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重要条件致病菌可移动基因组的研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-9页
符号说明第9-10页
1 前言第10-26页
   ·可移动基因组简介第10-21页
     ·基因组岛的进化第10-12页
     ·基因组岛的功能第12-19页
     ·基因组岛的生活环境第19页
     ·鉴定基因组岛的方法第19-20页
     ·定向克隆基因组岛的方法第20-21页
   ·肺炎克雷伯菌第21-22页
     ·肺炎克雷伯菌的基本特征第21页
     ·肺炎克雷伯菌的流行病学研究第21页
     ·克雷伯菌的致病因子第21-22页
   ·铜绿假单胞菌第22-23页
     ·铜绿假单胞菌的基本特征第22页
     ·铜绿假单胞菌的基因组特征第22-23页
     ·铜绿假单胞菌的致病性第23页
   ·本研究的立题依据及采取的技术路线第23-26页
2 材料与方法第26-40页
   ·实验材料第26-30页
     ·菌株和质粒第26-29页
     ·培养基和化学试剂第29页
     ·本实验所用的酶及主要试剂第29-30页
   ·实验方法第30-37页
     ·生物信息学分析第30-31页
     ·菌种培养及保藏第31页
     ·DNA的提取及操作第31-35页
     ·在大肠杆菌中导入外源DNA第35页
     ·酵母醋酸锂转化法第35-36页
     ·酵母菌落原位PCR第36页
     ·tRIP PCR的反应体系及反应条件第36-37页
     ·Long-Range PCR的反应体系及反应条件第37页
   ·实验中使用的引物第37页
   ·测序工作第37-40页
3 结果与讨论第40-67页
   ·耐药性条件致病菌肺炎克雷伯菌的基因组岛分析第40-59页
     ·已测序的肺炎克雷伯菌基因组岛的识别及tRIP PCR引物设计第40-44页
     ·16S rRNA PCR分析第44页
     ·tRIP PCR及Long-Range PCR分析第44-46页
     ·tmRNA基因插入热点基因组岛的研究第46-51页
     ·SGSP PCR结果及分析第51-52页
     ·其它肠杆菌中tmRNA基因位点基因组岛的分布情况第52-55页
     ·构建55_phe基因位点酵母捕捉载体定向克隆基因组岛第55-57页
     ·肺炎克雷伯菌基因池的构建第57-59页
   ·耐药性条件致病菌铜绿假单胞菌的基因组岛分析第59-67页
     ·铜绿假单胞菌基因组岛的搜寻第59-60页
     ·整合型质粒pHS87b第60-61页
     ·铜绿假单胞菌HS87中两个天然质粒的发现及验证第61-62页
     ·序列和注释第62页
     ·氨基糖苷6’-N-乙酰转移酶基因表达菌株的构建和验证第62-64页
     ·毒素/抗毒素系统第64-67页
4 结论第67-68页
5 展望第68-69页
6 参考文献第69-78页
7 攻读硕士学位期间发表论文情况第78-79页
8 致谢第79-80页
附录第80-89页

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