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沙蜥属蜥蜴珠蛋白家族高原低氧适应机制的研究

中文摘要第3-6页
Abstract第6-8页
第一章 哺乳动物和鸟类的高原低氧适应研究进展第13-23页
    1.1 呼吸系统的低氧适应特征第13-14页
        1.1.1 低氧诱导的呼吸反应(HVR)第13-14页
        1.1.2 肺结构重塑第14页
    1.2 血液循环系统的低氧适应特征第14-18页
        1.2.1 心脏结构重塑和血液学特征第15-16页
        1.2.2 血氧亲和力第16-18页
    1.3 组织氧运输有关的globin家族成员第18-21页
        1.3.1 横纹肌供氧蛋白Myoglobin第18-19页
        1.3.2 神经元特异性表达蛋白Neuroglobin第19页
        1.3.3 组织蛋白Cytoglobin第19-20页
        1.3.4 眼部特异性表达蛋白Glogbin E第20页
        1.3.5 膜蛋白Globin X第20页
        1.3.6 发育调节蛋白GlobinY和嵌合蛋白Androglobin第20-21页
    1.4 组织氧利用的低氧适应特征第21-23页
第二章 沙蜥属蜥蜴低氧适应研究进展第23-27页
    2.1 沙蜥属蜥蜴简介第23-24页
    2.2 沙蜥属蜥蜴的高原适应性特征第24-27页
        2.2.1 沙蜥属蜥蜴适应高原的肺结构特征第24页
        2.2.2 沙蜥属蜥蜴适应高原的血液学特征第24-25页
        2.2.3 沙蜥属蜥蜴适应高原的组织氧运输特征第25-26页
        2.2.4 沙蜥属蜥蜴适应高原的代谢特征第26-27页
第三章 Globin家族成员的鉴定、表达模式及其高原适应特征第27-58页
    3.1 引言第27-28页
    3.2 材料和方法第28-31页
        3.2.1 基因组序列和转录组序列下载第28-29页
        3.2.2 样品采集和RNA提取第29页
        3.2.3 转录组数据质量控制和组装第29-30页
        3.2.4 Globin基因鉴定、基因结构和表达量第30页
        3.2.5 分子进化分析第30-31页
        3.2.6 Globin分子同源建模第31页
    3.3 结果第31-53页
        3.3.1 有鳞类动物的globin基因家族成员的鉴定和保守同线性分析第31-33页
        3.3.2 Neuroglobin第33-39页
        3.3.3 Cytoglobin第39-46页
        3.3.4 Myoglobin第46-49页
        3.3.5 Globin X第49-51页
        3.3.6 Androglobin第51-53页
        3.3.7 Globin Y第53页
    3.4 讨论第53-58页
        3.4.1 蜥蜴类动物GbY和GbX的选择性沉默第53-54页
        3.4.2 蜥蜴类动物globin基因的特异性表达模式第54-55页
        3.4.3 沙蜥属蜥蜴Mb的高原适应特征第55-56页
        3.4.4 沙蜥属蜥蜴globin新成员的高原适应特征第56-58页
第四章 沙蜥属蜥蜴呼吸和血液循环系统的高原适应特征第58-82页
    4.1 引言第58页
    4.2 实验材料与方法第58-63页
        4.2.1 实验动物采集第58-59页
        4.2.2 动脉血气测定和变构因子ATP浓度第59页
        4.2.3 心率和呼吸的低氧反应第59页
        4.2.4 血红蛋白基因的鉴定、表达量分析和分子进化分析第59-60页
        4.2.5 血红蛋白亚基鉴定和相对定量第60页
        4.2.6 血红蛋白同源建模(Homology modeling)第60页
        4.2.7 分子动力计算第60-63页
    4.3 数据分析第63页
    4.4 结果第63-78页
        4.4.1 低海拔驯化后红尾沙蜥的呼吸频率和心率第63-65页
        4.4.2 红尾沙蜥和荒漠沙蜥的动脉血气和ATP的浓度第65-66页
        4.4.3 血红蛋白基因的鉴定第66-68页
        4.4.4 沙蜥血红蛋白基因的分子进化分析第68-71页
        4.4.5 血红蛋白基因的mRNA表达量和蛋白定量第71-73页
        4.4.6 Hb四聚体模型结构稳定性第73-75页
        4.4.7 Hb亚基间的相互作用第75页
        4.4.8 氨基酸突变对Hb结构的影响第75-78页
    4.5 讨论第78-82页
        4.5.1 沙蜥属蜥蜴钝化的HVR第78-79页
        4.5.2 红尾沙蜥高效的呼吸效率第79页
        4.5.3 红尾沙蜥血液的氧气亲和力第79-82页
第五章 四足类动物 α 基因家族的进化关系第82-100页
    5.1 引言第82-83页
    5.2 材料与方法第83-85页
        5.2.1 基因组和转录组序列的获取第83-84页
        5.2.2 系统发生关系推断第84-85页
        5.2.3 基因结构和分子进化分析第85页
    5.3 结果与讨论第85-100页
        5.3.1 爬行动物多样化的 α 基因簇第85-88页
        5.3.2 αD基因起源于 αA基因的串联复制第88-92页
        5.3.3 αD的基因转换与功能进化第92-100页
第六章 结论和创新第100-102页
    6.1 主要结论第100-101页
    6.2 创新点第101-102页
参考文献第102-116页
在学期间的研究成果第116-118页
致谢第118-119页
附录第119-129页

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