| 中文摘要 | 第1-8页 |
| 英文摘要 | 第8-10页 |
| 本研究中的缩略语 | 第10-11页 |
| 前言 | 第11-31页 |
| 1. 鼠疫的危害 | 第11页 |
| 2. 鼠疫耶尔森氏菌致病机制研究现状 | 第11-19页 |
| ·鼠疫菌的传播和致病过程 | 第12-13页 |
| ·鼠疫菌分子致病机制的研究 | 第13-16页 |
| ·鼠疫菌的细胞致病机制 | 第16-19页 |
| ·鼠疫菌的组织和器官致病机制 | 第19页 |
| 3. 鼠疫的病理学研究 | 第19-21页 |
| ·鼠疫的临床病理 | 第19-20页 |
| ·呼吸道诱导鼠疫的早期实验病理学研究 | 第20-21页 |
| 4. 病原菌转录组学研究现状 | 第21-23页 |
| 5. 病原菌和宿主相互作用的转录组学研究现状 | 第23-24页 |
| 6. 本研究的目的意义与立题依据 | 第24-27页 |
| 参考文献 | 第27-31页 |
| 第一章 病理学研究 | 第31-52页 |
| 1. 前言 | 第31-32页 |
| 2. 材料与方法 | 第32-35页 |
| ·实验菌株和实验动物 | 第32页 |
| ·主要试剂和实验设备 | 第32页 |
| ·菌液制备和动物感染 | 第32-33页 |
| ·鼠疫菌体内载量实验 | 第33页 |
| ·病理学观察 | 第33-35页 |
| 3. 结果 | 第35-43页 |
| ·BALB/C小鼠鼻内感染鼠疫菌的存活率 | 第35页 |
| ·感染后小鼠不同组织内鼠疫菌 CFU数量的动力学变化 | 第35-36页 |
| ·鼠疫菌攻击后小鼠病理学变化的动力学过程 | 第36-43页 |
| ·鼠疫菌重要毒力相关蛋白的检测 | 第43页 |
| 4. 讨论 | 第43-49页 |
| ·鼠疫菌鼻内感染动物模型的建立与鼠疫的发生 | 第43-44页 |
| ·原发性肺鼠疫的发生与发展过程 | 第44-46页 |
| ·肺组织PMN数量与肺鼠疫的分期 | 第46-47页 |
| ·宿主体内鼠疫菌超微结构的改变 | 第47-48页 |
| ·鼠疫菌感染与宿主免疫系统的损伤 | 第48-49页 |
| ·鼠疫菌5种毒力相关蛋白的体内表达 | 第49页 |
| 5. 小结 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-52页 |
| 第二章 鼠疫菌重要基因的体内转录谱研究 | 第52-81页 |
| 1. 前言 | 第52-53页 |
| 2. 材料和方法 | 第53-57页 |
| ·实验菌株和实验动物 | 第53页 |
| ·主要试剂和实验设备 | 第53-54页 |
| ·菌液制备和动物感染 | 第54页 |
| ·鼠疫菌的体内转录谱实验 | 第54-57页 |
| 3. 结果与讨论 | 第57-76页 |
| ·感染不同时期不同组织内鼠疫菌待研究基因相对体外的转录差异表达 | 第58-60页 |
| ·一些重要基因转录水平的动力学变化 | 第60-76页 |
| 4. 小结 | 第76-79页 |
| 参考文献 | 第79-81页 |
| 第三章 宿主转录组学研究 | 第81-103页 |
| 1. 前言 | 第81-82页 |
| 2. 材料和方法 | 第82-90页 |
| ·实验菌株和实验动物 | 第82页 |
| ·主要试剂和实验设备 | 第82-83页 |
| ·主要实验用溶液的配制 | 第83-84页 |
| ·菌液制备和动物感染 | 第84页 |
| ·感染小鼠的转录谱实验 | 第84-90页 |
| 3. 结果与讨论 | 第90-99页 |
| ·感染早期和晚期宿主的基因表达概述 | 第90-91页 |
| ·感染早期小鼠基因的差异表达分析 | 第91-92页 |
| ·感染晚期小鼠基因的差异表达分析 | 第92-94页 |
| ·细胞因子的转录调节分析 | 第94-99页 |
| 4. 小结 | 第99-101页 |
| 参考文献 | 第101-103页 |
| 第四章 鼠疫菌和宿主相互作用的分析 | 第103-119页 |
| 1. 前言 | 第103-104页 |
| 2. 病理学、鼠疫菌和宿主转录谱数据的初步分析 | 第104-111页 |
| ·鼠疫菌感染的病理学分期:早期、中期和晚期 | 第104页 |
| ·感染鼠疫菌小鼠的病理学变化 | 第104-105页 |
| ·感染过程中鼠疫菌形态学的改变 | 第105页 |
| ·肺组织内5种毒力相关蛋白的表达 | 第105页 |
| ·鼠疫菌的体内基因表达具有组织特异性和时间特异性 | 第105页 |
| ·鼠疫菌基因的体内转录动力学变化与病理学分期具有相关性 | 第105-106页 |
| ·感染的病理学状态与肺脏内鼠疫菌的基因表达模式 | 第106页 |
| ·肺内鼠疫菌重要毒力基因的持续高表达 | 第106-107页 |
| ·鼠疫菌抗宿主内环境压力基因的转录调节 | 第107-108页 |
| ·宿主的天然防御反应与鼠疫菌的铁摄入调控机制 | 第108-109页 |
| ·整体调控机制 | 第109页 |
| ·转录因子的调控 | 第109-110页 |
| ·感染早期和晚期小鼠的基因表达模式 | 第110页 |
| ·细胞因子的转录调节 | 第110-111页 |
| 3. 鼠疫菌和宿主相互作用的初步分析 | 第111-117页 |
| 参考文献 | 第117-119页 |
| 附表 1 | 第119-120页 |
| 附表 2 | 第120-124页 |
| 综述 | 第124-141页 |
| 致谢 | 第141-142页 |
| 攻读博士学位期间发表的文章 | 第142页 |
