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ASK10基因突变及敲除增强酿酒酵母木糖异构酶酶活机制的研究

摘要第6-9页
ABSTRACT第9-11页
缩略词表第12-13页
第一章 研究背景第13-22页
    1.1. 木质纤维素燃料乙醇第13页
    1.2. 酿酒酵母木糖代谢重组菌株的构建第13-15页
        1.2.1 木糖还原酶-木酮糖脱氢酶途径(XR-XDH途径)第14-15页
        1.2.2 木糖异构酶途径(XI途径)第15页
    1.3. 木糖代谢重组菌株的进化第15-18页
        1.3.1 木糖代谢酿酒酵母菌株理性设计第16-17页
        1.3.2 木糖代谢酿酒酵母菌株非理性的驯化第17-18页
    1.4. 课题组前期工作第18-20页
    1.5. 酿酒酵母菌株ASK10参与的细胞调控第20-21页
        1.5.1 ASK10基因参与细胞渗透压调节第20页
        1.5.2 ASK10基因参与细胞氧化还原压力第20-21页
        1.5.3 ASK10基因参与细胞热激相应第21页
        1.5.4 Ask10p作为RNA聚合酶Ⅱ全酶的组成成分第21页
    1.6. 本论文的主要研究内容第21-22页
第二章 实验材料与研究方法第22-42页
    2.1. 实验室仪器与耗材第22页
    2.2. 质粒与菌株第22-26页
    2.3. 引物第26-30页
    2.4. 实验技术与方法第30-42页
        2.4.1. DNA扩增纯化和测序第30页
        2.4.2. Gibson Assembly第30-31页
        2.4.3. 大肠杆菌转化第31页
        2.4.4. 大肠杆菌质粒提取第31-32页
        2.4.5. 酵母转化第32页
        2.4.6. 酵母质粒提取第32-33页
        2.4.7. 酵母染色体提取第33页
        2.4.8. 基因敲除第33-34页
        2.4.9. 基因原位突变第34-35页
        2.4.10. 酵母总RNA的提取第35-36页
        2.4.11. RNA反转录和荧光定量PCR第36页
        2.4.12. 点滴平板实验第36-37页
        2.4.13. XR-XDH酶活测定第37页
        2.4.14. XI的酶活测定第37-38页
        2.4.15. LacZ的酶活测定第38-39页
        2.4.16. 细胞GFP荧光检测第39页
        2.4.17. SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶电泳第39-40页
        2.4.18. Western-Blot实验第40-41页
        2.4.19. 基因组测序与数据分析第41页
        2.4.20. 转录组检测与数据分析第41-42页
第三章 结果与分析第42-59页
    3.1. 增强酿酒酵母菌株木糖代谢能力的突变基因的筛选第42-45页
        3.1.1. 背景菌株的选择第42页
        3.1.2. 突变基因菌株的构建第42页
        3.1.3. 木糖点滴平板实验第42-45页
    3.2. ASK10~(M475R)原位突变对Ask10p功能完整性的影响第45-47页
    3.3. ASK10基因的敲除及ASK10~(M475R)原位突变提高菌株的木糖生长能力第47-48页
    3.4. ASK10敲除及突变增强菌株木糖代谢能力机制的研究第48-53页
        3.4.1. ask10△及ASK10~(M475R)原位突变菌株中木糖异构酶酶活测定第48-49页
        3.4.2. ask10△及ASK10~(M475R)原位突变菌株中xylA和TEF1基因转录水平测定第49-50页
        3.4.3. ask10△及ASK10~(M475R)原位突变菌株xylA基因拷贝数测定第50页
        3.4.4. ask10△及ASK10~(M475R)原位突变菌株对报告基因LacZ和GFP的影响第50-53页
    3.5. 转录组分析第53-57页
        3.5.1. 测序结果质量评估第53-54页
        3.5.2. 差异基因比对分析第54-57页
    3.6. 分子伴侣HSP26p对菌株木糖代谢的影响第57-59页
        3.6.1. HSP26超表达相关菌株木糖异构酶酶活第57页
        3.6.2. HSP26超表达相关菌株生长实验第57-59页
总结与讨论第59-61页
参考文献第61-65页
致谢第65-66页
附件第66页

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