| 中文摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-37页 |
| 1 昆虫滞育的研究进展 | 第15-19页 |
| ·昆虫滞育的诱导因素 | 第15-16页 |
| ·昆虫滞育的生理生化基础 | 第16-18页 |
| ·昆虫滞育的激素调节作用 | 第18-19页 |
| ·昆虫滞育的解除 | 第19页 |
| 2 家蚕滞育发育生物钟蛋白时间间隔测定酶TIME-EA4 的研究进展 | 第19-24页 |
| ·家蚕Time-ea4 的基因与蛋白结构 | 第19-22页 |
| ·家蚕TIME-EA4 的分子测时机制 | 第22-23页 |
| ·本研究室关于家蚕TIME-EA4 的研究历史 | 第23-24页 |
| 3 超氧化物歧化酶（Superoxide Dismutase，SOD）家族的进化研究 | 第24-26页 |
| ·SOD 家族的分类与分布 | 第24-25页 |
| ·SOD 家族基因的结构特征与分子进化 | 第25-26页 |
| 4 昼夜节律生物钟相关基因 | 第26-29页 |
| ·隐花色素基因（Cryptochrome, Cry） | 第26-27页 |
| ·周期蛋白基因（Period, Per） | 第27-28页 |
| ·永恒蛋白基因（Timeless, Tim1）和逾时蛋白基因（Timeout, Tim2） | 第28页 |
| ·时钟蛋白基因（Clock，Clk） | 第28-29页 |
| ·周期循环蛋白基因（Cycle，Cyc）和Bmal 基因 | 第29页 |
| ·旋转蛋白基因（Vrille，Vri） | 第29页 |
| ·Pdp 基因(PAR domain protein) | 第29页 |
| 5 昼夜节律生物钟分子机制 | 第29-35页 |
| ·哺乳动物昼夜节律生物钟分子机制 | 第29-31页 |
| ·昆虫昼夜节律生物钟分子机制 | 第31-35页 |
| 6 家蚕滞育发育生物钟TIME-EA4 与昼夜节律生物钟研究前景展望 | 第35-37页 |
| 第二章 家蚕TIME-EA4 是起源于Cu/Zn SOD 的新型酯酶 | 第37-62页 |
| 第一节 家蚕Time-ea4 同源基因Time-likes 的数据库信息挖掘与克隆 | 第37-44页 |
| 1 材料与方法 | 第37-40页 |
| ·数据资料 | 第37-38页 |
| ·生物信息学分析工具 | 第38-39页 |
| ·方法 | 第39-40页 |
| 2 结果与分析 | 第40-42页 |
| ·Time-likes 的数据库信息挖掘与克隆结果分析 | 第40-41页 |
| ·昆虫物种TIME-likes 蛋白是有别于自身Cu/Zn SOD 的蛋白 | 第41页 |
| ·Time-likes 的电子表达谱分析 | 第41-42页 |
| 3 结论 | 第42-44页 |
| 第二节 家蚕TIME-EA4 的进化踪迹分析 | 第44-51页 |
| 1 材料与方法 | 第44-45页 |
| ·数据资料 | 第44-45页 |
| ·方法 | 第45页 |
| 2 结果与分析 | 第45-50页 |
| ·蛋白序列比对结果 | 第45页 |
| ·进化踪迹分析结果 | 第45-50页 |
| 3 讨论 | 第50-51页 |
| 第三节 TIME-EA4/TIME-likes, Cu/Zn SOD 和酯酶系统发生学分析 | 第51-59页 |
| 1 材料与方法 | 第51-53页 |
| ·数据资料 | 第51-53页 |
| ·方法 | 第53页 |
| 2 结果与分析 | 第53-58页 |
| ·MOTIFS 分析结果 | 第53-55页 |
| ·序列特征位点比较 | 第55-56页 |
| ·聚类分析 | 第56-58页 |
| 3 结论 | 第58-59页 |
| 第四节 本章结论 | 第59-62页 |
