| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 缩略词 | 第12-14页 |
| 第1章 文献综述 | 第14-23页 |
| ·猪链球菌病 | 第14-18页 |
| ·病原 | 第14-15页 |
| ·流行病学 | 第15-16页 |
| ·临床症状 | 第16页 |
| ·猪链球菌的检测 | 第16-17页 |
| ·毒力因子的研究 | 第17-18页 |
| ·致病机理 | 第18页 |
| ·基因芯片技术及其应用 | 第18-23页 |
| ·生物芯片技术原理 | 第18-19页 |
| ·生物芯片的特点 | 第19页 |
| ·生物芯片的分类 | 第19-20页 |
| ·基因芯片的制备 | 第20页 |
| ·基因芯片的应用 | 第20-21页 |
| ·Affymetrix基因芯片的设计与制备 | 第21-23页 |
| 第2章 猪链球菌2型感染THP-1细胞的转录谱学研究 | 第23-49页 |
| ·研究目的 | 第23页 |
| ·材料与方法 | 第23-34页 |
| ·菌株 | 第23页 |
| ·细胞株 | 第23页 |
| ·基因芯片 | 第23页 |
| ·主要生化试剂 | 第23-24页 |
| ·主要试剂的配制 | 第24页 |
| ·THP-1细胞的复苏及培养 | 第24-25页 |
| ·链球菌的培养 | 第25页 |
| ·THP-1细胞感染猪链球菌2型的实验 | 第25页 |
| ·细胞总RNA的提取 | 第25页 |
| ·总RNA质量检测 | 第25-26页 |
| ·纯化总RNA | 第26-27页 |
| ·纯化总RNA的定量和检测 | 第27页 |
| ·cDNA的合成和纯化 | 第27-29页 |
| ·cRNA的合成和纯化 | 第29-30页 |
| ·cRNA片段化、配制杂交液 | 第30页 |
| ·基因芯片杂交、洗片、扫描 | 第30-31页 |
| ·数据分析 | 第31-32页 |
| ·实时荧光定量PCR对基因芯片结果进行验证 | 第32-34页 |
| ·结果和分析 | 第34-41页 |
| ·RNA质量检测 | 第34页 |
| ·基因芯片杂交图 | 第34-35页 |
| ·筛选THP-1细胞感染猪链球菌2型后的差异表达基因 | 第35-36页 |
| ·实时荧光定量PCR验证 | 第36-37页 |
| ·差异表达基因的通路分析 | 第37-38页 |
| ·差异表达基因的分类分析 | 第38-39页 |
| ·分析差异表达基因之间的关系 | 第39-41页 |
| ·讨论 | 第41-47页 |
| ·关于免疫反应相关差异表达基因的分析 | 第42-45页 |
| ·与泛素蛋白酶体系统相关的差异表达基因的分析 | 第45-46页 |
| ·与凋亡过程相关的差异表达基因的分析 | 第46-47页 |
| ·其他基因 | 第47页 |
| ·小结 | 第47-49页 |
| 第3章 猪链球菌2型感染宿主猪的转录谱学研究 | 第49-78页 |
| ·研究目的 | 第49页 |
| ·材料与方法 | 第49-53页 |
| ·菌株 | 第49页 |
| ·实验动物 | 第49页 |
| ·基因芯片 | 第49页 |
| ·主要生化试剂 | 第49页 |
| ·链球菌的培养 | 第49-50页 |
| ·样品收集 | 第50页 |
| ·细菌计数 | 第50-51页 |
| ·总RNA的提取和纯化 | 第51页 |
| ·cDNA的合成和纯化 | 第51页 |
| ·cRNA的合成和纯化 | 第51页 |
| ·cRNA片段化、配制杂交液 | 第51页 |
| ·基因芯片杂交、洗片、扫描同第2章 | 第51页 |
| ·数据分析 | 第51-52页 |
| ·实时荧光定量PCR对芯片结果进行验证 | 第52-53页 |
| ·结果和分析 | 第53-74页 |
| ·样品RNA质量检测 | 第53-54页 |
| ·芯片杂交质量的评估 | 第54-56页 |
| ·筛选感染猪链球菌2型后组织的差异表达基因 | 第56-58页 |
| ·实时荧光定量PCR验证 | 第58-59页 |
| ·差异表达基因的分类分析 | 第59-61页 |
| ·与免疫反应相关的基因 | 第61-70页 |
| ·与细胞粘附(cell adhesion)和血管发生(Angiogenesis)相关的基因 | 第70-71页 |
| ·感染SS2的猪3种组织(肺和脑组织以及PBMC)中都有显著性差异表达变化的基因 | 第71-74页 |
| ·讨论 | 第74-78页 |
| ·感染SS2的猪3种组织(肺和脑组织以及PBMC)中都有显著性差异表达变化的基因 | 第74-75页 |
| ·感染SS2的猪的单核淋巴细胞PBMC中有显著性差异表达变化的基因 | 第75-76页 |
| ·感染SS2的猪的脑组织中有差异表达的基因 | 第76-77页 |
| ·感染SS2的猪的肺组织中有差异表达的基因 | 第77-78页 |
| 结论 | 第78-80页 |
| 参考文献 | 第80-99页 |
| 附录 | 第99-100页 |
| 发表论文 | 第100-101页 |
| 致谢 | 第101-102页 |
| 附表 | 第102-176页 |
