作总结 | 第43-44页 |
| 4.2 工作展望 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 作者攻读博士学位期间发表和完成的论文目录 | 第53页 |