| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 縮略表 | 第10-11页 |
| 1. 前言 | 第11-19页 |
| ·渍水对玉米生产的严重影响以及研究进展 | 第11-13页 |
| ·MICRORNA的重要功能以及与耐渍性的关系 | 第13-14页 |
| ·转录因子的重要功能以及与耐渍性的系 | 第14-15页 |
| ·MIRNA介导的基因调控网络 | 第15-16页 |
| ·高通量测序的研究进展 | 第16-17页 |
| ·酵母单杂交技术的发展与应用研究进展 | 第17-18页 |
| ·本研究的目的、意义与内容 | 第18-19页 |
| 2. 实验材料与方法 | 第19-29页 |
| ·实验材料与渍水处理方法 | 第19页 |
| ·玉米品种渍水抗性鉴定 | 第19页 |
| ·SMRNA的高通量测序及文库构建 | 第19-20页 |
| ·高通量数据分析 | 第20页 |
| ·新MICRORNA及其靶基因的预测方法 | 第20-21页 |
| ·统计学分析方法 | 第21页 |
| ·茎环实时荧光定量PCR | 第21-25页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第25页 |
| ·基因表达的聚类分析方法 | 第25页 |
| ·用5'-RLM-RACE对MIRNA的靶基因剪切位点验证方法 | 第25-27页 |
| ·启动子区顺式元件的预测方法 | 第27页 |
| ·酵母单杂交 | 第27-28页 |
| ·转录组高通量测序 | 第28-29页 |
| 3. 结果与分析 | 第29-62页 |
| ·玉米耐渍表型鉴定 | 第29-31页 |
| ·高通量测序鉴定高耐渍性自交系HZ32中差异表达的已知MIRNA | 第31-37页 |
| ·新MIRNA及其靶基因预测 | 第37-44页 |
| ·成熟MIRNA表达量的定量分析与验证 | 第44-46页 |
| ·MIRNA候选序列的表达谱 | 第46-47页 |
| ·MIRNA靶基因的表达谱 | 第47-52页 |
| ·5’-RLM-RACE验证MIRNA的靶基因剪切位点 | 第52-54页 |
| ·B73中已知MIRNA启动子区顺式调控元件的预测分析 | 第54-57页 |
| ·已知MIRNA介导的基因调控网络 | 第57-58页 |
| ·酵母单杂交对预测转录因子结合位点的验证 | 第58-59页 |
| ·转录组测序分析 | 第59-62页 |
| 4. 讨论 | 第62-70页 |
| ·渍水诱导根系差异表达的MIRNA直接参与了对低氧环境的适应性应答调控 | 第62-63页 |
| ·MIRNA介导的渍害耐受性假说 | 第63-64页 |
| ·MIRNA介导的渍水胁迫响应的信号通路 | 第64-67页 |
| ·MIRNA上游启动子区顺式作用元件分析 | 第67-68页 |
| ·玉米苗期渍水胁迫诱导根系MIRNA快速应答的基因调控网络 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-83页 |
| 附录 | 第83-99页 |
| 已发表论文 | 第99-101页 |
| 致谢 | 第101页 |
