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鸡传染性法氏囊病病毒VP3及3-UTR对病毒复制的影响

摘要第1-8页
Abstract第8-14页
第一章 绪论第14-28页
   ·IBD及IBDV研究概况第14-20页
     ·IBDV的形态结构第15页
     ·IBDV的基因组第15-16页
     ·IBDV的编码蛋白第16-19页
     ·IBDV un-translated region第19-20页
   ·Real-time RT-PCR第20-22页
     ·目前我国IBD的流行情况第20页
     ·诊断方法第20-21页
     ·Real-time RT-PCR第21-22页
     ·Real-time RT-PCR在IBDV检测中的应用第22页
   ·Reverse-genetic system第22-27页
     ·IBDV reverse-genetic system第22-24页
     ·利用Reverse-genetic system研究IBDV嗜性、毒力及标记疫苗第24-26页
     ·利用Reverse-genetic system研究IBDV的复制第26-27页
   ·本研究的目的和意义第27-28页
第二章 鸡传染性法氏囊病病毒Real-time RT-PCR检测方法的建立与应用第28-38页
   ·材料与方法第28-32页
     ·主要仪器第28-29页
     ·主要试剂第29页
     ·病毒、细胞和质粒第29页
     ·引物和探针第29-30页
     ·病毒RNA的提取和cDNA合成第30页
     ·阳性质粒标准品的制备第30页
     ·常规PCR第30页
     ·Real-time RT-PCR反应条件的建立与优化第30-31页
     ·特异性试验第31页
     ·敏感性试验第31页
     ·重复性试验第31页
     ·比较分析IBDV在CEF和DF-1 细胞上的复制特性第31-32页
   ·结果第32-36页
     ·PCR退火温度的确定第32页
     ·Real-time RT-PCR反应条件的确定及标准曲线的建立第32-34页
     ·Real-time RT-PCR的特异性第34页
     ·Real-time RT-PCR的敏感性第34-35页
     ·Real-time RT-PCR的重复性第35页
     ·IBDV Gt株在DF-1 细胞上引起的CPE第35页
     ·IBDV Gt株在CEF和DF-1 细胞上的复制特性第35-36页
   ·讨论第36-38页
第三章 鸡传染性法氏囊病病毒VP3蛋白990位氨基酸影响病毒的复制第38-54页
   ·材料与方法第39-46页
     ·主要仪器第39页
     ·主要试剂第39页
     ·病毒、细胞和质粒第39页
     ·SPF鸡第39页
     ·引物的设计与合成第39-40页
     ·双酶切介导的区段替换第40-41页
     ·Site-directed mutagenesis介导的氨基酸突变第41-42页
     ·嵌合及突变株A节段核酶结构的引入第42-43页
     ·嵌合及突变株A节段真核表达载体的构建第43页
     ·病毒拯救第43-44页
     ·拯救病毒RT-PCR及测序鉴定第44页
     ·拯救病毒间接免疫荧光鉴定第44-45页
     ·拯救病毒体外复制动力学试验第45页
     ·拯救病毒体内复制动力学试验第45页
     ·拯救病毒毒力测定第45-46页
     ·试验鸡法氏囊RT-PCR与序列测定第46页
     ·VP3 C端氨基酸的比对第46页
     ·VP3 蛋白无序性的预测第46页
   ·结果第46-52页
     ·真核表达载体的构建第46-47页
     ·病毒的拯救第47-48页
     ·拯救病毒RT-PCR及序列测定第48页
     ·拯救病毒的间接免疫荧光第48页
     ·拯救病毒的体外复制动力学第48-49页
     ·拯救病毒的体内复制动力学第49-50页
     ·试验鸡的症状与剖检变化第50-51页
     ·试验鸡法氏囊的RT-PCR与序列测定第51页
     ·VP3 C端氨基酸序列比对分析第51页
     ·VP3 蛋白的无序性第51-52页
   ·讨论第52-54页
第四章 鸡传染性法氏囊病病毒基因组A节段3’-UTR影响病毒的复制第54-64页
   ·材料与方法第54-57页
     ·主要仪器第54页
     ·主要试剂第54-55页
     ·病毒、细胞与质粒第55页
     ·SPF鸡第55页
     ·引物的设计与合成第55页
     ·融合PCR介导的Gx株3’-UTR替换Gt株相应区域第55-56页
     ·嵌合株A节段真核表达载体的构建第56页
     ·嵌合病毒的拯救第56页
     ·拯救病毒RT-PCR与测序鉴定第56页
     ·拯救病毒间接免疫荧光鉴定第56页
     ·拯救病毒体外复制动力学试验第56-57页
     ·拯救病毒体内复制动力学试验第57页
     ·试验鸡法氏囊RT-PCR与测序鉴定第57页
     ·3’-UTR二级结构预测第57页
   ·结果第57-62页
     ·真核表达载体的构建第57-58页
     ·病毒的拯救第58页
     ·拯救病毒RT-PCR及序列测定第58页
     ·拯救病毒的间接免疫荧光第58-59页
     ·拯救病毒的体外复制动力学第59-60页
     ·拯救病毒的体内复制动力学第60页
     ·试验鸡法氏囊的RT-PCR及序列测定第60页
     ·3’-UTR的二级结构第60-62页
   ·讨论第62-64页
第五章 结论第64-65页
参考文献第65-77页
致谢第77-78页
作者简介第78页

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