| 第三章 家蚕昼夜节律生物钟相关基因的克隆、进化和反馈环路整合 | 第62-108页 |
| 第一节 家蚕Bmcry1 和Bmcry2 的基因克隆、全基因结构分析及染色体定位 | 第62-75页 |
| 1 材料与方法 | 第62-66页 |
| ·材料 | 第62-64页 |
| ·生物信息学分析工具 | 第64页 |
| ·方法 | 第64-66页 |
| 2 结果与分析 | 第66-74页 |
| ·家蚕Bmcry1 和Bmcry2 基因全长cDNA 克隆 | 第66-70页 |
| ·家蚕Bmcry1 和Bmcry2 的全基因结构及染色体定位 | 第70-73页 |
| ·家蚕Bmcry1 和Bmcry2 基因和蛋白在NCBI 登录 | 第73-74页 |
| 3 讨论 | 第74-75页 |
| 第二节 家蚕BmCRY1 和BmCRY2 蛋白的序列分析、空间建模及表面电荷分布 | 第75-81页 |
| 1 方法 | 第75-76页 |
| ·数据资料 | 第75页 |
| ·蛋白序列分析 | 第75页 |
| ·蛋白质的同源建模及表面电荷分析 | 第75-76页 |
| 2 结果与分析 | 第76-80页 |
| ·家蚕BmCRY1 和BmCRY2 蛋白序列分析 | 第76-77页 |
| ·家蚕BmCRY1 和BmCRY2 蛋白空间结构预测 | 第77-80页 |
| 3 讨论 | 第80-81页 |
| 第三节 昆虫CRY 蛋白的分子进化分析 | 第81-88页 |
| 1 材料与方法 | 第81-82页 |
| ·数据资料 | 第81-82页 |
| ·蛋白序列分析 | 第82页 |
| ·分子系统进化分析 | 第82页 |
| 2 结果与分析 | 第82-87页 |
| ·昆虫CRY 蛋白序列的同源性 | 第82-83页 |
| ·昆虫CRY 蛋白序列的特征分析 | 第83-84页 |
| ·昆虫CRY 蛋白序列的功能域保守性 | 第84-85页 |
| ·家蚕BmCRY1 和BmCRY2 的分子系统进化 | 第85-87页 |
| 3 讨论 | 第87-88页 |
| 第四节 家蚕昼夜节律相关基因的克隆、基因结构和芯片表达谱分析 | 第88-94页 |
| 1 材料与方法 | 第88-89页 |
| ·数据资料 | 第88-89页 |
| ·序列和染色体定位分析 | 第89页 |
| ·芯片表达谱分析 | 第89页 |
| 2 结果与分析 | 第89-93页 |
| ·确定和克隆家蚕中可能存在的昼夜节律生物钟基因 | 第89-90页 |
| ·芯片检测表达谱分析 | 第90页 |
| ·染色体定位和基因结构分析 | 第90-93页 |
| 3 讨论 | 第93-94页 |
| 第五节 家蚕昼夜节律生物钟基因进化分析和基因反馈环路初步整合 | 第94-105页 |
| 1 材料与方法 | 第94-97页 |
| ·数据资料 | 第94-96页 |
| ·蛋白序列分析 | 第96页 |
| ·分子系统进化分析 | 第96-97页 |
| 2 结果与分析 | 第97-103页 |
| ·家蚕昼夜节律生物钟蛋白的功能域及基序位点 | 第97-99页 |
| ·系统发生关系 | 第99-102页 |
| ·家蚕昼夜节律生物钟基因网络的初步整合 | 第102-103页 |
| 3 讨论 | 第103-105页 |
| 第六节 本章结论 | 第105-108页 |
| 1 家蚕具有两类昼夜节律核心钟基因Bmcry1 与Bmcry2 | 第105-106页 |
| 2 家蚕昼夜节律生物钟基因的挖掘与反馈环路的初步整合 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-122页 |
| 研究生期间发表文章 | 第122-123页 |
| 研究生期间登录的基因 | 第123-124页 |
| 论文资助项目 | 第124-125页 |
| 附录 | 第125-136页 |
| 致谢 | 第136-137页 |
