| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一章 综述 | 第10-22页 |
| 1 转录组学研究进展 | 第10-16页 |
| ·转录组和转录组学 | 第10页 |
| ·转录组研究技术 | 第10-14页 |
| ·基于杂交的微列阵芯片技术 | 第11-12页 |
| ·基于第一代测序技术的SAGE和MPSS | 第12页 |
| ·基于第二代测序技术的RNA-Seq | 第12-13页 |
| ·基于第三代测序技术的转录组测序 | 第13-14页 |
| ·双壳贝类转录组研究概况 | 第14-16页 |
| ·双壳贝类生长发育相关基因研究 | 第14-15页 |
| ·双壳贝类抗逆相关基因研究 | 第15页 |
| ·双壳贝类抗病相关基因研究 | 第15-16页 |
| 2 双壳贝类基因组研究概况 | 第16-18页 |
| 3 双壳贝类免疫学研究概况 | 第18-19页 |
| ·双壳贝类细胞免疫 | 第18-19页 |
| ·双壳贝类体液免疫 | 第19页 |
| ·双壳贝类神经免疫 | 第19页 |
| 4 牡蛎疱疹病毒研究概况 | 第19-20页 |
| 5 研究目的和意义 | 第20-21页 |
| 6 论文技术路线 | 第21-22页 |
| 第二章 牡蛎疱疹病毒对魁蚶致病性研究 | 第22-32页 |
| 1 实验材料 | 第22-23页 |
| ·实验魁蚶和患病魁蚶 | 第22页 |
| ·主要实验试剂 | 第22页 |
| ·实验仪器 | 第22-23页 |
| 2 实验方法 | 第23-25页 |
| ·患病魁蚶病原检测 | 第23-24页 |
| ·OsHV-1 对魁蚶的预感染实验 | 第24页 |
| ·魁蚶麻醉用MgCl_2浓度及麻醉时间摸索 | 第24页 |
| ·魁蚶攻毒用OsHV-1 浓度及用量摸索 | 第24页 |
| ·OsHV-1 对魁蚶的感染实验 | 第24-25页 |
| ·病毒悬液的制备 | 第24页 |
| ·人工注射感染 | 第24-25页 |
| ·魁蚶感染OsHV-1 后Real-Time PCR检测 | 第25页 |
| ·感染魁蚶组织病理及超微细胞病理观察 | 第25页 |
| ·组织病理切片制备 | 第25页 |
| ·超薄切片样品制备 | 第25页 |
| ·负染样品制备 | 第25页 |
| 3 实验结果 | 第25-30页 |
| ·患病魁蚶症状及检测结果 | 第25-26页 |
| ·OsHV-1 对魁蚶的预感染实验结果 | 第26页 |
| ·魁蚶麻醉用MgCl_2浓度及麻醉时间 | 第26页 |
| ·魁蚶攻毒用OsHV-1 浓度及用量 | 第26页 |
| ·OsHV-1 对魁蚶的感染实验结果 | 第26页 |
| ·魁蚶感染OsHV-1 后REAL-TIME PCR检测结果 | 第26-27页 |
| ·感染魁蚶组织病理观察结果 | 第27-28页 |
| ·感染魁蚶电镜观察结果 | 第28-30页 |
| 4 讨论 | 第30-32页 |
| ·OsHV-1 对魁蚶的致病性 | 第30页 |
| ·魁蚶感染OsHV-1 后病毒的时空分布 | 第30-32页 |
| 第三章 魁蚶血淋巴转录组与基因组测序与分析 | 第32-55页 |
| 1 实验材料 | 第32-33页 |
| ·实验魁蚶 | 第32页 |
| ·主要实验试剂 | 第32-33页 |
| ·主要实验仪器 | 第33页 |
| 2 实验方法 | 第33-39页 |
| ·魁蚶血淋巴转录组测序 | 第33-38页 |
| ·魁蚶血淋巴总RNA提取 | 第34页 |
| ·魁蚶血淋巴总RNA检测 | 第34-35页 |
| ·魁蚶血淋巴双链cDNA的获取 | 第35页 |
| ·魁蚶血淋巴转录组二代测序 | 第35-37页 |
| ·魁蚶血淋巴转录组三代测序 | 第37-38页 |
| ·魁蚶基因组测序 | 第38-39页 |
| ·魁蚶总DNA的提取 | 第38-39页 |
| ·魁蚶总DNA检测 | 第39页 |
| ·魁蚶基因组三代测序 | 第39页 |
| 3 实验结果 | 第39-53页 |
| ·魁蚶血淋巴转录组测序结果 | 第39-47页 |
| ·魁蚶血淋巴总RNA提取结果 | 第39-41页 |
| ·魁蚶血淋巴转录组二代测序结果 | 第41-42页 |
| ·魁蚶血淋巴双链cDNA扩增结果 | 第42页 |
| ·魁蚶血淋巴转录组三代测序结果 | 第42-44页 |
| ·魁蚶血淋巴转录注释结果 | 第44-47页 |
| ·魁蚶基因组测序结果 | 第47-49页 |
| ·魁蚶基因组提取结果 | 第47-48页 |
| ·魁蚶基因组三代测序结果 | 第48-49页 |
| ·魁蚶免疫相关差异表达基因分析 | 第49-53页 |
| ·魁蚶免疫相关差异表达基因的GO富集分析 | 第50-51页 |
| ·魁蚶免疫相关差异表达基因的KEGG富集分析 | 第51-52页 |
| ·魁蚶热休克蛋白 | 第52-53页 |
| ·魁蚶血红蛋白 | 第53页 |
| 4 讨论 | 第53-55页 |
| 结论与展望 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-64页 |
| 攻读硕士其间发表的学术论文 | 第64-67页 |
| 致谢 | 第67页 |