| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 主要符号表 | 第11-12页 |
| 第1章 引言 | 第12-19页 |
| 1.1 鱼类细胞培养的研究进程 | 第13页 |
| 1.2 细胞氧化损伤研究进展 | 第13-16页 |
| 1.2.1 ROS诱导的细胞氧化损伤机制和现状 | 第13-14页 |
| 1.2.2 胞内ROS水平的调控 | 第14-15页 |
| 1.2.3 ROS代谢 | 第15页 |
| 1.2.4 过氧化氢诱导的细胞氧化损伤的研究现状 | 第15-16页 |
| 1.2.5 抗氧化系统 | 第16页 |
| 1.3 转录组学在鱼类上的研究进展 | 第16-17页 |
| 1.3.1 RNA-Seq技术优点 | 第17页 |
| 1.4 本实验研究内容及意义 | 第17-19页 |
| 1.4.1 研究内容 | 第17-18页 |
| 1.4.2 研究意义 | 第18-19页 |
| 第2章 过氧化氢诱导斜带石斑鱼肝细胞氧化模型的构建 | 第19-25页 |
| 2.1 材料和方法 | 第19-20页 |
| 2.1.1 实验鱼饲养管理 | 第19页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第19页 |
| 2.1.3 试验设计 | 第19-20页 |
| 2.1.4 石斑鱼原代肝细胞的培养 | 第20页 |
| 2.1.5 测定指标及方法 | 第20页 |
| 2.1.6 试验数据处理 | 第20页 |
| 2.2 结果 | 第20-22页 |
| 2.2.1 H_2O_2作用浓度和作用时间对肝细胞存活率的影响 | 第20-22页 |
| 2.2.2 以原代肝细胞抗氧化指标验证氧化损伤模型的可靠性 | 第22页 |
| 2.3 讨论 | 第22-23页 |
| 2.4 小结 | 第23-25页 |
| 第3章 过氧化氢诱导斜带石斑鱼肝细胞转录组分析 | 第25-58页 |
| 3.1 材料和方法 | 第25页 |
| 3.1.1 材料 | 第25页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第25页 |
| 3.2 方法 | 第25-28页 |
| 3.2.1 测序原理 | 第25-26页 |
| 3.2.2 提取Total RNA | 第26页 |
| 3.2.3 cDNA文库构建 | 第26页 |
| 3.2.4 Illumina HiSeqTM4000上机测序 | 第26-27页 |
| 3.2.5 数据过滤 | 第27页 |
| 3.2.6 斜带石斑鱼肝细胞总RNA提取及RT-PCR | 第27页 |
| 3.2.7 引物设计 | 第27-28页 |
| 3.3 试验结果 | 第28-55页 |
| 3.3.1 原始数据质量 | 第28-30页 |
| 3.3.2 转录组从头组装 | 第30-33页 |
| 3.3.3 组装后转录组注释 | 第33-37页 |
| 3.3.4 COG注释结果的统计 | 第37页 |
| 3.3.5 GO注释结果统计 | 第37-39页 |
| 3.3.6 KEGG通路注释结果统计 | 第39-41页 |
| 3.3.7 基因表达量分析 | 第41-42页 |
| 3.3.8 PCA分析 | 第42-43页 |
| 3.3.9 表达差异分析 | 第43-46页 |
| 3.3.10 差异基因GO分类统计 | 第46-47页 |
| 3.3.11 差异基因GO富集分析 | 第47-48页 |
| 3.3.12 显著富集GO的层级结构展示 | 第48-49页 |
| 3.3.13 差异基因KEGG通路可视化 | 第49-54页 |
| 3.3.14 差异表达基因的KEGG通路富集分析 | 第54-55页 |
| 3.3.15 qRT-PCR验证结果 | 第55页 |
| 3.4 讨论 | 第55-57页 |
| 3.5 结论 | 第57-58页 |
| 全文总结 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-66页 |
| 在学期间科研成果情况 | 第66页 |
