基于拓扑和语义相似性的疾病基因识别算法
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·问题研究背景及意义 | 第7-8页 |
| ·疾病基因识别研究现状 | 第8-10页 |
| ·本文主要研究内容和安排 | 第10-13页 |
| 第二章 疾病基因识别基础 | 第13-25页 |
| ·图的相关概念 | 第13-14页 |
| ·疾病基因识别数据 | 第14-16页 |
| ·蛋白质相互作用网络 | 第14页 |
| ·OMIM 数据库 | 第14-15页 |
| ·疾病基因识别的数据模型 | 第15-16页 |
| ·疾病基因识别方法简介 | 第16-25页 |
| ·基于分类的疾病基因识别方法 | 第16-17页 |
| ·基于模块的疾病基因识别方法 | 第17-19页 |
| ·基于网络传播的疾病基因识别方法 | 第19-22页 |
| ·基于网络比对的疾病基因识别方法 | 第22-25页 |
| 第三章 整合相似性的疾病基因识别方法 | 第25-37页 |
| ·节点的拓扑结构相似性 | 第25-27页 |
| ·节点相似性概念 | 第25-26页 |
| ·基于局部随机游走的相似性计算 | 第26-27页 |
| ·基因的语义相似性 | 第27-31页 |
| ·语义相似性概念 | 第28-29页 |
| ·语义相似性计算 | 第29-31页 |
| ·疾病基因排序算法 | 第31-32页 |
| ·疾病基因排序在疾病模块识别中的应用 | 第32-37页 |
| 第四章 实验结果与分析 | 第37-51页 |
| ·实验数据集 | 第37页 |
| ·参数优化 | 第37-40页 |
| ·交叉验证 | 第37-38页 |
| ·参数选择 | 第38-40页 |
| ·算法有效性验证 | 第40-43页 |
| ·案例分析 | 第43-51页 |
| ·乳腺癌 | 第43-46页 |
| ·II 型糖尿病 | 第46-47页 |
| ·阿尔茨海默病 | 第47-51页 |
| 第五章 总结与展望 | 第51-53页 |
| ·本文总结 | 第51页 |
| ·展望 | 第51-53页 |
| 致谢 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
