| 摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 引言 | 第12-24页 |
| 0.1 A型流感病毒概述及抗流感病毒药物的研究进展 | 第12-17页 |
| 0.1.1 A型流感病毒简介 | 第12-13页 |
| 0.1.2 A型流感病毒的结构及其蛋白质的功能 | 第13-15页 |
| 0.1.3 抗流感病毒药物研究进展 | 第15-17页 |
| 0.2 A型流感病毒NS1蛋白简介 | 第17-19页 |
| 0.2.1 NS1蛋白的结构与功能 | 第17-18页 |
| 0.2.2 NS1蛋白与宿主CPSF30相互作用 | 第18-19页 |
| 0.3 计算机辅助药物设计研究进展 | 第19-21页 |
| 0.3.1 计算机辅助药物设计简介 | 第19-20页 |
| 0.3.2 虚拟筛选和分子动力学模拟 | 第20-21页 |
| 0.4 主要的研究内容及意义 | 第21-24页 |
| 第1章 A型流感病毒NS1与宿主CPSF30相互作用模式研究 | 第24-37页 |
| 1.1 前言 | 第24-25页 |
| 1.2 材料与方法 | 第25-28页 |
| 1.2.1 实验材料 | 第25页 |
| 1.2.2 NS1蛋白CPSF30结合位点保守氨基酸残基分析 | 第25-26页 |
| 1.2.3 NS1-CPSF30复合物结构的构建与分析 | 第26页 |
| 1.2.4 分子动力学模拟 | 第26-27页 |
| 1.2.5 MM-PBSA计算 | 第27-28页 |
| 1.3 结果与讨论 | 第28-36页 |
| 1.3.1 NS1效应结构域CPSF30结合位点保守残基 | 第28-29页 |
| 1.3.2 CPSF30F2F3片段与NS1的相互作用 | 第29-30页 |
| 1.3.3 分子动力学模拟研究CPSF30F2F3片段与NS1的相互作用模式 | 第30-32页 |
| 1.3.4 1972 H3N2和2009H1N1NS1ED单体分子动力学模拟 | 第32-33页 |
| 1.3.5 1972 H3N2和2009H1N1NS1ED二聚体分子动力学模拟 | 第33-34页 |
| 1.3.6 1972 H3N2和2009H1N1NS1效应结构域与CPSF30复合体分子动力学模拟 | 第34-35页 |
| 1.3.7 NS1二聚体及NS1-CPSF30结合自由能计算 | 第35-36页 |
| 1.4 小结 | 第36-37页 |
| 第2章 A型流感病毒NS1蛋白抑制剂的虚拟筛选 | 第37-50页 |
| 2.1 前言 | 第37-38页 |
| 2.2 材料与方法 | 第38-40页 |
| 2.2.1 虚拟筛选数据集准备 | 第38页 |
| 2.2.2 虚拟筛选 | 第38-39页 |
| 2.2.3 分子动力学模拟 | 第39页 |
| 2.2.4 MM-PBSA结合自由能计算 | 第39-40页 |
| 2.3 实验结果与讨论 | 第40-49页 |
| 2.3.1 分子对接可行性的验证 | 第40页 |
| 2.3.2 Maybridge和NCI数据库的虚拟筛选 | 第40-42页 |
| 2.3.3 中草药数据库的虚拟筛选 | 第42-45页 |
| 2.3.4 候选化合物与NS1的结合模式 | 第45-48页 |
| 2.3.5 候选抑制剂与NS1相互作用结合自由能计算 | 第48-49页 |
| 2.4 小结 | 第49-50页 |
| 第3章 结论与展望 | 第50-52页 |
| 3.1 结论 | 第50-51页 |
| 3.2 创新点 | 第51-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-60页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文及参加科研情况 | 第60-61页 |
