| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 1 引言 | 第11-17页 |
| ·整合文本挖掘研究背景 | 第11-13页 |
| ·海量文本数据积累 | 第11页 |
| ·中医药生物信息学 | 第11-12页 |
| ·解决生物学问题的新方法:文本挖掘 | 第12-13页 |
| ·中医药文献和Medline文本挖掘概述 | 第13-15页 |
| ·中医药文献知识发现 | 第13页 |
| ·Medline文献数据库 | 第13-14页 |
| ·整合文本挖掘的提出 | 第14-15页 |
| ·本文的主要贡献 | 第15页 |
| ·本文的组织 | 第15-17页 |
| 2 文本挖掘相关研究 | 第17-28页 |
| ·文本挖掘综述 | 第17-20页 |
| ·文本挖掘的定义 | 第17-18页 |
| ·文本挖掘的过程 | 第18-19页 |
| ·文本挖掘的应用领域 | 第19-20页 |
| ·信息抽取综述 | 第20-23页 |
| ·信息抽取相关概念 | 第21页 |
| ·信息抽取技术的处理对象 | 第21-22页 |
| ·常见信息抽取方法 | 第22-23页 |
| ·信息抽取评价指标 | 第23页 |
| ·生物医学文献挖掘综述 | 第23-28页 |
| ·生物医学文献挖掘背景 | 第23-24页 |
| ·命名实体识别概述 | 第24-25页 |
| ·生物医学实体名称识别 | 第25-28页 |
| 3 复杂网络分析综述 | 第28-35页 |
| ·复杂网络分析相关概念 | 第28-30页 |
| ·网络的分类与定义 | 第28-29页 |
| ·复杂网络的统计特征 | 第29-30页 |
| ·复杂网络分析方法 | 第30-34页 |
| ·计算节点度分布 | 第30-31页 |
| ·计算聚类系数 | 第31页 |
| ·计算平均路径长度 | 第31-32页 |
| ·根据连接数估算边的介数和介数分布 | 第32-34页 |
| ·相关Open Source系统 | 第34-35页 |
| 4 基于Bootstrapping的基因名称抽取 | 第35-46页 |
| ·Bubble-bootstrapping技术 | 第36-42页 |
| ·Bootstrapping技术 | 第36-37页 |
| ·模式定义 | 第37-38页 |
| ·Bubble-bootstrapping算法 | 第38-42页 |
| ·基因名称抽取 | 第42-46页 |
| ·基因名称命名规则 | 第42-43页 |
| ·Bubble-bootstrapping算法改进 | 第43-44页 |
| ·实验结果和分析 | 第44-46页 |
| 5 中医证与分子生物学知识的关联分析系统的设计与实现 | 第46-72页 |
| ·系统实现技术 | 第46-48页 |
| ·RCP技术 | 第46-48页 |
| ·JUNG图形包 | 第48页 |
| ·中医证与分子生物学知识的关联分析系统 | 第48-64页 |
| ·系统总体框架 | 第49-51页 |
| ·文献下载模块 | 第51-52页 |
| ·基于Bubble-bootstrapping技术的术语识别模块 | 第52-53页 |
| ·关系建立模块 | 第53-56页 |
| ·可视化界面与分析模块 | 第56-64页 |
| ·实验分析 | 第64-72页 |
| ·关系数据分析 | 第64-66页 |
| ·功能基因网络 | 第66-69页 |
| ·基因在证候上分布的相似性分析 | 第69-72页 |
| 6 结论 | 第72-74页 |
| ·总结与结论 | 第72-73页 |
| ·未来工作 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-78页 |
| 作者简历 | 第78-80页 |
| 学位论文数据集 | 第80页 |
