| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-14页 |
| 缩略语(Abbreviation) | 第14-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-32页 |
| 1 鸡肉品质国内外研究现状 | 第15-18页 |
| ·影响肌肉嫩度的因素 | 第16-17页 |
| ·遗传因素 | 第16页 |
| ·饲养方式 | 第16-17页 |
| ·营养状况 | 第17页 |
| ·宰后尸僵过程 | 第17页 |
| ·影响鸡肉嫩度性状的主要候选基因 | 第17-18页 |
| 2 钙蛋白酶大亚基（CAPN1）基因的研究进展 | 第18-21页 |
| ·钙蛋白酶概述 | 第18页 |
| ·CAPN1 基因结构 | 第18-19页 |
| ·CAPN1 的作用机理 | 第19-20页 |
| ·CAPN1 基因及其单核苷酸多态研究进展 | 第20-21页 |
| 3 遗传标记辅助选择 | 第21-26页 |
| ·遗传标记 | 第21-22页 |
| ·单核苷酸多态性 | 第22-26页 |
| ·SNPs 的检测方法 | 第23-24页 |
| ·SNPs 在鸡遗传变异分析中的应用 | 第24-26页 |
| 4 实时荧光定量PCR 分析技术 | 第26-30页 |
| ·实时荧光定量PCR 的原理 | 第27-28页 |
| ·实时荧光定量PCR 的定量方法 | 第28页 |
| ·荧光定量PCR 技术的应用 | 第28-30页 |
| 5 清远麻鸡品种简介 | 第30页 |
| 6 本研究的目的和意义 | 第30-32页 |
| 第二章 鸡 CAPN1 基因的单核苷酸多态性及其与肉质性状的关联分析 | 第32-50页 |
| 1 试验材料 | 第32-33页 |
| ·实验动物及采样方法 | 第32页 |
| ·主要仪器设备 | 第32-33页 |
| ·主要化学试剂 | 第33页 |
| 2 试验方法 | 第33-38页 |
| ·基因组DNA 提取 | 第33-35页 |
| ·DNA 提取所用试剂 | 第33-34页 |
| ·清远麻鸡和隐性白羽鸡血样DNA 提取及检测 | 第34-35页 |
| ·PCR 扩增 | 第35-36页 |
| ·引物设计 | 第35页 |
| ·PCR 扩增体系 | 第35-36页 |
| ·PCR 扩增产物检测 | 第36页 |
| ·PCR-SSCP 分析 | 第36-37页 |
| ·12%聚丙烯酰胺凝胶制备 | 第36页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第36-37页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶银染（硝酸银染色） | 第37页 |
| ·带型判定 | 第37页 |
| ·PCR 扩增产物测序 | 第37-38页 |
| 3 相关软件及统计方法 | 第38页 |
| ·相关软件 | 第38页 |
| ·统计方法 | 第38页 |
| ·基因频率、基因型频率在各群体中分布的差异检验 | 第38页 |
| ·关联分析 | 第38页 |
| 4 结果与分析 | 第38-44页 |
| ·两个鸡品种肉质指标测定 | 第38-39页 |
| ·CAPN1 基因三对引物的SNP 筛查结果 | 第39-41页 |
| ·CAPN1 基因3 个多态位点遗传分析结果 | 第41-44页 |
| ·外显子5 多态位点的遗传分析 | 第41-42页 |
| ·3′调控区多态位点的遗传分析 | 第42-43页 |
| ·外显子6 多态位点的遗传分析 | 第43-44页 |
| ·各多态位点基因型在两个鸡品种间的分布检测 | 第44页 |
| 5 CAPN1 基因与12 周龄鸡肌肉嫩度等指标的关联分析 | 第44-47页 |
| ·外显子5 多态位点与12 周龄鸡肌肉嫩度指标的关联分析 | 第44-45页 |
| ·3′调控区多态位点与12 周龄鸡肌肉嫩度指标的关联分析 | 第45-46页 |
| ·外显子6 多态位点与12 周龄鸡肌肉嫩度指标的关联分析 | 第46-47页 |
| 6 讨论 | 第47-50页 |
| ·两个鸡品种肉质性状比较 | 第47-48页 |
| ·鸡CAPN1 基因单核苷酸多态性 | 第48页 |
| ·鸡CAPN1 基因4 个多态位点遗传分析结果 | 第48-49页 |
| ·鸡CAPN1 基因各SNPs 位点与肉质性状的关系 | 第49-50页 |
| 第三章 CAPN1 基因在鸡不同生长阶段表达规律研究 | 第50-65页 |
| 1 试验材料 | 第50-51页 |
| ·试验动物 | 第50页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第50-51页 |
| 2 试验方法 | 第51-55页 |
| ·鸡组织RNA 的提取 | 第51-52页 |
| ·提取RNA 的准备工作 | 第51页 |
| ·Trizol 法提取组织总RNA | 第51页 |
| ·RNA 的检测 | 第51-52页 |
| ·cDNA 第一链合成 | 第52页 |
| ·聚合酶链式反应(PCR)反应 | 第52-54页 |
| ·引物的选择和退火温度(Tm)的确定 | 第52-53页 |
| ·目的基因片段的扩增 | 第53-54页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳 | 第54页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第54-55页 |
| 3 结果与分析 | 第55-63页 |
| ·组织总RNA 的提取 | 第55页 |
| ·目的基因与内参基因的标准曲线及溶解曲线 | 第55-58页 |
| ·不同生长阶段CAPN1 基因表达的变化规律 | 第58-63页 |
| ·两个鸡品种在胸肌中的表达变化规律 | 第58-60页 |
| ·两个鸡品种在腓肠肌中的表达变化规律 | 第60-62页 |
| ·不同组织中的变化规律比较 | 第62-63页 |
| 4 讨论 | 第63-65页 |
| ·CAPN1 基因的表达 | 第63-65页 |
| 第四章 全文结论 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第72页 |
