海冰细菌Pedobacter arcticus sp.nov.A12~T的功能基因组学研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 第一章 研究背景 | 第11-24页 |
| ·海冰细菌研究现状 | 第11-14页 |
| ·海冰细菌的生态生理学 | 第11页 |
| ·海冰细菌的生态作用 | 第11-12页 |
| ·海冰细菌对低温的适应 | 第12-13页 |
| ·海冰细菌对盐度的适应 | 第13-14页 |
| ·海冰细菌对生境的改造 | 第14页 |
| ·微生物基因组学研究现状 | 第14-22页 |
| ·DNA 测序技术研究发展 | 第14-18页 |
| ·微生物基因组测序研究进展 | 第18-22页 |
| ·本研究的意义 | 第22-24页 |
| 第二章 材料与方法 | 第24-35页 |
| ·实验材料 | 第24-25页 |
| ·菌株 | 第24页 |
| ·培养基 | 第24页 |
| ·主要试剂 | 第24-25页 |
| ·实验方法 | 第25-35页 |
| ·菌株培养 | 第25页 |
| ·基因组 DNA 提取 | 第25-26页 |
| ·上机文库的构建 | 第26-31页 |
| ·下机数据的信息分析 | 第31-35页 |
| 第三章 结果与分析 | 第35-51页 |
| ·A12~T基因组 DNA 提取 | 第35页 |
| ·测序数据与基因组拼接 | 第35-38页 |
| ·测序数据量 | 第35-36页 |
| ·原始数据的过滤 | 第36页 |
| ·组装结果 | 第36-37页 |
| ·15-mer 分析结果 | 第37-38页 |
| ·A12T基因组的注释 | 第38-51页 |
| ·预测基因结果 | 第38-39页 |
| ·重复序列测序结果 | 第39-41页 |
| ·ncRNA 的预测结果 | 第41-43页 |
| ·基因功能注释结果 | 第43-48页 |
| ·基因岛预测结果 | 第48-49页 |
| ·基因组序列提交 | 第49-51页 |
| 第四章 结论 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-63页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第63-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 附件 | 第66页 |