基于RNA-Seq技术的人转录组分析研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-30页 |
| ·转录组与转录组学 | 第11-13页 |
| ·测序技术进展 | 第13-19页 |
| ·传统测序技术 | 第13页 |
| ·第二代测序技术 | 第13-16页 |
| ·第二代测序技术的应用 | 第16-17页 |
| ·第三代测序技术简介 | 第17-19页 |
| ·RNA-seq技术研究进展 | 第19-28页 |
| ·RNA-Seq技术简介 | 第19-20页 |
| ·RNA-seq技术的分析方法 | 第20-23页 |
| ·RNA-seq技术的分析内容 | 第23-28页 |
| ·本文的研究目的和研究内容 | 第28-30页 |
| ·目的和意义 | 第28页 |
| ·研究内容 | 第28-29页 |
| ·课题受资助情况 | 第29-30页 |
| 第二章 测序数据处理与质控 | 第30-38页 |
| ·实验样品选择 | 第30页 |
| ·测序数据处理与质控的意义 | 第30页 |
| ·测序数据处理 | 第30-31页 |
| ·原始fq序列简介 | 第30-31页 |
| ·原始fq序列处理 | 第31页 |
| ·碱基含量分析 | 第31页 |
| ·测序碱基质量分析 | 第31页 |
| ·与参考序列进行比对分析 | 第31-32页 |
| ·参考序列选取 | 第31-32页 |
| ·比对工具 | 第32页 |
| ·比对结果 | 第32页 |
| ·结果与讨论 | 第32-36页 |
| ·碱基含量分析 | 第32-34页 |
| ·比对统计 | 第34-35页 |
| ·随机性评估 | 第35-36页 |
| ·本章小结 | 第36-38页 |
| 第三章 基因表达注释与差异分析 | 第38-50页 |
| ·基因表达分析的意义 | 第38页 |
| ·分析方法 | 第38-42页 |
| ·基因表达量 | 第38-39页 |
| ·差异分析 | 第39-40页 |
| ·GO功能分析 | 第40-41页 |
| ·KEGG Pathway分析 | 第41-42页 |
| ·结果与讨论 | 第42-49页 |
| ·基因表达注释 | 第42-43页 |
| ·差异分析 | 第43-44页 |
| ·GO富集性分析 | 第44-48页 |
| ·Pathway富集性分析 | 第48-49页 |
| ·本章小结 | 第49-50页 |
| 第四章 基因结构优化与新转录本检测 | 第50-54页 |
| ·基因结构优化与新基因检测的意义 | 第50页 |
| ·分析方法 | 第50-51页 |
| ·对基因结构进行优化 | 第50-51页 |
| ·新转录本检测 | 第51页 |
| ·结果与讨论 | 第51-53页 |
| ·基因结构优化结果 | 第51-52页 |
| ·新转录本检测结果 | 第52-53页 |
| ·本章小结 | 第53-54页 |
| 第五章 可变剪切分析 | 第54-65页 |
| ·可变剪切分析的意义 | 第54页 |
| ·分析方法 | 第54-59页 |
| ·可变剪切的几种类型 | 第54-55页 |
| ·可变剪切的检测方法 | 第55-59页 |
| ·结果与讨论 | 第59-64页 |
| ·A5SS可变剪切 | 第61-62页 |
| ·A3SS可变剪切 | 第62-63页 |
| ·Exon Skipping | 第63-64页 |
| ·Intron Retention | 第64页 |
| ·本章小结 | 第64-65页 |
| 第六章 单核苷酸变异检测 | 第65-71页 |
| ·单核苷酸变异检测(SNP)的意义 | 第65页 |
| ·分析方法 | 第65-67页 |
| ·结果与讨论 | 第67-70页 |
| ·本章小结 | 第70-71页 |
| 第七章 结论与展望 | 第71-73页 |
| ·结论 | 第71-72页 |
| ·展望 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 研究成果 | 第81页 |
