| 致谢 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 第一章 绪论 | 第22-39页 |
| 1.1 河口系统生态功能及环境现状 | 第22-24页 |
| 1.1.1 河口系统生态功能 | 第22页 |
| 1.1.2 河口生态系统氮超载 | 第22-24页 |
| 1.2 氮循环及其主要生物过程 | 第24-30页 |
| 1.2.1 硝化过程及其生化反应机理 | 第25-28页 |
| 1.2.2 反硝化过程及其生化反应机理 | 第28-30页 |
| 1.3 河口生态系统硝化和反硝化过程及其微生物生态学研究进展 | 第30-36页 |
| 1.3.1 河口生态系统硝化微生物生态学研究现状 | 第30-31页 |
| 1.3.2 河口生态系统反硝化微生物生态学研究现状 | 第31-33页 |
| 1.3.3 微生物生态学研究技术进展 | 第33-34页 |
| 1.3.4 科学问题的提出 | 第34-36页 |
| 1.4 论文研究目标及基本思路 | 第36-39页 |
| 1.4.1 研究目标 | 第36-37页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第37-38页 |
| 1.4.3 技术路线图 | 第38-39页 |
| 第二章 杭州湾河口水体和沉积物理化性质分析 | 第39-55页 |
| 前言 | 第39-40页 |
| 2.1 材料与方法 | 第40-43页 |
| 2.1.1 杭州湾河口水体样品取样点设置及理化因子测定 | 第40-41页 |
| 2.1.2 杭州湾河口沉积物样品取样点设置及理化因子测定 | 第41-42页 |
| 2.1.3 数据分析 | 第42-43页 |
| 2.2 结果 | 第43-52页 |
| 2.2.1 杭州湾河口水体基本理化特性分析 | 第43-51页 |
| 2.2.2 杭州湾河口沉积物基本理化特性分析 | 第51-52页 |
| 2.3 讨论 | 第52-54页 |
| 2.4 本章小结 | 第54-55页 |
| 第三章 杭州湾河口氮循环微生物功能基因丰度及多样性 | 第55-78页 |
| 前言 | 第55-56页 |
| 3.1 材料与方法 | 第56-60页 |
| 3.1.1 杭州湾河口水体样品DNA提取 | 第56-57页 |
| 3.1.2 杭州湾河口沉积物样品DNA提取 | 第57页 |
| 3.1.3 PCR扩增 | 第57-59页 |
| 3.1.4 克隆与测序 | 第59页 |
| 3.1.5 荧光定量PCR | 第59-60页 |
| 3.1.6 数据分析 | 第60页 |
| 3.2 结果 | 第60-72页 |
| 3.2.1 杭州湾河口水体氮循环微生物功能基因丰度分布 | 第60-69页 |
| 3.2.2 杭州湾河口沉积物氮循环微生物功能基因丰度分布 | 第69-72页 |
| 3.3 讨论 | 第72-77页 |
| 3.3.1 悬浮颗粒物为氨氧化细菌在杭州湾河口水体发挥氨氧化作用提供载体 | 第72-73页 |
| 3.3.2 悬浮颗粒物为nirK型反硝化菌在杭州湾河口水体发挥反硝化作用提供载体 | 第73-75页 |
| 3.3.3 硝化/反硝化微生物在杭州湾河口沉积物中的丰度分布特征 | 第75-77页 |
| 3.4 本章小结 | 第77-78页 |
| 第四章 硝化和反硝化菌在悬浮颗粒物上的空间分布特征 | 第78-89页 |
| 前言 | 第78页 |
| 4.1 材料与方法 | 第78-81页 |
| 4.1.1 杭州湾河口水体悬浮颗粒物样品荧光原位定量杂交 | 第78-81页 |
| 4.1.2 杭州湾河口沉积物样品荧光原位定量杂交 | 第81页 |
| 4.2 结果 | 第81-86页 |
| 4.2.1 硝化/反硝化微生物在水体悬浮颗粒物上的空间分布 | 第81-84页 |
| 4.2.2 硝化/反硝化微生物在沉积物中的空间分布 | 第84-86页 |
| 4.3 讨论 | 第86-88页 |
| 4.3.1 硝化/反硝化微生物在水体悬浮颗粒物上的空间分布特征 | 第86-87页 |
| 4.3.2 硝化/反硝化微生物在沉积物中的空间分布特征 | 第87-88页 |
| 4.4 本章小结 | 第88-89页 |
| 第五章 悬浮颗粒物介导的氮循环过程微生物机理 | 第89-113页 |
| 前言 | 第89-90页 |
| 5.1 材料与方法 | 第90-92页 |
| 5.1.1 高通量测序分析 | 第90-91页 |
| 5.1.2 数据分析 | 第91-92页 |
| 5.2 结果 | 第92-107页 |
| 5.2.1 杭州湾河口水体微生物群落结构和多样性 | 第92-101页 |
| 5.2.2 杭州湾河口沉积物微生物群落结构和多样性 | 第101-107页 |
| 5.3 讨论 | 第107-112页 |
| 5.3.1 杭州湾河口水体微生物群落结构分布特征 | 第107-108页 |
| 5.3.2 悬浮颗粒物介导的耦合硝化-反硝化过程微生物机理 | 第108-110页 |
| 5.3.3 杭州湾河口沉积物微生物群落结构分布特征 | 第110-112页 |
| 5.4 本章小结 | 第112-113页 |
| 第六章 结果与展望 | 第113-118页 |
| 6.1 研究结论 | 第113-117页 |
| 6.2 主要创新点 | 第117页 |
| 6.3 不足与展望 | 第117-118页 |
| 参考文献 | 第118-135页 |
| 作者简历、科研成果及奖励 | 第135-137页 |
