| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 目录 | 第12-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-25页 |
| ·生物进化思想、支序分类学、分子系统学与系统树的重建 | 第14-17页 |
| ·生物进化思想与理论的发展过程简介 | 第14页 |
| ·支序分类学 | 第14-15页 |
| ·分子系统学 | 第15-16页 |
| ·系统发育树的重建方法 | 第16-17页 |
| ·小鲵科的分类地位、生活习性和地理分布、分类学研究历史 | 第17-19页 |
| ·小鲵科的分类地位 | 第17页 |
| ·小鲵科物种的生活习性和地理分布 | 第17页 |
| ·小鲵科物种的分类学研究历史概况 | 第17-18页 |
| ·中国小鲵的发现及形态描述 | 第18-19页 |
| ·舟山岛的中国小鲵 | 第19页 |
| ·线粒体基因组概述 | 第19-24页 |
| ·线粒体基因组结构 | 第19-21页 |
| ·线粒体基因组作为分子标记的特点 | 第21页 |
| ·线粒体基因组在小鲵科系统发育研究中的应用 | 第21-24页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第24-25页 |
| 第二章 中国小鲵线粒体基因组结构分析 | 第25-35页 |
| ·实验材料和仪器 | 第25-26页 |
| ·实验材料 | 第25页 |
| ·主要仪器 | 第25页 |
| ·主要试剂 | 第25-26页 |
| ·缓冲液和主要试剂 | 第26页 |
| ·实验方法 | 第26-30页 |
| ·样品 DNA 的提取 | 第26-27页 |
| ·扩增引物的设计 | 第27-28页 |
| ·PCR 反应 | 第28页 |
| ·PCR 产物纯化及克隆测序 | 第28-29页 |
| ·序列拼接、注释 | 第29-30页 |
| ·实验结果 | 第30-33页 |
| ·讨论 | 第33-35页 |
| 第三章 小鲵科系统发育关系重建及分歧时间估计 | 第35-53页 |
| ·基于线粒体基因组的小鲵科系统发育分析 | 第35-38页 |
| ·线粒体基因组数据的获得 | 第35-37页 |
| ·线粒体基因组序列收集和比对 | 第37页 |
| ·基于线粒体基因组的系统发育分析 | 第37-38页 |
| ·基于 Cytb 基因的小鲵科系统发育分析 | 第38-40页 |
| ·Cytb 基因数据的获得 | 第38-40页 |
| ·Cytb 基因序列比对 | 第40页 |
| ·基于 Cytb 基因的小鲵科系统发育关系分析 | 第40页 |
| ·小鲵科分歧时间估算 | 第40-41页 |
| ·实验结果 | 第41-47页 |
| ·小鲵科物种的遗传距离分析 | 第41-43页 |
| ·基于线粒体基因组的小鲵科的系统发育关系 | 第43-44页 |
| ·基于 Cytb 基因的小鲵科的系统发育关系 | 第44-46页 |
| ·小鲵科的分歧时间分析 | 第46-47页 |
| ·讨论 | 第47-53页 |
| ·小鲵科系统发育关系与起源探讨 | 第47-49页 |
| ·小鲵科同物异名及隐存种问题的探讨 | 第49-50页 |
| ·舟山的中国小鲵的分类地位与起源 | 第50-53页 |
| 结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第61页 |